| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 834,159 | T→C | 5.2% | W279R (TGG→CGG) | PP_0717 → | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 834,159 | 0 | T | C | 5.2% | 229.7 / 2.2 | 76 | W279R (TGG→CGG) | PP_0717 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/41); new base C (2/2); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
CTTGCCGGGGTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGAT > NC_002947/834012‑834307 | cttgcCGGGGTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTg < 8:114101/149‑1 (MQ=255) gcCGGGGTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTgg < 2:351521/147‑1 (MQ=255) ccGGGGTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGt < 3:131855/148‑1 (MQ=255) ccGGGGTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGt < 5:3673/148‑1 (MQ=255) cGGGGTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGt > 7:9275/1‑147 (MQ=255) ggTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGtt < 8:330745/149‑1 (MQ=255) gtTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTgg < 4:80068/139‑1 (MQ=255) gtTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTgg > 3:80068/1‑139 (MQ=255) gtTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGcc < 3:291399/149‑1 (MQ=255) ttGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑t > 6:58525/1‑149 (MQ=255) ttGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑t > 6:52732/1‑149 (MQ=255) ttGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑t > 8:208272/1‑149 (MQ=255) ttGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑t < 6:298100/149‑1 (MQ=255) ggCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑Tga > 5:49319/1‑149 (MQ=255) gATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑Tgacga > 4:364035/1‑149 (MQ=255) gcTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTAGCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGt < 1:3288/149‑1 (MQ=255) gcTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGt < 7:146228/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGTATCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGtt < 3:205759/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGtt < 3:76104/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGtt < 3:210639/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTGTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATc < 8:90292/148‑1 (MQ=255) tAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTg > 5:246556/1‑149 (MQ=255) gcgcTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGc < 5:196286/148‑1 (MQ=255) gcgcTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCt < 6:49319/149‑1 (MQ=255) gcTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTgg < 3:364035/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTggg < 6:246556/149‑1 (MQ=255) aGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTgggg < 3:368451/147‑1 (MQ=255) ttcgttcTCCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCg < 5:58525/147‑1 (MQ=255) ttcgttcACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCg < 5:52732/147‑1 (MQ=255) ttcACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAg < 5:104543/149‑1 (MQ=255) ccTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGGAGGCTCGGCGCCTGTACGAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACa < 8:167915/149‑1 (MQ=255) ccTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCactgtc < 7:208272/149‑6 (MQ=255) gtgGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTg > 4:66500/1‑149 (MQ=255) gATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGt < 1:125119/93‑1 (MQ=255) gATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGt > 2:125119/1‑93 (MQ=255) gTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCA‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTg > 6:195993/1‑149 (MQ=255) ttGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGa > 5:186118/1‑149 (MQ=255) ctgctgTTCGCCCTTTGGGAGGCTCGGCGGCTGTACCAGGCGGGGCCGAGCCGGCAGATCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGTCGACCATGGTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACaa < 4:56260/149‑1 (MQ=255) tgctgTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAg > 4:246215/1‑149 (MQ=255) ctgTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACCGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt > 6:20785/1‑140 (MQ=255) ctgTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACCGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt < 5:20785/140‑1 (MQ=255) ctgTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACCGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt > 6:26094/1‑140 (MQ=255) ctgTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACCGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt < 5:26094/140‑1 (MQ=255) acGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGTGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt < 4:58971/135‑1 (MQ=255) acGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGTGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt > 3:58971/2‑136 (MQ=255) cccTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCg > 7:126331/1‑149 (MQ=255) cccTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCg < 8:126331/149‑1 (MQ=255) ccTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt > 3:246427/1‑132 (MQ=255) ccTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGAtgt < 4:246427/132‑1 (MQ=255) cTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGt < 8:9275/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGt < 3:246215/148‑1 (MQ=255) 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cAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGcggt > 4:89602/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGt < 4:34230/91‑1 (MQ=255) ggTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGt > 3:34230/1‑91 (MQ=255) ccGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTa < 8:39173/149‑1 (MQ=255) gAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTgggg < 6:108751/61‑1 (MQ=255) gAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTgggg > 5:108751/1‑61 (MQ=255) gAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTTTATg > 6:261025/1‑149 (MQ=255) gAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATg > 5:251292/1‑149 (MQ=255) gAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATg > 5:245816/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTCGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGcc > 3:298859/1‑149 (MQ=255) agagCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAgcgc > 8:20371/1‑148 (MQ=255) agagCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAgcgc > 4:366950/1‑148 (MQ=255) cTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTCGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGa < 4:298859/149‑1 (MQ=255) tGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTg > 8:15026/1‑146 (MQ=255) tGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGAt > 7:171793/1‑149 (MQ=255) | CTTGCCGGGGTGTTGGCGATAGCGCTGTGGGTAGCGCTGAGCCTGTTCGTTCACCTGTGGATGTTCTTCTTGTGGGTACTGCTGTTCGCCCTTTGGCAGGCTCGGCGCCTGTACCAGGCGGTGCCGAGCCGGCAGAGCCCGGCGTACTGGGTCAGTTGCC‑TGACGACCATGTTGATCTTGCTGGGGCAGTCGGTGCAGGACAGTGCAGGTGGGCAGGATGTGTACAAGGCATTTGCGGTGCGTATGGCGCTGTTTCTGGCGGTGTCGGTGTATGCCAGCGCCATGTTGATCTGGAT > NC_002947/834012‑834307 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |