| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 923,396 | C→G | 7.3% | V599V (GTG→GTC) | PP_0804 ← | protein secretion ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 923,396 | 0 | C | G | 7.3% | 257.2 / 7.7 | 79 | V599V (GTG→GTC) | PP_0804 | protein secretion ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/38); new base G (2/4); total (37/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.50e-01 | |||||||||||
CTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCC > NC_002947/923249‑923536 | cTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGcca > 4:17774/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGccacca < 8:319230/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGccacca < 7:350664/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGccac < 8:85287/147‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGccac < 7:329705/147‑1 (MQ=255) cGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGGCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGccac < 5:65849/147‑1 (MQ=255) cTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGtt < 1:249915/149‑1 (MQ=255) tGGCGGACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGTGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGGGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTc < 7:338927/149‑1 (MQ=255) cGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCATGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTg < 5:235982/149‑1 (MQ=255) cGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTg > 1:54287/1‑149 (MQ=255) tACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGt < 5:12684/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCCGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTc > 5:176302/1‑149 (MQ=255) aCCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCATGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGCCGGCGGACGAAGTCCAGTGCCCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTc > 8:272303/1‑149 (MQ=255) agcagGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGct > 4:174114/1‑149 (MQ=255) gcagGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGctg < 3:287002/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCAAGCCCTGGTGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCgg > 6:131642/1‑149 (MQ=255) aGCTCCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGCCGGCCAGGCCAGCGACCAGGAACTGGTGGCCGCGCTGGCCgcc < 8:130075/149‑3 (MQ=25) aGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGc < 1:170588/149‑1 (MQ=255) aCCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCAcc > 2:44874/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAg < 6:176302/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAgg < 2:54287/148‑1 (MQ=255) gccgccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCtggcctggcc > 4:46232/1‑126 (MQ=255) gccgccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCtggcctggcc < 3:46232/126‑1 (MQ=255) gccgccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTccc > 6:59129/1‑149 (MQ=255) gccgccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTccc < 5:59129/149‑1 (MQ=255) cgccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCTGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCg < 7:2444/131‑1 (MQ=255) cgccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCg > 8:2444/1‑131 (MQ=255) cgccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCg > 7:246194/1‑148 (MQ=255) gccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGCCGGCCAGGCCAGCGACCAGGAACTGGTGGCCGCGCTGGCCGCCa < 7:15317/127‑1 (MQ=21) gccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGCCGGCCAGGCCAGCGACCAGGAACTGGTGGCCGCGCTGGCCGCCa > 8:15317/1‑127 (MQ=21) ccAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAg < 5:131642/149‑1 (MQ=255) aCAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGCCGGCCAGGCCAGCGACCAGGAACTGGTGGCCGCGCTGGCCGCCAct < 5:92525/124‑2 (MQ=18) aCAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGCCGGCCAGGCCAGCGACCAGGAACTGGTGGCCGCGCTGGCCGCCAct > 6:92525/1‑123 (MQ=18) aaGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGcc < 3:174114/149‑1 (MQ=255) aaGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGcc > 7:256355/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTg > 2:68737/1‑99 (MQ=255) gCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTg < 1:68737/99‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGt > 6:66815/1‑149 (MQ=255) cccAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTg < 3:17774/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTgg < 7:135004/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTg > 2:58661/1‑148 (MQ=255) tcctTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAg < 6:138492/120‑1 (MQ=255) tcctTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAg > 5:138492/1‑120 (MQ=255) ctTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGcc < 7:280622/147‑1 (MQ=255) ttCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTcg > 6:145232/1‑149 (MQ=255) ggATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGACCAGTGCGCCACTGCCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGTGTGAGGTTATCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTAc > 8:354462/1‑149 (MQ=255) aaGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGt > 7:273935/1‑127 (MQ=255) aaGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGt < 8:273935/127‑1 (MQ=255) gTGGTCCATGCCCATGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCGACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGgca < 3:206761/149‑1 (MQ=255) tGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGgcag > 1:258864/1‑149 (MQ=255) cATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGc > 8:88237/1‑149 (MQ=255) cATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGc > 8:187934/1‑149 (MQ=255) cATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGc > 6:295292/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGa > 5:365716/1‑149 (MQ=255) cccTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGa < 5:145232/148‑1 (MQ=255) cccTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGAc < 7:88237/149‑1 (MQ=255) cccTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGAc < 5:295292/149‑1 (MQ=255) ccTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACg > 6:40213/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGACGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACg < 7:272303/149‑1 (MQ=255) gggCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTc < 8:246194/147‑1 (MQ=255) ggcggcGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGgcgc < 5:66815/149‑1 (MQ=255) gcggcgGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGgcg > 4:268225/1‑147 (MQ=255) cggcggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAg < 1:44874/149‑1 (MQ=255) ggACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGt > 2:231259/1‑147 (MQ=255) gTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGt < 8:256355/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTc > 3:251013/1‑147 (MQ=255) cAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTc < 4:251013/147‑1 (MQ=255) cAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTc > 3:39955/1‑147 (MQ=255) cAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGa < 3:268225/149‑1 (MQ=255) aGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAg > 7:238094/1‑149 (MQ=255) aGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAg < 2:258864/149‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAgg < 6:371766/142‑1 (MQ=255) gTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAgg > 5:371766/1‑142 (MQ=255) gTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAgg > 5:4860/1‑149 (MQ=255) cgcCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAg > 2:202426/1‑130 (MQ=255) cgcCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAg < 1:202426/130‑1 (MQ=255) cgcCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTgg > 1:317133/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGcc < 1:58661/149‑1 (MQ=255) cAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGc > 1:47541/1‑148 (MQ=255) gTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCAt < 5:40213/149‑1 (MQ=255) ggcggcCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGTGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATgg < 7:354462/149‑1 (MQ=255) gcCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGAt < 6:365716/149‑1 (MQ=255) aGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGGCGAGGTGGGCCATGGCGATGcc < 7:187934/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGAc < 7:283310/103‑1 (MQ=255) gcgcGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGAc > 8:283310/1‑103 (MQ=255) | CTGCGGCTGGCGTACCAGCAGGCGCGACAGCACCAGGGCTTGGCGCTGGCCGCCAGACAAGCCCAGGCCTCCTTCGAGGATCAAGTGGTCCATGCCCTTGGGCAGGCGGCGGACGAAGTCCAGTGCGCCAGTGGCGGCCAGCGCGGCCACCAGTTCCTGGTCGCTGGCCTGGCCGGCACCGAGGGTGAGGTTTTCCCGCAGGGTGCCGTGGAACAGCCTCGCGTACTGCGGCAGCAGGCCGACGTCACGGCGCAGGTCAGCAGGGTCGAGGTGGGCCATGGCGATGCC > NC_002947/923249‑923536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |