Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 964,468 | C→A | 6.8% | P92T (CCG→ACG) | phnE → | phosphonate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 964,468 | 0 | C | A | 6.8% | 188.4 / 3.9 | 59 | P92T (CCG→ACG) | phnE | phosphonate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/30); new base A (2/2); total (27/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.37e-01 |
GTCAGCAGATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGC > NC_002947/964328‑964610 | gTCAGCAGATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCACggctggc > 3:59307/1‑149 (MQ=255) agcagATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTg > 7:266429/1‑149 (MQ=255) gcagATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGc < 7:211838/149‑1 (MQ=255) agATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTg < 8:249644/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGc > 6:57984/1‑147 (MQ=255) cAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGcc > 1:85326/1‑149 (MQ=255) aGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCg < 3:14160/149‑1 (MQ=255) ttCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGc > 1:334800/1‑149 (MQ=255) cACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGcc < 2:337179/148‑1 (MQ=255) aCCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCACGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCgggatc < 4:59307/148‑6 (MQ=255) aGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTc < 2:133327/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTc > 7:3361/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCACGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCggga > 5:100296/1‑140 (MQ=255) aGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCACGGCTGGCCAGCAAGCCAGCCggga < 6:100296/143‑4 (MQ=255) gcCTTCTGGCCGCCGGCACATGATCCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAATCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTTGCGACGATTGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTc < 1:115758/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGtgc > 4:352958/1‑149 (MQ=255) ccgGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCtt > 1:3504/1‑148 (MQ=255) ccgGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTc < 8:266429/149‑1 (MQ=255) atgatgCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACgcggc > 2:151076/1‑149 (MQ=255) atgatgCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTACTTCACgcggc < 8:324127/149‑1 (MQ=255) gatgCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGcggcgg > 6:358963/1‑149 (MQ=255) atgCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCggcggg < 5:228403/149‑1 (MQ=255) ccGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTAGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCggcgggcg < 5:352942/148‑1 (MQ=255) tCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGcgggccgggc > 8:286521/1‑149 (MQ=255) ttGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGctc > 1:19975/1‑149 (MQ=255) gCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGctc < 2:3504/147‑1 (MQ=255) aCTGTTGTATGAAGCTACCTTGCAGAGCCTGGCGGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCTTGGCGCGGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGTTTGGTGGCCAGCCGTGGGTTGTCGTTGCGTGCTGCTTCACGCGGGGGGCGGGGCGGGCTCTGGt < 2:85326/149‑1 (MQ=255) aCTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGATGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCCGGCTCTGGt > 1:90381/1‑149 (MQ=255) ctgTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTcgcg > 2:139749/1‑149 (MQ=255) ctgTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTcgc < 8:3361/148‑1 (MQ=255) gAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGACATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGtt > 6:234085/1‑149 (MQ=255) aaGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGtt < 7:286521/148‑1 (MQ=255) aaGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGtt < 1:151076/148‑1 (MQ=255) aaGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGtt < 3:352958/148‑1 (MQ=255) tACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACgcggc < 4:198041/115‑1 (MQ=255) tACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACgcggc > 3:198041/1‑115 (MQ=255) cTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGc > 4:358138/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGc < 4:189609/149‑1 (MQ=255) gCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCg < 3:330743/148‑1 (MQ=255) cAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGt > 3:113324/1‑149 (MQ=255) cccTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGt < 4:113324/149‑1 (MQ=255) cccTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGt < 5:358963/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTg < 2:19975/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTg > 4:115998/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGATTCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTCCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTc > 1:43704/1‑149 (MQ=255) ccGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTg > 4:6192/1‑149 (MQ=255) cATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTa < 3:358138/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTa < 3:348565/132‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTa > 4:348565/1‑132 (MQ=255) tGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGc < 2:101565/149‑1 (MQ=255) gttgttgGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATc < 2:90381/148‑1 (MQ=255) gttgttgGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCg > 5:373289/1‑149 (MQ=255) gttgttgGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCg > 1:62162/1‑149 (MQ=255) gttgGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTg > 7:198533/1‑81 (MQ=255) gttgGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTg < 8:198533/81‑1 (MQ=255) ttgGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTg < 5:57984/149‑1 (MQ=255) gCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTggg < 2:43704/148‑1 (MQ=255) gCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGc > 3:65810/1‑149 (MQ=255) gCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGc < 2:334800/149‑1 (MQ=255) | GTCAGCAGATTGCCAGCTTCACCAGCGCCTTCTGGCCGCCGGCACATGATGCCGATTTTCTTGCACTGCTGTATGAAGCTACCTTGCAGACCCTGGCCGTGGCGAC‑‑‑TGCCGGCATGGCGCTGGCGTTGTTGTTGGCGA‑TCCCGGCTGGCTTGCTGGCCAGCCGTGCCTTGTCCTTGCGTGCTGCTTCACGCGGCGGGCGGGCCGGGCTCTGGTCGCGACTGTTGCGCCTGCCGGTGCGTGGGCTACTGATTTTCCTGCGTAGCGTGCCGGAAATCGTCTGGGC > NC_002947/964328‑964610 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |