Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 996,025 | C→A | 7.5% | W524L (TGG→TTG) | PP_0860 ← | sulfite reductase flavoprotein subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 996,025 | 0 | C | A | 7.5% | 214.3 / 6.3 | 67 | W524L (TGG→TTG) | PP_0860 | sulfite reductase flavoprotein subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/28); new base A (3/2); total (37/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.80e-01 |
CAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAGGGCA > NC_002947/995879‑996171 | cAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCAGCAAt > 5:255468/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATtgctg > 5:222182/1‑149 (MQ=255) cAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATtgctg < 3:16021/147‑1 (MQ=255) gCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAggg > 1:233601/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCAGCAATGGCAGCAgga < 5:82742/149‑2 (MQ=255) gCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCAGCAATGGCAGCAgga < 6:255468/149‑2 (MQ=255) cAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGggcg < 6:222182/149‑1 (MQ=255) aaGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGggcgg > 6:176363/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGggcgg > 3:86312/1‑149 (MQ=255) acacCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCg > 3:20336/1‑149 (MQ=255) acCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGc > 5:343948/1‑149 (MQ=255) acCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGc < 7:124273/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCCTTGGCTGCCGTGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCGCAAGAGACCAGTGGGCAAAGGTTGGCGGCTCGC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGGCATTGATGCAGGGCGGCCTGGTCGGAGtt > 6:86980/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTg > 3:171626/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTg < 2:233601/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTcc < 2:308603/148‑1 (MQ=255) ccTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCAc > 3:116223/1‑149 (MQ=255) cTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACt > 4:39143/1‑149 (MQ=255) gTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGa < 8:8904/149‑1 (MQ=255) aGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATg < 6:343948/148‑1 (MQ=255) gTTCGCGGCCCACCAGTGCCCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AAGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGCATGCActg > 6:282471/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCCGAGGCGCCCACTGGCTGGACACCGGTAATTTGCCCCAGATCCTCCTCCCAt > 1:76069/1‑95 (MQ=255) cgcACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCAcc < 3:203394/149‑1 (MQ=255) ttGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCa > 8:328333/1‑149 (MQ=255) ttGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCa > 5:230928/1‑149 (MQ=255) gCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATg < 6:230928/148‑1 (MQ=255) gCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGc > 3:248502/1‑149 (MQ=255) aaaGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCt > 7:62725/1‑149 (MQ=255) aaaGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCt < 3:39143/149‑1 (MQ=255) ggTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGaa < 8:62725/149‑1 (MQ=255) cggcTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGcgac < 5:176363/149‑1 (MQ=255) ggcTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGcgac > 8:95857/1‑148 (MQ=255) gcTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGt > 8:235070/1‑84 (MQ=255) gcTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGt < 7:235070/84‑1 (MQ=255) gCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGc > 5:68913/1‑148 (MQ=255) cc‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGa < 7:328333/149‑1 (MQ=255) aGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGaaa < 4:248502/149‑1 (MQ=255) cggcCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGc > 5:261506/1‑142 (MQ=255) cggcCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGc < 6:261506/142‑1 (MQ=255) cACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAg > 1:206737/1‑148 (MQ=255) gctggACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTg < 7:263443/148‑1 (MQ=255) gACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCg < 4:172168/136‑1 (MQ=255) gACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCg > 3:172168/1‑136 (MQ=255) gACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCggg > 3:99665/1‑148 (MQ=255) gACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCgg < 2:206737/147‑1 (MQ=255) acCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACt > 2:223565/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCgg > 3:51161/1‑142 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCgg < 4:51161/142‑1 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGa < 5:282471/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGa < 6:68913/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTAGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGa > 8:12555/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGc > 2:222235/1‑72 (MQ=255) ttGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGc < 1:222235/72‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCAc > 7:228805/1‑149 (MQ=255) cgcCAGCTCCTTCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCATGAAGGCGACTAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGa < 5:86980/149‑1 (MQ=255) cAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAggg > 4:223893/1‑149 (MQ=255) cAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAggg > 3:350535/1‑149 (MQ=255) gcccTGCAGCAATGGCAGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGc > 5:62193/3‑147 (MQ=255) ccTGCAGCAATGGCAGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAg > 6:241068/1‑148 (MQ=255) ctgctgCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGc < 7:305401/144‑1 (MQ=255) ctgctgCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGc > 8:305401/1‑144 (MQ=255) ctgctgCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAg > 6:82758/1‑147 (MQ=255) ctgcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAgg < 8:228805/148‑1 (MQ=255) ctgcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAg < 4:99665/147‑1 (MQ=255) gcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATc < 7:212994/130‑1 (MQ=255) gcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATc > 8:212994/1‑130 (MQ=255) gcCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAGGGCa > 2:167112/1‑149 (MQ=255) | CAGCCTGCAGGCCAAGCAGGTACACCGGTTGGCCTTGGCTGCCGGGGTTGAGCAGTTCGCGGCGCACCAGTGACCAGTTGGCAAAGGTTGGCGGCTGCC‑AGGCGGCCACTGGCTGGACACCGGTCAGTTGCGCCAGCTCCTGCTGCCATTGCTGCAGGGCGGCCTGGTCGGCGTTGTCCACTTCCACCGGGCTGAATGCACTGCTGGCACCGCGCTCTCCCAGCCATGCCTGAAGGCGACGAGCGAAACCGCAGAAGTGCGGGTACTGACGATCACCGAGGGCGAGCAGGGCA > NC_002947/995879‑996171 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |