Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,099,295 | G→T | 6.1% | R91S (CGT→AGT) | kdsD ← | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,099,295 | 0 | G | T | 6.1% | 208.9 / 3.8 | 66 | R91S (CGT→AGT) | kdsD | D‑arabinose 5‑phosphate isomerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/29); new base T (2/2); total (35/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.19e-01 |
GACCTCGGCGGCCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCGGCCCTTGCTG > NC_002947/1099152‑1099440 | gACCTCGGCGGCCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGa > 4:217071/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGGCCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGAt > 8:316755/1‑148 (MQ=255) ccTCGGCGGCCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGAt > 3:16042/1‑148 (MQ=255) gcCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGccc < 8:354320/147‑1 (MQ=255) gcCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGccc > 7:354320/1‑147 (MQ=255) gcCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGccc < 6:70955/147‑1 (MQ=255) gcCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGccc > 5:70955/1‑147 (MQ=255) tCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGATTc > 6:266578/1‑149 (MQ=255) cGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACTGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCgg > 4:52415/1‑149 (MQ=255) cGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACTGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCgg > 4:57367/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGa > 5:133561/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGc < 5:266578/149‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACggg < 6:286967/107‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACggg > 5:286967/1‑107 (MQ=255) gTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATCGCTGGCATCGCCCGGATGCa > 6:349818/1‑148 (MQ=255) gCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGaaaa < 3:80598/149‑1 (MQ=255) gCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGaaa > 4:80598/1‑148 (MQ=255) cTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGaaaaa > 5:128425/1‑149 (MQ=255) cTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGaaaaa < 6:133561/149‑1 (MQ=255) tGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAAc > 5:349310/1‑149 (MQ=255) tCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGaa < 7:82611/142‑1 (MQ=255) tCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGCCTGGCTTCGGCCGGATGCACGaa > 8:82611/1‑142 (MQ=255) tCAGCGTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGc < 6:339698/148‑1 (MQ=255) gATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGgtgt < 5:187714/147‑1 (MQ=255) ccAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGt > 3:211945/1‑149 (MQ=255) aaGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGc > 1:218353/1‑149 (MQ=255) gcTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGc > 6:354811/1‑148 (MQ=255) cTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCa < 6:349310/149‑1 (MQ=255) gatgaACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAgg < 5:349818/148‑1 (MQ=255) atgaACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGAACATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGt > 7:195860/1‑149 (MQ=255) cagcagGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACTGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGa < 3:57367/149‑1 (MQ=255) cagcagGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACTGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGa < 3:52415/149‑1 (MQ=255) agcagGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGAt < 6:128425/149‑1 (MQ=255) gcagGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATc < 7:316755/149‑1 (MQ=255) cagGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCt > 3:271774/1‑149 (MQ=255) ggTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCttgt < 1:227743/149‑1 (MQ=255) tGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCttgttg > 1:360490/1‑149 (MQ=255) tGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCttgttg < 3:217071/149‑1 (MQ=255) aCGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGcc > 3:138867/1‑149 (MQ=255) cGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGcc > 4:349234/1‑148 (MQ=255) gATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGa > 1:335793/1‑149 (MQ=255) gATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGa > 6:167074/1‑149 (MQ=255) gATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGa > 1:149129/1‑149 (MQ=255) tCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGa < 6:286217/145‑1 (MQ=255) tCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGa > 5:286217/1‑145 (MQ=255) tCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGAtgt < 5:354811/148‑1 (MQ=255) ggcggTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGcc < 8:144840/149‑1 (MQ=255) ggcggTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGcc > 4:229326/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGa < 4:211945/149‑1 (MQ=255) ccGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGTTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCttgtt < 1:301294/128‑1 (MQ=255) ccGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCttgtt > 2:301294/1‑128 (MQ=255) ccGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATTTGCCCGGACTTGcc < 8:195860/149‑1 (MQ=255) ccGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGc < 2:360490/148‑1 (MQ=255) ttCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGcc > 4:96404/1‑149 (MQ=255) gACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATg < 7:14032/144‑1 (MQ=255) gACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATg > 8:14032/1‑144 (MQ=255) gACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGAc > 4:294444/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGAcc < 2:335793/149‑1 (MQ=255) cgcAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCacga < 3:349234/149‑1 (MQ=255) aTGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGAccc < 3:229326/148‑1 (MQ=255) tGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCgg < 4:16042/149‑1 (MQ=255) tGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCgg < 2:149129/149‑1 (MQ=255) aCATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCg > 2:177721/1‑117 (MQ=255) aCATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCg < 1:177721/117‑1 (MQ=255) catcatCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCGGccc > 3:77034/1‑149 (MQ=255) catcatCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCGGccc > 6:115117/1‑149 (MQ=255) tcaCGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCGGCCCTTGCt > 5:330495/1‑149 (MQ=255) aCGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCGGCCCTTGCTg < 3:294444/148‑1 (MQ=255) | GACCTCGGCGGCCTGGGCCAGCGGCGAGTCCGGGTTGCCGGTCAGGCTGATCAGCTTGATGCCAAGGCGCTTGATGAACGGCAGCAGGGTGACGATTTCGGCGGTGCTGCCGGAGTTCGACAGCGCAAGGATGACATCATCACGGGTGATCATGCCCATGTCGCCATGGCTGGCTTCGGCCGGATGCACGAAAAACGCCGGTGTGCCGGTGCTGGCCAGGGTCGCGGCGATCTTGTTGCCGATGTGCCCGGACTTGCCCATGCCGACCACGACGACCCGGCCCTTGCTG > NC_002947/1099152‑1099440 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |