| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,273,536 | G→A | 8.1% | N13N (AAC→AAT) ‡ | PP_1114 ← | SEC‑C domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,273,536 | 0 | G | A | 8.1% | 214.9 / 6.1 | 74 | N13N (AAC→AAT) ‡ | PP_1114 | SEC‑C domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/40); new base A (3/3); total (30/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCACTTCTTGTACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCTGCAGGGA > NC_002947/1273389‑1273680 | gCACTTCTTGTACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGTGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATgg < 2:200112/148‑1 (MQ=255)gCACTTCTTGTACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATgg < 6:179110/148‑1 (MQ=255) aCTTCTTGTACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTTCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTg < 5:118414/149‑1 (MQ=255) aCTTCTTGTACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTg > 4:302670/1‑149 (MQ=255) ttGTACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGt > 2:90390/1‑148 (MQ=255) tACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAg < 1:364116/148‑1 (MQ=255) tACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAg < 4:78416/148‑1 (MQ=255) tACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAg > 2:364116/1‑148 (MQ=255) aCTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAggg > 5:377205/1‑149 (MQ=255) aCTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAggg > 6:40538/1‑149 (MQ=255) cttcttCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGc < 5:189699/149‑1 (MQ=255) cttcttCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGGGGGGGCTGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAgg < 1:191918/148‑1 (MQ=255) ttcttcTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGc > 2:272975/1‑148 (MQ=255) 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7:201389/130‑1 (MQ=255) gCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAAc < 4:156713/147‑1 (MQ=255) cTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTg < 3:28814/149‑1 (MQ=255) ccGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTgggg < 7:220083/149‑1 (MQ=255) ccGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTggg < 7:5205/148‑1 (MQ=255) gcacgggcacggGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGcc > 1:171596/1‑135 (MQ=255) gcacgggcacggGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGcc < 2:171596/135‑1 (MQ=255) acgggcacgggTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGgttgt < 6:377205/149‑1 (MQ=255) ggcacgggTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGTTCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTgg < 6:321381/149‑1 (MQ=255) ggcacgggTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTgg < 6:128371/149‑1 (MQ=255) gggTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACAt > 7:39097/1‑149 (MQ=255) ggTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACAtt < 6:294905/149‑1 (MQ=255) tCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGc < 6:333570/149‑1 (MQ=255) gTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCa < 3:118168/148‑1 (MQ=255) gTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAg < 1:90390/149‑1 (MQ=255) aCGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGGGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAAGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGt > 6:253005/1‑149 (MQ=255) gCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGACCCTGACTGC‑AACCATGGCCATGat > 8:64955/1‑118 (MQ=255) gCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGACCCTGACTGC‑AACCATGGCCATGat < 7:64955/119‑2 (MQ=255) gCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCAGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACGTTGCAGGGTCAc > 7:130737/1‑149 (MQ=255) ccAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACt < 1:234579/149‑1 (MQ=255) cAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTc < 5:21658/149‑1 (MQ=255) aaCGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAgg < 5:147706/108‑1 (MQ=255) aaCGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAgg > 6:147706/1‑108 (MQ=255) aaCGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTcc > 8:167602/1‑149 (MQ=255) gaccTTGAGGTCGTTGCGTATCGGCGCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGGCTTTTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGTGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGt < 7:333009/147‑1 (MQ=255) gTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGt < 1:272975/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAAtcgt < 5:40538/149‑1 (MQ=255) cGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGa < 2:20532/149‑1 (MQ=255) gTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTTGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGAt > 7:238103/1‑149 (MQ=255) tggtggCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCgg > 2:44879/1‑134 (MQ=255) tggtggCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCgg < 1:44879/134‑1 (MQ=255) gtggCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGTGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCCCTACGGTATGTAAGCGTCGGGGATTATCTCACCACTg > 6:214459/1‑149 (MQ=255) gCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGAtt > 3:126866/1‑134 (MQ=255) gCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGAtt < 4:126866/134‑1 (MQ=255) tGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTTGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCgaga < 8:238103/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCgg < 1:284108/123‑1 (MQ=255) gTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCgg > 2:284108/1‑123 (MQ=255) cAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAgg < 8:328296/95‑1 (MQ=255) cAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAgg > 7:328296/1‑95 (MQ=255) gCGGGCCGTGTACATGGCCGGGGGCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTc < 5:214459/149‑1 (MQ=255) gggCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTccc < 3:302670/149‑1 (MQ=255) tACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGTGAGATGTGCAGGTCCCgatggat < 7:167602/148‑1 (MQ=255) tACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCgatggatg < 8:39097/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGGTGGCGTTGTGG‑TGATCATGGCCATGTTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGGCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAg < 7:59526/148‑1 (MQ=255) tggtcgtggtGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCgg < 7:229683/149‑1 (MQ=255) cgtggtGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCgatggatg > 7:293176/1‑135 (MQ=255) cgtggtGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCgatggatg < 8:293176/135‑1 (MQ=255) gtggtgg‑tgATCATGGCCATGGTTGCGAGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGc > 1:5425/1‑149 (MQ=255) cacgttCATGGCCCTGACTGC‑AACCATGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATATAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTc > 5:174912/6‑149 (MQ=38) gttCATGGCCCTGACTGC‑AACCATGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGcc > 6:81699/3‑149 (MQ=255) gttCATGGCCCTGACTGC‑AACCATGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGcc < 5:81699/147‑1 (MQ=255) gATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGcc > 7:155664/1‑149 (MQ=255) aTGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCACACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCtc > 3:206924/1‑147 (MQ=255) tGGCCATGGTTGC‑AGTCAAGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGGTGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCTGCa < 5:253005/149‑1 (MQ=255) gCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCTGCAgg > 8:97456/1‑149 (MQ=255) gCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCTGCAgg > 4:202949/1‑149 (MQ=255) aTGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCTGCAgg > 6:256543/1‑146 (MQ=255) aTGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCTGCAGGGa < 5:256543/148‑1 (MQ=255) | GCACTTCTTGTACTTCTTCTCGCTACCGCACGGGCACGGGTCGTTACGGCCAACGTCCTTCAGGGCGTTGCGTATCGGCTCCTGGTGGCCGTGGTTGCAGTGCGGGCCGTGTACATGGCCGTGGTCGTGGTGG‑TGATCATGGCCATGGTTGC‑AGTCAGGGCCATGAACGTGGGGTTGTTGGGACATTGCAGGGTCACTCCGGTATGTAATCGTCGGGGATTATCTCACCACTGCGCGAGATGTGCAGGTCCCGATGGATGAGCAACCCGGTCGCCAGTTCGCCCTGCAGGGA > NC_002947/1273389‑1273680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |