Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,358,572 | T→C | 5.9% | A187A (GCA→GCG) | PP_1183 ← | siderophore biosynthesis protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,358,572 | 0 | T | C | 5.9% | 201.5 / 2.3 | 67 | A187A (GCA→GCG) | PP_1183 | siderophore biosynthesis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/34); new base C (2/2); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
GGTCAGACGCTGACCAGGCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGATAAGGATTTCACC > NC_002947/1358429‑1358715 | ggTCAGACGCTGACCAGGCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCgtg < 3:196065/149‑1 (MQ=255) aCGCTGACCAGGCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCTTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGaa < 1:60938/149‑1 (MQ=255) cGCTGACCAGGCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAg < 7:339977/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAg > 2:168737/1‑147 (MQ=255) aCCAGGCTCAGCACGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGACGAGCACATCTGCGTGATCGAAGTAg > 8:166150/1‑147 (MQ=255) ccAGGCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAg < 6:186003/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGGAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGtt < 6:5642/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGGACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGtt < 6:10982/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCCGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGtt > 3:367512/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCCGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGtt > 3:361805/1‑149 (MQ=255) cTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTg < 1:6306/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTgg > 7:1121/1‑149 (MQ=255) agGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGt < 1:168737/149‑1 (MQ=255) gTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACAAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGt > 8:266952/1‑147 (MQ=255) gCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGt < 8:311594/148‑1 (MQ=255) gCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTg < 3:174055/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCCGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTg < 4:367512/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCCGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTg < 4:361805/149‑1 (MQ=255) gTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTggg > 6:64888/1‑148 (MQ=255) cTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGGGTCAGTGGGTa > 4:269261/1‑147 (MQ=255) gcagAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGGTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGaa > 1:31303/1‑120 (MQ=255) gcagAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGaa < 2:31303/120‑1 (MQ=255) aCTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGaa > 1:109732/1‑148 (MQ=255) gcaaggccAGTTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAg > 3:219349/8‑149 (MQ=255) gCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAg < 2:109732/148‑1 (MQ=255) gCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGc < 8:1121/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCtt > 1:218941/1‑149 (MQ=255) tGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTc > 2:85126/1‑149 (MQ=255) cAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTcc < 5:242460/148‑1 (MQ=255) aGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCtt < 4:153398/144‑1 (MQ=255) aGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCtt > 3:153398/1‑144 (MQ=255) aGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCtt < 7:272131/149‑1 (MQ=255) aGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCtt < 5:64888/149‑1 (MQ=255) tctGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAg > 6:8067/1‑149 (MQ=255) gcgcCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTcc < 4:335687/141‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTcc > 3:335687/1‑141 (MQ=255) cTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAg > 7:100928/1‑149 (MQ=255) ctgcCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCa > 4:286957/1‑137 (MQ=255) ctgcCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCa < 3:286957/137‑1 (MQ=255) ccACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCaa < 7:61194/147‑1 (MQ=255) ccACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCaa < 8:100928/147‑1 (MQ=255) ccACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAgg < 5:8067/149‑1 (MQ=255) cACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAg < 2:3952/141‑1 (MQ=255) cACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAg > 1:3952/1‑141 (MQ=255) cGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGGGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAAc < 3:269261/147‑1 (MQ=255) cGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACg < 4:219349/148‑1 (MQ=255) ggTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGttg < 7:301044/78‑3 (MQ=255) ggTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGtgg > 8:301044/1‑76 (MQ=255) aCAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCaa < 8:210485/136‑1 (MQ=255) aCAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCaa > 7:210485/1‑136 (MQ=255) gCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGTGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGAcgg < 7:166150/149‑1 (MQ=255) gCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTg < 8:336536/70‑1 (MQ=255) gCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTg > 7:336536/1‑70 (MQ=255) gcgcAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGt > 1:216616/1‑149 (MQ=255) gcAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACg < 7:31508/125‑1 (MQ=255) gcAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACg > 8:31508/1‑125 (MQ=255) gcgcCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGgcgc > 2:238080/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGAt > 6:41324/1‑147 (MQ=255) cAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGATAAg < 2:216616/149‑1 (MQ=255) cAGTCGAGCACTTCTGCGAGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAACCTTTCCTTCAGCGAAAAGCTCAAGGTAACGCTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTCACGGGATAAg > 7:194686/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTc > 7:120967/1‑88 (MQ=255) gTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTc < 8:120967/88‑1 (MQ=255) gTCGAGCACTTCTGCGTGTTAGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGATAAGGa > 5:281229/1‑149 (MQ=255) gAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCATTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTAAGCCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGATCCAGATCTGCCGGGATAAGGAtt > 3:131356/1‑148 (MQ=255) gCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGATAAGGATTTCa < 5:41324/149‑1 (MQ=255) cACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGATAAGGATTTCa < 7:266952/148‑1 (MQ=255) cTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGATAAGGATTTCAcc > 4:226250/1‑148 (MQ=255) | GGTCAGACGCTGACCAGGCTCAGCAGGTGGCCGTCCTGCAGGCAGAACTGGCCTTGCAGCTCTGCGCCTTGCTGCCACTGCGGTGACAGGTCGGTGAGCAGGCGCAAGCGCGCCAGCCCTTCCGCGGACCAGTCGAGCACTTCTGCGTGTTCGAAGTAGAAGCGTTGGCGAGTCAGTGGGTACAGGGTCTTGAACAAGCTTTCCTTCAGCGAAAAGGTCAAGGTAACGGTCAGGCCGAGCTGACGGCGGTCCAGGCGCTCCAGCTCTGCCGGGATAAGGATTTCACC > NC_002947/1358429‑1358715 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |