Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,364,488 | C→G | 5.7% | A394G (GCC→GGC) | dctA‑I → | C4‑dicarboxylate transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,364,488 | 0 | C | G | 5.7% | 293.4 / 5.7 | 88 | A394G (GCC→GGC) | dctA‑I | C4‑dicarboxylate transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/42); new base G (3/2); total (44/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 |
TGCCGGCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCGTTGAGAGC > NC_002947/1364342‑1364634 | tGCCGGCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGT‑GGCAACGGCGt > 1:160748/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCg < 4:72016/147‑1 (MQ=255) ccGGCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGtt < 6:308383/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGt < 4:52631/148‑1 (MQ=255) ccGGCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGt < 4:98656/148‑1 (MQ=255) ggCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTAGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGc < 5:25930/149‑1 (MQ=255) ttACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGT‑GGCAACGGCGTTGcccacc < 6:171218/149‑5 (MQ=255) aCCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGT‑GGCAACGGCGTTGcccacca < 2:160748/148‑6 (MQ=255) cGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGGTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTg < 5:307403/149‑1 (MQ=255) gggCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTgg < 1:125082/149‑1 (MQ=255) cATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTg < 5:370534/136‑1 (MQ=255) cATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTg > 6:370534/1‑136 (MQ=255) aTCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTg > 6:306965/1‑149 (MQ=255) aTCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTg > 8:241993/1‑149 (MQ=255) tCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTgg < 5:133379/149‑1 (MQ=255) gCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGt < 6:20034/139‑1 (MQ=255) gCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGt > 5:20034/1‑139 (MQ=255) cgcgACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGaaa < 8:221705/149‑1 (MQ=255) aCCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCAGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAAt > 7:354215/1‑146 (MQ=255) aCCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCAGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAAt < 8:354215/146‑1 (MQ=255) aCCCTGTAGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGGGCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCTACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGGCAAGGAAATGGa < 8:79413/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACaa < 7:297229/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACaa < 1:323658/146‑1 (MQ=255) tCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACaa > 2:323658/1‑146 (MQ=255) tCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCATCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGAAACGCCGTTGCCACCGTGGTATTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACaaa < 8:37584/147‑2 (MQ=255) cGGCTGTTGGACACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGGAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGAGGGTCAAGGAAATGGACAACGa > 7:101372/1‑148 (MQ=255) tcttGGCCACCTGCCGGTTCCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGAACGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAAACCCGTTGCCACCCAGCTAGTTGCCAAGTGGGTCAACGAAATCGACAACGACAAg > 4:95629/3‑148 (MQ=255) tGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGc > 4:84572/1‑149 (MQ=255) ttGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTg > 8:48977/1‑149 (MQ=255) tGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGaaa > 8:278730/1‑123 (MQ=255) tGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGaaa < 7:278730/123‑1 (MQ=255) tGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATgg > 2:200656/1‑126 (MQ=255) tGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATgg < 1:200656/126‑1 (MQ=255) cGGTTGCCGGCCTGGCTGTGATCCTCGGCATCGACAGATTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTTACCTACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGTCTTCGGAACt < 6:11672/148‑1 (MQ=255) cGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACt > 5:11672/1‑148 (MQ=255) ggTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTg > 8:277240/1‑148 (MQ=255) gTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGa < 8:158821/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGa > 2:210432/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑Tcc > 2:77180/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑Tcc > 4:61649/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCg > 2:136912/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGGCAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCggtgg > 6:32076/1‑149 (MQ=255) gcgcTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCggtggt < 3:84572/147‑1 (MQ=255) cTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGa < 1:136912/148‑1 (MQ=255) cTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGAt > 2:27793/1‑149 (MQ=255) cTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGAt < 5:62434/149‑1 (MQ=255) tCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATc > 3:39949/1‑149 (MQ=255) gCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGAt < 1:27793/149‑1 (MQ=255) aCCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATAcccgc < 7:48977/149‑1 (MQ=255) cTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCga > 6:80987/1‑149 (MQ=255) cATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgacgg > 1:104563/1‑149 (MQ=255) cATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgacg > 2:220587/1‑148 (MQ=255) cATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgac < 6:240958/147‑1 (MQ=255) aTGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgacgga > 2:200985/1‑149 (MQ=255) aTGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgacgga < 7:277240/149‑1 (MQ=255) aTGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGACCgacgga > 4:267828/1‑149 (MQ=255) tCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAG‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGgacga > 5:321492/1‑149 (MQ=255) tCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgacggacg < 6:73823/148‑1 (MQ=255) tCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGgacga < 1:210432/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTc < 5:309487/97‑1 (MQ=255) ccGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTc > 6:309487/1‑97 (MQ=255) cGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGAcc > 1:200460/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGACTTCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCt < 1:77180/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTg > 2:365806/1‑149 (MQ=255) gcgcCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACt > 1:212460/1‑94 (MQ=255) gcgcCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACt < 2:212460/94‑1 (MQ=255) gcgcCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTg > 2:305909/1‑149 (MQ=255) ccTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCt > 2:165276/1‑148 (MQ=255) 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aCCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCg > 1:85948/1‑149 (MQ=255) tggtggGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCt > 7:90336/1‑149 (MQ=255) ggtggGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTc > 3:68751/1‑149 (MQ=255) ggtggCAACGGCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCg > 8:329506/4‑149 (MQ=255) ggtggCAACGGCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCg > 3:277869/4‑149 (MQ=255) gggCAACGCCGTTGCCACCGTGGTTGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGAAC‑TCCGGTGGAGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCGtt < 5:295829/149‑1 (MQ=255) gCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCGTTga < 1:165276/149‑1 (MQ=255) gCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCGTTga < 1:365806/149‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgacg > 2:259009/1‑111 (MQ=255) aaCGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgacg < 1:259009/111‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgac > 7:345420/1‑110 (MQ=255) aaCGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCgac < 8:345420/110‑1 (MQ=255) cGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATAc < 1:166043/99‑1 (MQ=255) cGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATAc > 2:166043/1‑99 (MQ=255) cGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCGTTGAGAGc < 3:61649/149‑1 (MQ=255) | TGCCGGCGTTACCGGGTCGGGCTTCATCGTGCTGGCCGCGACCCTGTCGGCTGTTGGCCACCTGCCGGTTGCCGGCCTGGCGCTGATCCTCGGCATCGACCGCTTCATGTCCGAAGCCCGCGCCCTGACCAACCTGGTGGGCAACGCCGTTGCCACCGTGGTAGTGGCCAAGTGGGTCAAGGAAATGGACAACGACAAGCTGGCTTCGGAACTGGAC‑TCCGGTGGTGCGCCGCTGATCGATACCCGCCCGACGGACGACCTGGGCGTGGCTGAAGGCCCGGCTCGTTGAGAGC > NC_002947/1364342‑1364634 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |