Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,412,629 | G→A | 6.1% | G105S (GGC→AGC) | PP_1234 → | permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,412,629 | 0 | G | A | 6.1% | 196.9 / 2.5 | 65 | G105S (GGC→AGC) | PP_1234 | permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/31); new base A (2/2); total (32/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
TCAACGCCCTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGGCGCTGACCTTCTCGC > NC_002947/1412483‑1412773 | tCAACGCCCTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCggg > 1:270402/1‑148 (MQ=255) tCAACGCCCTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCggg > 6:98343/1‑148 (MQ=255) tCAACGCCCTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGc < 5:79221/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCt > 6:243907/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTc < 5:106662/148‑1 (MQ=255) ccTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTc > 6:106662/1‑148 (MQ=255) ccTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCg < 6:195571/149‑1 (MQ=255) tGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTAATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCgg > 1:257245/1‑148 (MQ=255) gAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGc > 2:190345/1‑147 (MQ=255) gcgcgtgcgcgtACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGCATGCCCGGCA‑GCTCgttgaac < 4:369885/149‑7 (MQ=255) gcgtgcgcgtACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTgg < 5:243907/149‑1 (MQ=255) gtgcgcgtACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCAGGCATGCTCGGCAAGTgg > 1:51803/1‑147 (MQ=255) tACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCgttg < 5:98343/149‑1 (MQ=255) aCCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCgttgt > 3:323898/1‑149 (MQ=255) ccTACACGGCTGGAGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCgttgt < 1:137411/148‑1 (MQ=255) cTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGttgttg < 8:25549/149‑1 (MQ=255) cacGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTATTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTtgctg > 2:35641/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTtgctgct < 1:190345/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTtgctgctg < 7:215354/149‑1 (MQ=255) gCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGcc < 4:191987/149‑1 (MQ=255) cGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAg > 3:56048/1‑136 (MQ=255) cGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAg < 4:56048/136‑1 (MQ=255) cATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCg < 2:257245/148‑1 (MQ=255) tGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCAGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGAc < 2:51803/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTAtt > 7:111046/1‑149 (MQ=255) tgtTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCAc < 4:323898/149‑1 (MQ=255) cATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCa > 4:286015/1‑149 (MQ=255) cATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCa > 4:315119/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCAt > 7:260380/1‑149 (MQ=255) tgctggtgctggTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCAtt < 1:35641/149‑1 (MQ=255) gtgctggtACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGt < 8:111046/148‑1 (MQ=255) tggtACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGTTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTg > 7:53868/1‑149 (MQ=255) tggtACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTg > 6:320094/1‑149 (MQ=255) gtACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTa > 5:337743/1‑98 (MQ=255) gtACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTa < 6:337743/98‑1 (MQ=255) gtACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACCAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGAAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGCTgcg > 2:351157/1‑149 (MQ=255) tACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTgcgc < 3:315119/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑AGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGcgcg < 5:320094/148‑1 (MQ=255) cGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGa < 8:147500/112‑1 (MQ=255) cGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGa > 7:147500/1‑112 (MQ=255) cGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTg > 5:292881/1‑125 (MQ=255) cGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTg < 6:292881/125‑1 (MQ=255) cGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGAATTGCACGCCAtt > 5:315969/1‑134 (MQ=255) cGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGAATTGCACGCCAtt < 6:315969/134‑1 (MQ=255) tgtgGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTg > 5:305639/1‑98 (MQ=255) tgtgGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTg < 6:305639/98‑1 (MQ=255) aCCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAg > 4:100647/1‑149 (MQ=255) aTCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGAc < 4:76492/93‑1 (MQ=255) aTCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGAc > 3:76492/1‑93 (MQ=255) cACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAAt > 1:60979/1‑149 (MQ=255) cACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAAt > 3:259485/1‑149 (MQ=255) cGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATgg < 2:270402/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCAtt > 5:148789/1‑109 (MQ=255) gCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCAtt < 6:148789/109‑1 (MQ=255) tGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGgcg > 1:191010/1‑149 (MQ=255) gTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGgcgc > 5:135450/1‑149 (MQ=255) cAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGGCGCTg < 2:60979/148‑1 (MQ=255) aaCGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCa > 1:333247/1‑127 (MQ=255) aaCGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCa < 2:333247/127‑1 (MQ=255) cGAGC‑TGCCGGTCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGgcgc < 1:29616/143‑1 (MQ=255) cGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGgcgc > 2:29616/1‑143 (MQ=255) cttGCCGAGCATGCCCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGGCGCTg > 5:128268/3‑142 (MQ=255) cttGCCGAGCATGCCCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTCCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGGCGCTg < 6:128268/140‑1 (MQ=255) c‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGGCGCTGACCTtctc < 4:259485/149‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCATGCCCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGgc < 4:176548/136‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCATGCCCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGgc > 3:176548/2‑137 (MQ=255) gCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGGCGCTGACCTTCTCGc > 7:238022/1‑149 (MQ=255) | TCAACGCCCTGGAGCGCGTGCGCGTACCTACACGGCTGGCGGTGATGCTGGTGTTCGCCTTGTTCATGGGCGCACTGGCGGTGTTCATGCTGGTGCTGGTACCGCTGCTGTGGCACCAGCTGATCACGCTGTTCAACGAGC‑TGCCGGGCATGCTCGGCAAGTGGCAGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCCGGAGCGCTATCCGCATCTGGTGTCGGACGAGCAGGTATTGCACGCCATTGAGTCGGTGCGCGGTGAAATTGGCAAGTTTGGTCAATGGGCGCTGACCTTCTCGC > NC_002947/1412483‑1412773 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |