| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,495,657 | T→C | 7.0% | V29A (GTG→GCG) | mdeA → | methionine gamma‑lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,495,657 | 0 | T | C | 7.0% | 202.2 / 4.8 | 71 | V29A (GTG→GCG) | mdeA | methionine gamma‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/33); new base C (3/2); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.72e-01 | |||||||||||
TTTTGGAAAAAATCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATGGCTTCGCTGGAG > NC_002947/1495509‑1495805 | ttttTGTAAAAATCGGGCAGCTCGGTGGCTTAAGCTTATAGCAAACCACAAGTGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACAGGTTT‑TTCCACGGGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGt < 5:70801/149‑1 (MQ=255) ttGGAAAAAATCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTTCTTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGt < 1:101942/148‑1 (MQ=255) tGGAAAAAATCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCACACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGACATTCAACATGTCTATGACCCGCTTTACCATGGTGGCGACCTGGTGc > 6:340338/1‑148 (MQ=255) ggAAAAAATCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCa > 4:234406/1‑149 (MQ=255) aaaaaaTCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCACCAGGGCGCCAc > 1:364102/1‑148 (MQ=255) aaTCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGgtg > 3:159694/1‑149 (MQ=255) aaTCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCACCAGGGCGCCAccatgg < 2:364102/149‑5 (MQ=255) cTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACg‑g < 3:234406/149‑1 (MQ=255) gTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATTGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTAc < 8:303994/149‑1 (MQ=255) ttATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTa > 1:104165/1‑137 (MQ=255) ttATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTa < 2:104165/137‑1 (MQ=255) ataGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCCCGACTCCCACCACAACACCGGTAT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATCACCCGCTTTCCCATCGTGGCACCAGGGCGCCAccaa > 5:74683/1‑118 (MQ=255) aGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCAc > 3:338976/1‑149 (MQ=255) cAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCACCAGGGCGCCAccat < 1:275006/116‑3 (MQ=255) cAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCACCAGGGCGCCAccat > 2:275006/1‑114 (MQ=255) aaaCCAAAAGAGGCTGTTGCCATGCGCTACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGTCTATGACCCGCTTTCACATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGt < 5:340338/149‑1 (MQ=255) aaCCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCAc > 5:375383/1‑111 (MQ=255) aaCCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCAc < 6:375383/111‑1 (MQ=255) aaCCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTc < 7:231655/149‑1 (MQ=255) cacaAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACACCACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAg > 5:69188/1‑149 (MQ=255) caAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTa > 2:278373/1‑149 (MQ=255) caAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTa > 3:78383/1‑149 (MQ=255) agagGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACg < 4:159694/149‑1 (MQ=255) gagGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACgg > 8:284785/1‑149 (MQ=255) gagGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACgg > 1:203372/1‑149 (MQ=255) agGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGt < 1:234698/149‑1 (MQ=255) cTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGtgct > 6:243094/1‑149 (MQ=255) gcgACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGcc < 2:203372/149‑1 (MQ=255) cTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACGCGCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCggg < 1:278373/149‑1 (MQ=255) ccaccaCAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGTCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGACACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATTCCTTCACCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCggg < 7:161935/145‑1 (MQ=255) ccaccaCAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATg < 2:93422/104‑1 (MQ=255) ccaccaCAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATg > 1:93422/1‑104 (MQ=255) ccaccaCAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGggag > 6:335135/1‑148 (MQ=255) ccaccaCAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGggag > 5:245616/1‑148 (MQ=255) ccaccaCAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGgga < 7:284785/147‑1 (MQ=255) ccaccaCAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACACGCTTTCACATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCAAATGTCGAGTACGGTGCTGCATTCATCGACGGggata > 8:161935/1‑147 (MQ=255) caccacAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGggag > 5:70206/1‑147 (MQ=255) cacaACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGcc > 2:239846/1‑149 (MQ=255) acaacaCCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCt < 1:239846/149‑1 (MQ=255) cacCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGc < 4:78383/149‑1 (MQ=255) acCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCa > 7:103308/1‑149 (MQ=255) cGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGt > 1:47590/1‑115 (MQ=255) cGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGt < 2:47590/115‑1 (MQ=255) gTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGggagga < 6:144045/136‑1 (MQ=255) gTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGggagga > 5:144045/1‑136 (MQ=255) ttCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTAc < 1:286613/148‑1 (MQ=255) ttCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTAc < 8:1250/148‑1 (MQ=255) tCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACa < 6:69188/148‑1 (MQ=255) cACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGcc > 6:176014/1‑149 (MQ=255) cACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCACCGGggagga < 5:184619/129‑1 (MQ=255) cACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCACCGGggagga > 6:184619/1‑129 (MQ=255) aCGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCg > 7:161766/1‑149 (MQ=255) cATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTcc > 2:43542/1‑148 (MQ=255) cATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTcc > 3:211256/1‑148 (MQ=255) ttCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAAc < 1:80765/149‑1 (MQ=255) atcatGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAAccc > 1:118531/1‑148 (MQ=255) ggCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGtgctgc < 3:35987/92‑1 (MQ=255) ggCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGtgctgc > 4:35987/1‑92 (MQ=255) gCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTg < 4:211256/149‑1 (MQ=255) ccGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCt > 7:271941/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTgg < 5:243094/149‑1 (MQ=255) ccATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGagcagc < 8:103308/149‑1 (MQ=255) ccATGGTGGCGCCCTGGTGACACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGagcagc > 1:141510/1‑149 (MQ=255) cATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAgcg > 5:286993/1‑149 (MQ=255) gtggCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCAt < 8:161766/148‑1 (MQ=255) gtggCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCAt < 5:335135/148‑1 (MQ=255) tggCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATgg < 5:176014/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATGGCt > 2:207987/1‑149 (MQ=255) gcCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCt < 7:39886/131‑1 (MQ=255) gcCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCt > 8:39886/1‑131 (MQ=255) ccTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGGGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATGGCTTCGc < 4:338976/149‑1 (MQ=255) gTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATGGCTTCGCTg < 2:118531/147‑1 (MQ=255) gTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATGGCTTCGCTg < 6:286993/147‑1 (MQ=255) tGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATGGCTTCGCTGGAg < 6:245616/149‑1 (MQ=255) | TTTTGGAAAAAATCGGGCAGCTCGGTGGCATAAGCTTATAGCAAACCACAAGAGGCTGTTGCCATGCGCGACTCCCACCACAACACCGGTTT‑TTCCACGCGGGCCATTCATCATGGCTATGACCCGCTTTCCCATGGTGGCGCCCTGGTGCCACCGGTGTACCAGACG‑GCTACCTATGCCTTCCCCACTGTCGAGTACGGTGCTGCCTGCTTCGCCGGGGAGGAGCCTGGGCATTTCTACAGCCGCATTTCCAACCCCACGCTGGCCTTGCTGGAGCAGCGCATGGCTTCGCTGGAG > NC_002947/1495509‑1495805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |