| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,607,040 | T→C | 6.3% | H165R (CAC→CGC) | PP_1408 ← | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,607,040 | 0 | T | C | 6.3% | 180.9 / 2.6 | 63 | H165R (CAC→CGC) | PP_1408 | (R)‑3‑hydroxydecanoyl‑ACP:CoA transacylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/31); new base C (2/2); total (30/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
CGGGATGTTGATATTGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGG > NC_002947/1606892‑1607188 | cGGGATGTTGATATTGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGt < 7:105175/149‑1 (MQ=255)cGGGATGTTGATATTGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGt > 5:232270/1‑149 (MQ=255) gATGTTGATATTGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCt > 3:95861/1‑149 (MQ=255) ttGATATTGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGc < 7:166073/148‑1 (MQ=255) tatTGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGCACTTGCCgtcg < 6:49974/149‑4 (MQ=255) ttGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGgt < 4:95861/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCTTTCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCa < 6:9715/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCtt > 2:277262/1‑136 (MQ=255) gcgcgcCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCtt < 1:277262/136‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGATCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCAtt > 1:72241/1‑149 (MQ=255) cgcCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAGCCGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCAtt < 1:27593/149‑1 (MQ=255) gcCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGa > 7:191783/1‑149 (MQ=255) cAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGt < 3:138352/149‑1 (MQ=255) cgcACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGc < 8:191783/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGAcc < 8:99825/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGa > 7:187840/1‑148 (MQ=255) cAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGAt < 5:228902/149‑1 (MQ=255) ggTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATaa < 4:95373/149‑1 (MQ=255) gTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGt > 3:128166/1‑149 (MQ=255) tCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCg > 4:142890/1‑147 (MQ=255) tCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCg > 3:343100/1‑147 (MQ=255) ccAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTCAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAg > 7:275273/1‑149 (MQ=255) cAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGa > 5:316403/1‑131 (MQ=255) cAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGa < 6:316403/131‑1 (MQ=255) tGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGc < 5:205447/93‑1 (MQ=255) tGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGc > 6:205447/1‑93 (MQ=255) aTGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTg > 3:229857/1‑149 (MQ=255) aTGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTg < 3:142890/149‑1 (MQ=255) tgtgGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTgg > 3:365966/1‑149 (MQ=255) tgtgGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTgg < 4:345220/149‑1 (MQ=255) gAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAggcg < 3:80555/133‑1 (MQ=255) gAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAggcg > 4:80555/1‑133 (MQ=255) aGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTCAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCa < 8:275273/149‑1 (MQ=255) gTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCAtt > 6:112222/1‑96 (MQ=255) gTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCAtt < 5:112222/96‑1 (MQ=255) tGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACg < 8:55184/149‑1 (MQ=255) cATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGTCCAGGTACTGGCAGCCACGGt > 8:72245/1‑149 (MQ=255) cATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGt < 4:128166/149‑1 (MQ=255) tgCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGAGCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCa < 3:241784/139‑1 (MQ=255) tgCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTcc < 4:229857/145‑1 (MQ=255) tgCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTcc < 2:72241/145‑1 (MQ=255) tgCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGACGATGGTGTCATTGCCCAGGTTGCCGATCTGATAACGGTCCCAGCCGGCCAGCTACTgccagcca > 4:241784/1‑139 (MQ=255) gTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGt < 6:232270/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATc < 2:212433/142‑1 (MQ=255) cAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATc > 1:212433/1‑142 (MQ=255) tgctCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGAt > 1:9247/1‑148 (MQ=255) tCACATGGTGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACt > 8:80408/1‑149 (MQ=255) tCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGGTAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACt > 2:238194/1‑149 (MQ=255) acaTGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCa > 7:23460/1‑118 (MQ=255) acaTGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCa < 8:23460/118‑1 (MQ=255) acaTGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCgcgc > 2:6198/1‑129 (MQ=255) acaTGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCgcgc < 1:6198/129‑1 (MQ=255) cGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAgaa > 3:138112/1‑149 (MQ=255) gTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAgaacgaac < 7:80408/149‑1 (MQ=255) gTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAgaacgaa < 4:365966/148‑1 (MQ=255) gAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGcc < 4:138112/148‑1 (MQ=255) gAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCct > 4:115533/1‑149 (MQ=255) gAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCct > 4:268807/1‑149 (MQ=255) aG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGGTAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCcttctt < 1:238194/149‑1 (MQ=255) catcGGCAAGCACTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCa > 2:68092/4‑149 (MQ=255) cGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACg > 3:19226/1‑54 (MQ=255) cGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACg < 4:19226/54‑1 (MQ=255) cGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCa > 7:98414/1‑149 (MQ=255) atcGGCAAGCACTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTg < 2:49584/137‑1 (MQ=255) atcGGCAAGCACTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTg > 1:49584/3‑139 (MQ=255) tGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCgg < 2:9247/149‑1 (MQ=255) tGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCgg < 8:88473/149‑1 (MQ=255) | CGGGATGTTGATATTGCGCGCGCCTTGCAGCGCACGTTCCAGGTCGTGCTCCAGCACCTGGTTGATGTGGAAGTGCATCTGTGCGTACTCGTGGCTGTCCAGGCTGCTCACATGGCGGTAGTTGAAGCGTTTGAACAG‑CGACGGCAAGTGCTTGCCGATGGTGTCATTGACCAGGTTGCCGACCTGATAACGGTCGCAGGCGGCCAGGTACTGGCAGCCACGGTCCAGATAGTCGCGCATCGGCTCGTTGATCACTGGCGAGAACGAACTCACCACTGCCTTCTTCACGTACCGCGG > NC_002947/1606892‑1607188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |