| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,744,888 | T→A | 8.0% | intergenic (‑14/+327) | PP_1542 ← / ← PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,744,888 | 0 | T | A | 8.0% | 218.8 / 6.8 | 74 | intergenic (‑14/+327) | PP_1542/PP_1543 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/34); new base A (3/3); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.62e-01 | |||||||||||
GGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCA > NC_002947/1744746‑1745028 | ggCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCg < 4:324644/148‑1 (MQ=255) gCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGgt > 5:158898/1‑149 (MQ=255) tcgtcATAGCGTGGTCTGGTGAGGAATTGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCTGTCCCAAGGTGTTCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACGGGCCAAGCCGgtgct < 2:141025/149‑3 (MQ=255) gtcATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAATGTGTTCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt < 6:296846/149‑1 (MQ=255) gtcATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt > 2:259939/1‑149 (MQ=255) gcctggcctgGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGa < 3:232052/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGACTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTgg < 8:348268/132‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGACTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTgg > 7:348268/1‑132 (MQ=255) tGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg < 1:122063/124‑1 (MQ=255) tGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg > 2:122063/1‑124 (MQ=255) ggTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGTCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTtata < 5:293199/142‑1 (MQ=255) ggTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCACAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTATCCATGCAAGCACCGGCTTGGGCGGTGTTGTGCCTGATa > 6:293199/1‑142 (MQ=255) gTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAAt > 8:117601/1‑149 (MQ=255) gAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAAtt > 5:298553/1‑148 (MQ=255) ggAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa < 4:226347/149‑1 (MQ=255) ggAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgct < 6:188828/127‑3 (MQ=255) ggAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCCAAGCCGgtgct > 5:188828/1‑125 (MQ=255) gAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa < 8:334955/148‑1 (MQ=255) gAAATCGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTaa > 7:334955/1‑148 (MQ=255) gTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCAt < 4:219108/148‑1 (MQ=255) tGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAGGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt > 2:48341/1‑117 (MQ=255) tGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCACGCACCGGCTTGGCCGGtgttgt < 1:48341/117‑1 (MQ=255) tGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGt > 5:63939/1‑149 (MQ=255) ttGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCTAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGGATTTGGGTTa > 2:249409/1‑149 (MQ=255) gCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTatt > 4:251685/1‑149 (MQ=255) gCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTat < 7:117601/148‑1 (MQ=255) cGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattga < 1:17132/149‑1 (MQ=255) gTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg > 8:273943/1‑98 (MQ=255) gTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTg < 7:273943/98‑1 (MQ=255) gTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattgatt < 2:88393/149‑1 (MQ=255) gTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTattgatt > 2:159823/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGt < 6:158898/148‑1 (MQ=255) cGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGt > 3:192970/1‑148 (MQ=255) aTCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATAc > 1:215326/1‑149 (MQ=255) cGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTg > 1:113417/1‑127 (MQ=255) cGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTg < 2:113417/127‑1 (MQ=255) cGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGt < 4:192970/149‑1 (MQ=255) gTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACgaga < 2:215326/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTggg < 7:275238/117‑1 (MQ=255) cAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTggg > 8:275238/1‑117 (MQ=255) gtgtGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATTCCAGTCAACGAGATGAATAcc > 5:274442/1‑149 (MQ=255) tgtgCCAGAGCAAGTAGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATAccc < 6:63939/149‑1 (MQ=255) tgCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGa > 3:250260/1‑149 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATg < 1:159823/149‑1 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATg > 6:104287/1‑149 (MQ=255) ccAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGACAACGAGATGAATACCCGATg < 3:251685/149‑1 (MQ=255) cAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATAc > 2:90908/1‑123 (MQ=255) gctgctTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGAt > 4:96520/1‑70 (MQ=255) ctcGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa < 4:250260/148‑1 (MQ=255) ggTGGCTTCGATCTTGGCTTTCTCCATGCAATCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGTCAATTTAATGGCATTTGTGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAg < 1:249409/146‑1 (MQ=255) tGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAAt > 6:328194/1‑149 (MQ=255) tctaTCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGACGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgca < 5:277965/145‑1 (MQ=255) cGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgcag < 1:354684/148‑1 (MQ=255) aTCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCGTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGcagcag > 2:1757/1‑149 (MQ=255) tCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgca > 6:277965/1‑144 (MQ=255) gCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCtctc < 5:104287/148‑1 (MQ=255) cATGCAAGCACCGGCCTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATtg < 1:1757/147‑1 (MQ=255) aTGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCgcag > 8:3243/1‑131 (MQ=255) aTGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATtga > 7:203689/1‑147 (MQ=255) aTGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATtga < 8:203689/147‑1 (MQ=255) tGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATtgatga < 5:328194/149‑1 (MQ=255) gCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAg > 4:239350/1‑149 (MQ=255) cAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAgg < 7:49205/149‑1 (MQ=255) acaacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAg > 4:263667/5‑148 (MQ=255) acaacACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAg > 8:288181/5‑148 (MQ=255) aaGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgcg < 3:325295/103‑1 (MQ=255) aaGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGa > 1:346583/1‑149 (MQ=255) aaGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAAACAGGAAATCGCAGAAGCTCTCGGCAATGATGAGGa > 8:105205/1‑149 (MQ=255) aaGCACCGGCTTCGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACcgcg > 4:325295/1‑103 (MQ=255) cACCGGCCAAGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCa < 7:288181/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa < 7:92942/110‑1 (MQ=255) cGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCa > 8:92942/1‑110 (MQ=255) gCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAgg > 8:151452/1‑110 (MQ=255) gCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAgg < 7:151452/110‑1 (MQ=255) ttGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCAttt > 5:6641/1‑42 (MQ=255) ttGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCAttt < 6:6641/42‑1 (MQ=255) | GGCGTCGTCATAGCCTGGGCTGGTGAGGAAATGGTTTCTGTTGCCGGTACGGCATCCCGGGTTCAGTCCCAAGGTGTGCCAGAGCAAGTCGAGCTGCTTCTCGGTGGCTTCGATCATGGCTTTCTCCATGCAAGCACCGGCTTGGCCGGTGTTGTGCCTGATAGTGGCAATTTAATGGCATTTGGGTTATTGATTGTAATACCAGTCAACGAGATGAATACCCGATGGACCGCGAGCCAACAAACCAGGAAATCGCAGCAGCTCTCGGCATTGATGAGGATCA > NC_002947/1744746‑1745028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |