| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,290,398 | A→G | 6.7% | intergenic (+23/‑252) | pepN → / → PP_2018 | aminopeptidase N/BNR domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,290,398 | 0 | A | G | 6.7% | 353.6 / 11.2 | 121 | intergenic (+23/‑252) | pepN/PP_2018 | aminopeptidase N/BNR domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/54); new base G (5/3); total (62/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACCCACCAA > NC_002947/2290254‑2290543 | cacGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCg < 1:317520/148‑1 (MQ=255) acGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGc > 4:300826/1‑149 (MQ=255) acGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGc > 3:316893/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCCGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAAGTCTGTTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGacc > 1:365395/1‑149 (MQ=255) tGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTCAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCTGGGCGGccc‑‑c < 1:275120/148‑1 (MQ=255) gcgcAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCTCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGATTTGTCCAGTGTTGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCTGGGCGGccc‑‑caa < 3:97416/148‑3 (MQ=255) gcgcAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑Cgg < 3:285096/148‑1 (MQ=255) gcAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCtt > 2:227916/1‑149 (MQ=255) aaaGTATGACTATTCGGGTCAGTGGGTTATGAAGGGTTAGCTTTATCGCATTCTGGCTTCGGGTTAGTTGTCCATTTATGTGTATGAGGTTGTCTGCAAGAGTCTGGCTTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCAAGCGGCCC‑‑CGGCttt < 4:178742/148‑1 (MQ=255) gTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTccc > 3:288212/1‑149 (MQ=255) tGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCgg < 6:120721/149‑1 (MQ=255) gACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGc > 7:308042/1‑149 (MQ=255) gATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGa > 2:117245/1‑149 (MQ=255) tGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGac > 2:1688/1‑148 (MQ=255) gTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGAcaacaa > 6:254871/1‑148 (MQ=255) gTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACaaa < 2:297211/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACaaa < 3:300826/149‑1 (MQ=255) tCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACaaaa > 8:6093/1‑149 (MQ=255) aGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACa > 8:220353/1‑149 (MQ=255) cgcTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGAAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTTAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATaa < 3:209762/149‑1 (MQ=255) gcTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATaa > 1:66680/1‑148 (MQ=255) tgatgaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCTGGGCGGccc‑‑caa < 4:345192/119‑3 (MQ=255) atgaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACAcc < 1:294864/148‑1 (MQ=255) gaAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACcccg > 3:7672/1‑149 (MQ=255) gggTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACcccgccc > 2:37386/1‑149 (MQ=255) gggTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGACGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCCGCCGACAACAAAACATAACACcccgccc > 6:136645/1‑149 (MQ=255) tGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGtt > 4:272724/1‑149 (MQ=255) tGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGtt < 3:148303/149‑1 (MQ=255) cggattcaGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACcccgcccg < 2:4374/139‑1 (MQ=255) aGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTccc < 1:227916/149‑1 (MQ=255) aGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTccc > 7:133887/1‑149 (MQ=255) aTTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCaaa < 1:249157/149‑1 (MQ=255) aTTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCaaa > 7:139602/1‑149 (MQ=255) tGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATc > 2:158489/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACAt < 1:1688/146‑1 (MQ=255) gCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATccc < 4:316893/149‑1 (MQ=255) gCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATcc < 5:254871/148‑1 (MQ=255) gCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATcc < 1:117245/148‑1 (MQ=255) cTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATcccc > 3:80030/1‑149 (MQ=255) ttCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTATATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTACCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCCTTGTACTCCCGCAAACATCCCCg > 7:233531/1‑149 (MQ=255) gAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACACACGCAAACATCCCCGcaccga > 6:272621/1‑143 (MQ=255) aGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAt < 5:87076/148‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAtctc < 2:66680/149‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAtctc > 7:329056/1‑149 (MQ=255) tGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAtctc < 1:158489/148‑1 (MQ=255) ggcccgTGAGGTGAATGCGGTGGTGAGCTCGAGTCTGGCGTATTTCTGGTGAATTGGGCCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAtctcgt < 2:365395/144‑3 (MQ=255) ctgtgtTGTGTATGAGGTTGTGACCAAGAGTCTGGCGTATTTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCTGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCaa < 2:331519/147‑1 (MQ=255) aGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACCCCCCGCCCGTTGTACGCCCGCCAACTTCCCCGCTACGATAGCGTCAAg > 8:248009/1‑149 (MQ=255) aGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAg < 7:220353/149‑1 (MQ=255) aTGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTa < 4:7672/148‑1 (MQ=255) tATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCCTACGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCCCTACGATCTCCTCAAGCTATTg > 1:291616/1‑148 (MQ=255) tATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCa < 8:133887/148‑1 (MQ=255) tATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAg < 7:6093/149‑1 (MQ=255) tATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAg > 1:219828/1‑149 (MQ=255) tATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAg > 2:301271/1‑149 (MQ=255) tGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGc > 5:9449/1‑149 (MQ=255) aGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCct < 2:219828/149‑1 (MQ=255) gTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAACCTATTGCAGGCctct < 8:78095/149‑1 (MQ=255) ttGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTa < 1:214486/149‑1 (MQ=255) gAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTccc > 4:255938/1‑100 (MQ=255) aGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCctct < 5:236354/143‑1 (MQ=255) aGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCctct > 6:236354/1‑143 (MQ=255) gCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAg > 5:169598/1‑149 (MQ=255) gCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAg > 2:202295/1‑149 (MQ=255) tCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCa < 7:175525/141‑1 (MQ=255) tCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCa > 8:175525/1‑141 (MQ=255) tCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAgg < 6:305872/143‑1 (MQ=255) tCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCt < 8:100868/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCt < 7:7181/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGTAATTCTGGTCAATTGGGCCCGCCCCGCGCCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCCACAAAAAAACAAAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTCCGATCTCCTCACGCTTTTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCt < 4:80030/149‑1 (MQ=255) gCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCa > 7:47340/1‑148 (MQ=255) cGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCaaa < 7:192519/149‑1 (MQ=255) tAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTccc > 8:277390/1‑84 (MQ=255) tAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTccc < 7:277390/84‑1 (MQ=255) tAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCa > 4:190888/1‑121 (MQ=255) tAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCa < 3:190888/121‑1 (MQ=255) aTTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCt < 8:329056/149‑1 (MQ=255) tGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCaa > 2:229761/1‑149 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGa > 7:289628/1‑123 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCaa < 1:111836/147‑1 (MQ=255) gTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATg > 1:332057/1‑149 (MQ=255) tGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGc < 8:233531/149‑1 (MQ=255) aaTTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAt < 1:229761/149‑1 (MQ=255) ttGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCAtt > 3:253973/1‑148 (MQ=255) ttGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTg < 1:57083/149‑1 (MQ=255) ttGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTg < 6:9449/149‑1 (MQ=255) cggggCCGCTGGGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGa > 6:138139/2‑149 (MQ=255) ggggCCGCTGGGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCGGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGAc > 3:77095/1‑149 (MQ=255) ggggCCGCTGGGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATAGAc > 4:123766/1‑149 (MQ=255) ggggCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGa < 8:300402/148‑1 (MQ=255) gggCCGCTGGGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGAcc > 8:145730/1‑149 (MQ=255) gggCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCTCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGAc < 1:301271/148‑1 (MQ=255) gggCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGAtctc > 5:227564/1‑91 (MQ=255) ggCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAg > 7:238705/1‑131 (MQ=255) ggCCGCCCAGCGGCCC‑‑AGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAg < 8:238705/131‑1 (MQ=255) gccgccCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACcca > 2:334562/1‑149 (MQ=255) cgccCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACccacc < 1:37386/149‑1 (MQ=255) gccCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACccacc > 7:78616/1‑148 (MQ=255) cccAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACccacc > 1:132535/1‑147 (MQ=255) ccAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACCCACCaa > 4:274052/1‑148 (MQ=255) | CACGCTGGCGCAAGTATGACGATGCGCGTCAGGCGCTGATGAAGGGTGAGCTGGAGCGCATTCTGGCTTCGGGTGAGTTGTCCAGTGATGTGTATGAGGTTGTGAGCAAGAGTCTGGCGTAATTCTGGTGAATTGGGGCCGCCCAGCGGCCC‑‑CGGCTTTCCCCGGCCGACAACAAAACATAACACCCCGCCCGTTGTACTCCCGCAAACATCCCCGCTACGATCTCCTCAAGCTATTGCAGGCCTCTAGATCAGGCTTTCTGCAAAGCCTGCAATGCATTGACCCACCAA > NC_002947/2290254‑2290543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |