| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,350,692 | A→G | 5.1% | S967G (AGC→GGC) | PP_2065 → | multidrug RND transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,350,692 | 0 | A | G | 5.1% | 365.0 / 6.5 | 119 | S967G (AGC→GGC) | PP_2065 | multidrug RND transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/51); new base G (3/3); total (65/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGCGCGGGCGAGGCA > NC_002947/2350545‑2350840 | cTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACACCCTCGATCGTGCTGCAGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAg > 7:265501/1‑149 (MQ=255)cTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCa < 2:80722/148‑1 (MQ=255)cTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAg > 8:325247/1‑149 (MQ=255) gATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACAGCTGTTCGCCAgcg > 5:241063/1‑149 (MQ=255) tggtggCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAgcggc < 8:235102/149‑1 (MQ=255) gtggCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAgcggcg < 1:363509/148‑1 (MQ=255) gCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGcggcgccgg > 4:130132/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGcggcgccgg‑cg < 3:130132/149‑1 (MQ=255) gTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGcggcgccgg‑cg > 7:53350/1‑149 (MQ=255) ttCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGcggcgccgg‑cgc > 4:132975/1‑149 (MQ=255) aaCGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCGGcgccgctgg‑cgaacagca < 8:24255/149‑8 (MQ=255) aaCGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGAGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGTCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGACAAAAg > 8:347000/1‑149 (MQ=255) gagaTTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCg > 3:259835/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCGATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGc < 2:191562/144‑1 (MQ=255) aTTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGAAGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGc > 1:191562/1‑144 (MQ=255) tCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTc < 8:53350/148‑1 (MQ=255) ggTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGt < 7:325247/149‑1 (MQ=255) tGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCCACAGCAGTTTCGGGGTg > 5:46474/1‑149 (MQ=255) tcAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTACGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGggtg < 6:287665/148‑1 (MQ=255) aaCCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGggtggt < 8:248102/149‑1 (MQ=255) aaCCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGAGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGggtggt < 5:182765/149‑1 (MQ=255) ccTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCCCGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGa > 1:104321/1‑149 (MQ=255) ccTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGa > 8:218590/1‑149 (MQ=255) cTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGAt > 5:150913/1‑149 (MQ=255) cTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGAt > 1:331067/1‑149 (MQ=255) gATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGAtt < 7:218590/147‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGggt < 4:195897/136‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGggt > 3:195897/1‑136 (MQ=255) gTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGc < 2:159468/149‑1 (MQ=255) ctgcCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAgc > 4:211746/1‑98 (MQ=255) gccgccATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGAt > 2:278669/1‑149 (MQ=255) ccgccATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATg < 2:331067/149‑1 (MQ=255) ccgccATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATg > 3:346359/1‑149 (MQ=255) gccATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAAGCTTTTGGCGTGATGCCAGTCCTGTACGCCCGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATg > 1:105970/1‑149 (MQ=255) gccATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑t < 4:132274/149‑1 (MQ=255) ccATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑tg > 1:260070/1‑149 (MQ=255) aTTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑tggt < 6:241063/149‑1 (MQ=255) gTTCGTGTGGCGCAAATAGGCTTGCGGCCAGTGCTGATGAGCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑tggtgg < 6:46474/148‑1 (MQ=255) gTTCGTGCGGCGGAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGGGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGGCCGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑tggtg < 1:278669/148‑1 (MQ=255) ttCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTggg > 6:297141/1‑148 (MQ=255) gTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGAGGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGacc < 7:347000/149‑1 (MQ=255) cggcgCAAATAGGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGGGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGGTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGacctt < 8:316271/148‑1 (MQ=255) gcgcAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGaccttgt > 3:93706/1‑148 (MQ=255) cgcAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGaccttgtt > 5:306322/1‑148 (MQ=255) gcAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGaccttgttca > 2:235490/1‑149 (MQ=255) gcAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGaccttgttca > 4:102503/1‑149 (MQ=255) cGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGaccttgttcaccttgt < 5:297141/148‑1 (MQ=255) gCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGa > 6:43871/1‑132 (MQ=255) gCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGa < 5:43871/132‑1 (MQ=255) ttGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTggg > 6:352140/1‑98 (MQ=255) ttGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTggg < 5:352140/98‑1 (MQ=255) ttGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑tggtgg > 4:121805/1‑127 (MQ=255) ttGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑tggtgg < 3:121805/127‑1 (MQ=255) ctcGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGt < 2:32801/146‑1 (MQ=255) cGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTgggg < 7:117606/126‑1 (MQ=255) cGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTgggg > 8:117606/1‑126 (MQ=255) ggCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAG‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGt > 1:32801/1‑146 (MQ=255) ccAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTAcc > 4:239314/1‑149 (MQ=255) tGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACcgac > 1:345356/1‑148 (MQ=255) tgatgaCCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATc > 7:1160/1‑149 (MQ=255) atgaCCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTa > 3:210900/1‑149 (MQ=255) atgaCCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTa < 3:172574/149‑1 (MQ=255) atgaCCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTAGTGCTACCGACGATCTa > 4:317174/1‑149 (MQ=255) aCCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGc > 3:181841/1‑149 (MQ=255) cACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGggtggt < 5:51400/84‑1 (MQ=255) cACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGggtggt > 6:51400/1‑84 (MQ=255) cACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGacctt > 2:229705/1‑114 (MQ=255) cACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGacctt < 1:229705/114‑1 (MQ=255) gcgATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCctggctgg > 6:34558/1‑148 (MQ=255) gATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCAc < 3:102503/149‑1 (MQ=255) aTGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTTTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACTCCTGGCTGGCAcg < 4:93706/149‑1 (MQ=255) tGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGaccttgttca < 3:107304/108‑1 (MQ=255) tGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCAcgc < 3:317174/149‑1 (MQ=255) cTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGAt < 5:98922/149‑1 (MQ=255) ttttGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGAt > 3:184495/1‑148 (MQ=255) ttttGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGATGGCACGCGAt > 4:130775/1‑148 (MQ=255) ttGGCGTGCGTCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGCCTTGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGa < 1:106463/147‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCgg < 3:129978/149‑1 (MQ=255) gCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCgg > 2:215179/1‑149 (MQ=255) gCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCgg < 1:215179/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCgg > 3:91567/1‑50 (MQ=255) gTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCgg < 4:91567/50‑1 (MQ=255) ctgcCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGa < 2:345356/148‑1 (MQ=255) ctgcCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAg > 7:274438/1‑149 (MQ=255) ctgcCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAg > 7:86215/1‑149 (MQ=255) gcCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGAGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCa > 3:99684/1‑149 (MQ=255) ccACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGTTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCAc > 6:70745/1‑149 (MQ=255) ccACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCAcgcg < 4:222751/133‑1 (MQ=255) ccACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGC‑CGCCAACAGCCGTTTAGGGTTGGTGGTGGTGATTGTGTGAGGGATGC‑‑TGGTGGGGacctt > 4:83230/1‑86 (MQ=255) cACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACg < 1:235490/149‑1 (MQ=255) aCTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACgg > 3:87398/1‑149 (MQ=255) gctgTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGgcgc > 2:25122/1‑149 (MQ=255) gttggcGCCGGCGCCGCTGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGa < 1:8549/134‑1 (MQ=255) gTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGCGCggg > 1:318268/1‑149 (MQ=255) ttCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGCGCggg < 4:184495/148‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGCGCGGGc > 3:68296/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGCGCGGGCGAg > 7:347067/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGcgcg > 2:179981/1‑141 (MQ=255) cAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGcgcg < 1:179981/141‑1 (MQ=255) aGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGCGCGGGCGAGGCa < 2:104321/149‑1 (MQ=255) | CTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGA‑‑CTTTTGGCGTGCTGCCACTGCTGTTCGCCAGCGGCGCCGG‑CGCCAACAGCCGTTTCGGGTTGGGGGTGGTGATTGTGTGCGGGATGC‑‑TGGTGGGGACCTTGTTCACCTTGTTCGTGCTACCGACGATCTACGCCTGGCTGGCACGCGATCACCGGGTGAGCACGGCGCGGGCGAGGCA > NC_002947/2350545‑2350840 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |