| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,371,613 | G→T | 6.4% | A1477A (GCG→GCT) | gdhB → | NAD‑specific glutamate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,371,613 | 0 | G | T | 6.4% | 297.6 / 8.6 | 93 | A1477A (GCG→GCT) | gdhB | NAD‑specific glutamate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/46); new base T (3/3); total (44/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.81e-01 | |||||||||||
CGATACCGCGCACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCAGCAACCTGCCGG > NC_002947/2371466‑2371761 | cgATACCGCGCACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCgg < 7:85658/149‑1 (MQ=255) aCCGCGCACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTAc > 6:66567/1‑149 (MQ=255) ccGCGCACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTAcc < 6:103457/149‑1 (MQ=255) cgcgCACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCAGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCa < 3:136603/149‑1 (MQ=255) cgcACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGCCGCCGGTGTGGCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTCCCAGc > 5:300992/1‑149 (MQ=255) gcACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCa < 8:11590/146‑1 (MQ=255) gcACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCa > 7:11590/1‑146 (MQ=255) aCTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCAc < 6:317530/149‑1 (MQ=255) ttCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCt > 4:19404/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCt > 2:121273/1‑149 (MQ=255) cGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCt < 2:48678/147‑1 (MQ=255) cGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTg < 4:355778/148‑1 (MQ=255) gggCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCTGGTACCCGCCAccata < 1:297066/148‑4 (MQ=255) ggCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTa > 1:98670/1‑148 (MQ=255) gCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCTGGTACCCGCCAccatacgc < 2:296651/149‑7 (MQ=255) gAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCgg > 8:167240/1‑128 (MQ=255) gAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCgg < 7:167240/128‑1 (MQ=255) gAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGcc > 5:359080/1‑137 (MQ=255) gAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGcc < 6:359080/137‑1 (MQ=255) aaGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGGTGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTa > 8:209680/1‑143 (MQ=255) aaGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGGTGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTa < 7:209680/143‑1 (MQ=255) gcAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGa < 1:311192/149‑1 (MQ=255) gCTGTGTCTGATGCTGTATGAGCTGCTCGAAGGCCCTTCTCGCGTACGCTGTATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGAGGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGTGTACCATCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCa < 7:134247/149‑1 (MQ=255) gCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCa < 1:181077/149‑1 (MQ=255) gCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCa < 2:90618/149‑1 (MQ=255) ggTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAt‑t < 6:139950/147‑1 (MQ=255) tCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAg > 5:140913/1‑149 (MQ=255) tCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAg > 3:337974/1‑149 (MQ=255) tCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAg > 2:32326/1‑149 (MQ=255) tGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCAACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCg > 1:210157/1‑149 (MQ=255) aGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGc < 4:337974/148‑1 (MQ=255) gCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCa > 1:125396/1‑110 (MQ=255) gCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCa < 2:125396/110‑1 (MQ=255) gCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGcc > 8:355540/1‑148 (MQ=255) tGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGAc > 3:245994/1‑149 (MQ=255) gATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGt < 2:98670/149‑1 (MQ=255) cctGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGATACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGt > 7:259398/3‑149 (MQ=255) aTGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTAGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTg > 7:56013/1‑149 (MQ=255) gctgctCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCg > 7:323182/1‑149 (MQ=255) ctgctCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCgg < 4:188659/149‑1 (MQ=255) tgctCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGc < 6:140913/149‑1 (MQ=255) ctCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCt < 8:248532/104‑1 (MQ=255) ctCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCt > 7:248532/1‑104 (MQ=255) ctCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCa > 4:31355/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCacc > 1:253275/1‑147 (MQ=255) taaGGCCCTACCCGCTAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACTTTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCAt < 8:56013/146‑1 (MQ=255) gAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTAGGAGGGCTTTGTGGACGGCGGTGTGCAGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGa < 8:259398/149‑1 (MQ=255) gAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCAt > 1:112023/1‑147 (MQ=255) aGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGc < 7:355540/149‑1 (MQ=255) aGGACCTACCCCCGAACGCTGGATGCTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGc < 6:300992/149‑1 (MQ=255) gCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCt < 5:66567/149‑1 (MQ=255) cccTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTg < 3:19404/149‑1 (MQ=255) cccGCGAAGGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAg < 5:112981/149‑1 (MQ=255) cccGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAg > 8:187517/1‑149 (MQ=255) ccGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAg < 7:145133/139‑1 (MQ=255) ccGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAg > 8:145133/1‑139 (MQ=255) ccGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAgg > 8:352472/1‑149 (MQ=255) cgcgAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGt < 2:101320/149‑1 (MQ=255) cgcgAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGt < 8:323182/149‑1 (MQ=255) cgcgAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGt > 2:36500/1‑149 (MQ=255) gcgAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTg > 2:118730/1‑149 (MQ=255) gcgggATGGTCCGCTACCTGGGCTTTGGCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAg < 4:48650/146‑1 (MQ=255) gCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCgg < 6:215050/111‑1 (MQ=255) gCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCgg > 5:215050/1‑111 (MQ=255) gATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCAt > 3:87355/1‑149 (MQ=255) gATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCAt < 2:112023/149‑1 (MQ=255) aTGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCATGTCGTACGGGCCGCCGTGACCGGCCATGAGCATCGCCAGGTGGCAAAGGCa > 1:123972/1‑149 (MQ=255) 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cGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACGCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGc > 1:117614/1‑134 (MQ=255) cGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGc < 2:117614/134‑1 (MQ=255) cGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCg < 4:229168/148‑1 (MQ=255) ccAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTgg < 4:143346/149‑1 (MQ=255) gggCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTggg > 6:29005/1‑147 (MQ=255) tCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTgg < 7:179761/138‑1 (MQ=255) tCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTgg > 8:179761/1‑138 (MQ=255) cGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGGATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTgg < 1:155753/149‑1 (MQ=255) cGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGgacc > 8:285544/1‑149 (MQ=255) ggTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGgacctgac > 3:177933/1‑149 (MQ=255) tgCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTgg < 7:213704/149‑1 (MQ=255) tgCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTgg < 7:285544/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCa < 1:214689/148‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAg < 4:177933/148‑1 (MQ=255) tGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGa > 8:292247/1‑148 (MQ=255) gcgcGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAAt < 3:31355/149‑1 (MQ=255) gcgcGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAAt > 1:2434/1‑149 (MQ=255) cgatctggtggCTGGTACCCGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCa < 3:54343/144‑1 (MQ=255) tATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTgg < 5:187987/130‑1 (MQ=255) tATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTgg > 6:187987/1‑130 (MQ=255) tggtggCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCAGCAAc > 7:69867/1‑149 (MQ=255) aggtggCTGGTACCCGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCAGCAAc > 5:155392/2‑149 (MQ=255) aggtggCTGGTACCCGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACAGGCCATGAGCCAGCGCAGGTGGACAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGCACCTGACATGGTACCTGCAGTAAATCAGCAAc > 7:118538/2‑149 (MQ=255) gtggCTGGTACCCGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCa > 4:54343/1‑142 (MQ=255) gggTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCAGCAACCTGCCgg > 2:1419/1‑149 (MQ=255) gggTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCAGCAACCTGCCgg < 7:292247/149‑1 (MQ=255) | CGATACCGCGCACTTCGGGCCGAAGATCGCGCAGCTGGGTCTGAAGCTGGATGAGCTGCTCGAAGGCCCTACCCGCGAACGCTGGATGGTCCGCTACCAGGGCTTTGTCGACGCCGGTGTGCCGGAGTTGCTGGCGCGTATGGTGGCGGGTACCAGCCACCTGTACACCCTGCTGCCGATCAT‑T‑GAAGCGGCCGACGTGACCGGCCATGAGCCTGCGCAGGTGGCCAAGGCATTCTTCGCCGTGGGCAGCGCGCTGGACCTGACCTGGTACCTGCAGGAAATCAGCAACCTGCCGG > NC_002947/2371466‑2371761 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |