Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,774,812 | G→A | 5.6% | P234S (CCA→TCA) ‡ | PP_5521 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,774,812 | 0 | G | A | 5.6% | 278.1 / 3.5 | 89 | P234S (CCA→TCA) ‡ | PP_5521 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/40); new base A (3/2); total (47/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.93e-01 |
TCCAGAACAAGATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAACCTGGCGGCAACCC > NC_002947/2774664‑2774959 | tCCAGAACAAGATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTgg > 4:64876/1‑149 (MQ=255) cAGAACAAGATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGgca < 4:289905/149‑1 (MQ=255) aGAACAAGATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTgg > 5:245988/1‑146 (MQ=255) aGAACAAGATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTgg < 6:245988/146‑1 (MQ=255) aGATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGCCACAGCAGGca < 2:308294/149‑2 (MQ=255) gATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGa < 3:77668/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTc < 2:257158/148‑1 (MQ=255) ggCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCa > 1:71759/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCa > 2:357546/1‑149 (MQ=255) cTGCCTTGCTCACCCACGACGATCACCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCAcc > 6:66222/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGa > 7:123188/1‑139 (MQ=255) gCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGa < 8:123188/139‑1 (MQ=255) ccTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCtt < 8:89449/148‑1 (MQ=255) ccTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCt < 2:71759/147‑1 (MQ=255) ttGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAg > 7:126340/1‑149 (MQ=255) gCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCTGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTg > 1:303859/1‑149 (MQ=255) gCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGt < 1:357546/148‑1 (MQ=255) aCCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGc > 6:118764/1‑147 (MQ=255) aCCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGc > 1:371418/1‑147 (MQ=255) cccACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGc > 1:112454/1‑146 (MQ=255) cccACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGc < 2:112454/146‑1 (MQ=255) acgaTCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGaa < 5:156320/149‑1 (MQ=255) acgaTCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCGGAGGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCCTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCCCCGTGAGTGGCCAGTACg > 7:296144/1‑147 (MQ=255) cgaTCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAg < 3:272933/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATa > 5:104010/1‑149 (MQ=255) aGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATAcc < 6:104010/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCt > 3:316814/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCt > 6:274448/1‑149 (MQ=255) ggCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCg < 7:253993/149‑1 (MQ=255) gCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCgg > 1:189720/1‑149 (MQ=255) cATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGgcg > 1:107170/1‑149 (MQ=255) aTCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTa > 7:35763/1‑131 (MQ=255) aTCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTa < 8:35763/131‑1 (MQ=255) cgccgACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTc < 5:118764/148‑1 (MQ=255) gccgACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCAc > 5:285332/1‑149 (MQ=255) acacCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTAc < 1:174194/124‑1 (MQ=255) acacCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTAc > 2:174194/1‑124 (MQ=255) cacCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACcagc‑a < 5:66222/149‑1 (MQ=255) cacCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACcagc‑a < 4:72971/149‑1 (MQ=255) cGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGACCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTa > 1:65029/1‑149 (MQ=255) catgctccatgctcAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGc > 3:311453/1‑149 (MQ=255) catgctcAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGa < 1:212141/97‑1 (MQ=255) catgctcAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGa > 2:212141/1‑97 (MQ=255) catgctcAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCAt > 5:184238/1‑149 (MQ=255) tcAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCggg > 2:133491/1‑148 (MQ=255) cAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGc < 5:24641/96‑1 (MQ=255) cAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGc > 6:24641/1‑96 (MQ=255) aGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCgggg > 4:131332/1‑147 (MQ=255) aGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGaa < 4:316814/149‑1 (MQ=255) ccccAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCCAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAgg > 4:23836/1‑149 (MQ=255) ccccAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCAGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAgg > 2:348622/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGa > 5:132301/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGa > 2:225117/1‑149 (MQ=255) aGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGAt < 3:64876/149‑1 (MQ=255) gCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTgg < 3:5555/130‑1 (MQ=255) gCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTgg > 4:5555/1‑130 (MQ=255) gCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCa < 4:311453/149‑1 (MQ=255) tGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAgc > 8:163813/1‑149 (MQ=255) tGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAgc > 2:352595/1‑149 (MQ=255) tGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAgc > 1:152115/1‑149 (MQ=255) tGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAgc > 1:157672/1‑149 (MQ=255) aTGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAgcg < 5:274448/148‑1 (MQ=255) tGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCAGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGcgcg < 1:348622/149‑1 (MQ=255) gtcgtcCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGcgg > 8:325134/1‑149 (MQ=255) gtcCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGcggtcg < 2:189720/149‑1 (MQ=255) ggTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGtgtg < 7:163813/149‑1 (MQ=255) tgcGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTgg < 1:133491/147‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTgg < 2:107170/149‑1 (MQ=255) cGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGTGAAGGGGGTCAGCGCGGTCGGTGTGggc < 3:23836/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGt > 6:310641/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGt > 2:189217/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTc > 5:234978/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTc > 5:164910/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTc < 6:132301/147‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACg < 6:234978/149‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCGAGCACGCGGGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGAt < 2:341750/117‑1 (MQ=255) ttCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATAGGGGAAGGGGATCAGCGCGCTCGGTGTGgccgg > 4:58113/1‑132 (MQ=255) gAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGCGAGTACT‑GCTggtga > 5:61715/1‑91 (MQ=255) gAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGCGAGTACT‑GCTggtga < 6:61715/94‑4 (MQ=255) gAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACg < 7:325134/149‑1 (MQ=255) aGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAGCGGCTCGAACgg < 1:352595/149‑1 (MQ=255) aGCAAGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACgg > 6:190312/1‑149 (MQ=255) gCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACggg > 5:188704/1‑149 (MQ=255) gCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACggg > 5:232252/1‑149 (MQ=255) cACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAATATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACggg < 8:126340/148‑1 (MQ=255) cgTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAAcc < 5:310641/149‑1 (MQ=255) tcgCCTGCTGCCACAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTacctt > 3:300525/3‑145 (MQ=255) cgCCTGCTGCCACAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAACCTg > 1:328771/2‑149 (MQ=255) gCCTGCTGCCACAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCgggg > 3:198244/1‑90 (MQ=255) gCCTGCTGCCACAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCgggg < 4:198244/90‑1 (MQ=255) ctgctgTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAACCTggcg < 5:190312/149‑1 (MQ=255) ctgTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAACCTggcggc < 2:371418/148‑1 (MQ=255) ctgTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAACCTggcggc < 6:188704/148‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCgg > 2:9317/1‑48 (MQ=255) gcagcaGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAACCTGGCGGCAAccc < 6:184238/148‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGAGTCGCACCTTCAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCgg < 1:9317/48‑1 (MQ=255) | TCCAGAACAAGATGTCGGCTGCCTTGCTCACCCACGACGATCAGCCGGCCATCCGCCGACACCGCACCATGCTCCATGCTCAGCCCCAGGCTGATGTCGTCCGGGTCGGTGCCCTCGGCCAGCTCTTCGAGCACGCGTGCCTGCTGTGGCAGCAGGCGAGTCGCACCTTGAGTGGCCAGTACGAAGATACCTTCGGCGCTCACCAGC‑AGTACTCGCTGGCCATCGGGGAAGGGGATCAGCGCGGTCGGTGTGGGCGGCAGGTCGAACGGCTCGAACGGGTAACCTGGCGGCAACCC > NC_002947/2774664‑2774959 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |