| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,790,701 | A→C | 6.3% | Y283D (TAC→GAC) ‡ | sstT ← | serine/threonine transporter SstT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,790,701 | 0 | A | C | 6.3% | 253.0 / 6.6 | 79 | Y283D (TAC→GAC) ‡ | sstT | serine/threonine transporter SstT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/39); new base C (3/2); total (38/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
ACACTGCCGCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTGCGGCGGATCTTCCAGAA > NC_002947/2790554‑2790848 | acacTGCCGCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAg < 1:215739/149‑1 (MQ=255)acacTGCCGCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAg > 6:200570/1‑149 (MQ=255) acTGCCGCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCCCTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGgt > 5:15282/1‑149 (MQ=255) ccGCTACCCCGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTCATGGTCTCGCGCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCt > 8:257282/1‑149 (MQ=255) ccGCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGgtgt < 2:152947/147‑1 (MQ=255) ccGCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCt > 1:316192/1‑149 (MQ=255) gCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTc < 5:352123/149‑1 (MQ=255) gCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTc < 2:4937/149‑1 (MQ=255) ccACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCAt < 5:200570/147‑1 (MQ=255) cACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCCCCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACCCCGCGGAGGGGTCTTCagg > 8:327455/1‑145 (MQ=255) cTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGcc < 2:316192/149‑1 (MQ=255) cagcaCGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGc < 4:230165/149‑1 (MQ=255) gcaCGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCTACTCGGTGTcgat > 4:126317/1‑130 (MQ=255) gcaCGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCTACTCGGTGTcgat < 3:126317/133‑4 (MQ=255) cGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTcc < 6:100208/149‑1 (MQ=255) tCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAAc > 7:259759/1‑149 (MQ=255) gtacACCTGGATACCCATGGTATGCACTGCGGGCAGGGTCTGCACGGTTATGGTGATCGCCGCATGTGCGTTGTTGATGGTCGCGCGCAGCGGTATCGACTCCGAGTAGGTTTCTTGTTGCAGGCCAAGGCGTTCCGAAAATGCAAGGt < 4:282235/146‑1 (MQ=255) ccTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCAcc > 6:275640/1‑149 (MQ=255) gATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGa < 7:11022/149‑1 (MQ=255) gATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGa > 4:238299/1‑149 (MQ=255) aCCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGt > 4:123775/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGa > 4:72518/1‑124 (MQ=255) ccAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGa < 3:72518/124‑1 (MQ=255) ccAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTg > 8:111296/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTg > 3:260827/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTg > 1:221758/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGGTCACCGGGATGTTg > 6:306360/1‑149 (MQ=255) aGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTggc > 6:355411/1‑149 (MQ=255) ggTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCAt > 2:344459/1‑101 (MQ=255) ggTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCAt < 1:344459/101‑1 (MQ=255) gTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCTACTCGGTGTcgatcc > 3:156714/1‑95 (MQ=255) gTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGAACGGTAATGGTGATCGCAGCACCGGCCATCTTGATGGTCGCGACCATCGTGATCGACAACGAGTAGTTGTCTTCATGCAGGACAAGGCGTTCCGACAACGCCACGTTCACCGGGATCTAggaggc > 4:189640/1‑149 (MQ=255) aCTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGtt < 4:347547/109‑1 (MQ=255) aCTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGtt > 3:347547/1‑109 (MQ=255) gCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGt < 3:314212/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGt > 1:195770/1‑148 (MQ=255) aGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTgaa < 2:195770/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTgaag > 1:19372/1‑148 (MQ=255) gCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCg < 4:260827/149‑1 (MQ=255) cACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCTTGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCgg < 7:111296/149‑1 (MQ=255) aCGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCgg > 8:355793/1‑148 (MQ=255) gttaTGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGTGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCTGTAAt < 3:189640/146‑1 (MQ=255) aTGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGcc > 5:272459/1‑149 (MQ=255) gTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGc < 5:275640/148‑1 (MQ=255) tCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCa < 3:238299/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCa < 6:15282/149‑1 (MQ=255) cgccgcACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCa < 7:257282/148‑1 (MQ=255) aCCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCgg > 6:379106/1‑115 (MQ=255) aCCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCgg < 5:379106/115‑1 (MQ=255) gCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCAcag < 2:221758/149‑1 (MQ=255) gCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCAACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCg > 8:188987/1‑123 (MQ=255) gCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCAACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCg > 8:194300/1‑123 (MQ=255) gCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCAACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCg < 7:188987/123‑1 (MQ=255) gCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCAACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCg < 7:194300/123‑1 (MQ=255) cATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTgaa < 6:353822/114‑1 (MQ=255) cATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTgaa > 5:353822/1‑114 (MQ=255) tGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACagcagc < 5:306360/149‑1 (MQ=255) gATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGt > 2:233964/1‑147 (MQ=255) tGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGc < 2:19372/149‑1 (MQ=255) tGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGc < 8:259759/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGc < 3:7315/119‑1 (MQ=255) ggTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGc > 4:7315/1‑119 (MQ=255) ggTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCg > 4:164879/1‑149 (MQ=255) gTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCgg < 3:123775/149‑1 (MQ=255) tCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCAAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGc < 3:308526/146‑1 (MQ=255) tCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCAAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGc > 4:308526/1‑146 (MQ=255) cgcCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGGGAAGAATGCGGTACTGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAg < 5:355411/149‑1 (MQ=255) gcCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGc > 6:140690/1‑105 (MQ=255) gcCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGc < 5:140690/105‑1 (MQ=255) gcCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAgg > 3:330512/1‑149 (MQ=255) gaagACACCTACTCGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTgcggc < 2:160180/145‑1 (MQ=255) gaagACACCTACTCGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTgcggc > 1:160180/4‑148 (MQ=255) agcGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTgcggcg < 8:172111/147‑1 (MQ=255) acacCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGTGGGTAGGGGTTGCGGCGGATc > 6:58735/1‑149 (MQ=255) gAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTGCGGCGGATCTTCCa < 4:330512/149‑1 (MQ=255) gTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTGCGGCGGATCTTCCAg > 3:177099/1‑148 (MQ=255) tAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGca > 7:48176/1‑107 (MQ=255) tAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGca < 8:48176/107‑1 (MQ=255) tAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTGCGGCGGATCTTCCAGaa < 3:164879/149‑1 (MQ=255) | ACACTGCCGCTACCACGCTGAGCAGCACGGCAGTCGGCAGGTCCACCTGGATACCCAGGGTATGCACTGCGGCCAGGGTCAGCACGGTAATGGTGATCGCCGCACCGGCCATGTTGATGGTCGCGCCCAGCGGGATCGACACCGAGTAGGTGTCTTCATGCAGGCCAAGGCGTTCCGACAACGCCAGGTTCACCGGGATGTTGGCGGCCGAGCTGCGGGTGAAGAATGCGGTAATGCCGCTTTCACGCAGGCACAGCAGCGTCAGCGGGTAGGGGTTGCGGCGGATCTTCCAGAA > NC_002947/2790554‑2790848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |