| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 288,011 | T→C | 5.3% | T33A (ACC→GCC) | tauA ← | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 288,011 | 0 | T | C | 5.3% | 223.4 / 2.5 | 76 | T33A (ACC→GCC) | tauA | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/34); new base C (2/2); total (39/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.91e-01 | |||||||||||
CCCAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGA > NC_002947/287866‑288159 | cccAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTg < 3:359690/149‑1 (MQ=255)cccAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTg > 4:235348/1‑149 (MQ=255) cgcgcttccGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGt < 6:150980/142‑1 (MQ=255) gCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCa > 2:18712/1‑149 (MQ=255) gCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCa > 2:140521/1‑149 (MQ=255) cGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACt > 3:122174/1‑149 (MQ=255) tGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAg > 3:236126/1‑149 (MQ=255) gCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAgg > 7:37154/1‑149 (MQ=255) 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gTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCgg < 1:18712/149‑1 (MQ=255) cgccgcTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAAGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGc > 1:282990/1‑149 (MQ=255) gccgcTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCCTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCt < 2:244692/148‑1 (MQ=255) cgcTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGcc > 4:361489/1‑149 (MQ=255) cTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTg < 4:114323/149‑1 (MQ=255) cACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGcc > 5:338320/1‑148 (MQ=255) cACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGcc > 2:360496/1‑148 (MQ=255) cAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAg > 2:356238/1‑149 (MQ=255) attgttCACGGTTGCGCCGTTATAAAATTTGCGCC‑CTTGCATTCGGGCCCTCCCTTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCa < 1:304964/144‑1 (MQ=255) gATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAAcc < 4:158372/143‑1 (MQ=255) gATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAAcc > 3:158372/1‑143 (MQ=255) aTCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGt < 8:37154/149‑1 (MQ=255) aTCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGt < 2:282990/149‑1 (MQ=255) tCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTg < 1:360496/149‑1 (MQ=255) cACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTc > 3:40773/1‑118 (MQ=255) cACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTc < 4:40773/118‑1 (MQ=255) cACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGc > 2:97206/1‑149 (MQ=255) gcgcCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAg > 6:191371/1‑149 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGa < 5:209432/147‑1 (MQ=255) cgcCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAg < 4:236126/148‑1 (MQ=255) gcCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAggg > 8:29227/1‑149 (MQ=255) ttATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAg > 3:26872/1‑149 (MQ=255) aTCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAggg > 3:316271/1‑149 (MQ=255) aTCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAgg < 6:338320/148‑1 (MQ=255) tCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAgg > 2:79339/1‑147 (MQ=255) tCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAgg < 1:79339/147‑1 (MQ=255) aTTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcggc > 2:156958/1‑148 (MQ=255) cgcC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAg < 4:109261/149‑1 (MQ=255) gcC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGCCAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGGCAGCGCGGCGCAGAgg > 3:281382/1‑149 (MQ=255) gTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAggg < 1:368949/134‑1 (MQ=255) gTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAggg > 2:368949/1‑134 (MQ=255) gATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCg > 1:100239/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCg > 3:318096/1‑148 (MQ=255) gC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGa > 2:70244/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTgg < 2:275789/86‑1 (MQ=255) tGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTgg > 1:275789/1‑86 (MQ=255) gCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGTCAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCAt > 1:261209/1‑149 (MQ=255) gCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGGCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGa < 3:25193/135‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGTAGTCGCCATAGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCAACTGTCAGGTCGGCTGCATGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGAGAGGGTCAGGTCGGAGAACAGACGCAGCGGa > 4:25193/1‑135 (MQ=255) cTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGTGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATg < 4:126998/149‑1 (MQ=255) tttttAGTAGTCGCCATCTACCTGCGCCACTTTGGCCGTGTCGACAGTGGTCTGGTAGTACAATGTAAGGTCGTCTGCCTGGGACAACAAGCTGGTGCTGGCGAGGGGAATTGCGGCGAACAGGCGCAGCGTAGCGTGCGGGATCATgg > 3:50709/1‑149 (MQ=255) tttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATgg < 3:361489/147‑1 (MQ=255) tCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTg < 1:140521/148‑1 (MQ=255) cGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGaa > 7:167724/1‑149 (MQ=255) gTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAAc < 4:26872/149‑1 (MQ=255) tAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGCGCGTGCGGGCTCATGGTTgcagg > 2:266575/1‑145 (MQ=255) tCGCCATGGACCTGCGCGAGTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCTCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGaa < 7:305250/144‑1 (MQ=255) tCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCCGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGCCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCAAGCTAGAAcaca > 8:305250/1‑145 (MQ=255) cATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGt > 7:31065/1‑148 (MQ=255) cATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTc < 5:191371/149‑1 (MQ=255) cATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTc < 1:70244/149‑1 (MQ=255) tGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGc < 8:167013/145‑1 (MQ=255) tGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGc > 7:167013/1‑145 (MQ=255) ccACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGAGCTGGCGAGGGTCATGGCGGCCAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTAGAACCTCACGTCATGCAAGTCgtg > 5:240103/1‑149 (MQ=255) cACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCgtgt > 3:227338/1‑149 (MQ=255) aCTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGtt < 2:100239/149‑1 (MQ=255) gCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACGGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATaa < 4:122174/149‑1 (MQ=255) gCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATaa < 4:227338/149‑1 (MQ=255) ctgACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACgag > 1:346963/3‑147 (MQ=255) ctgACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACgag > 5:291341/3‑147 (MQ=255) tGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTaaa > 6:89977/1‑149 (MQ=255) tGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTaaa < 8:31065/149‑1 (MQ=255) gTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATg < 4:318096/149‑1 (MQ=255) tCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCTAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGa < 1:356238/149‑1 (MQ=255) | CCCAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCC‑AGTCGATGCTGGCCTTGC‑‑TGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAATGA > NC_002947/287866‑288159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |