| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,152,386 | G→A | 6.7% | G181S (GGT→AGT) | PP_2768 → | branched‑chain amino acid ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,152,386 | 0 | G | A | 6.7% | 177.0 / 2.1 | 60 | G181S (GGT→AGT) | PP_2768 | branched‑chain amino acid ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/28); new base A (2/2); total (29/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
GGCGGCCTGCTGCTGTCGCAGTTCGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAGGCCCTGCCGGTGCTGATCATCGG > NC_002947/3152239‑3152534 | ggcggcCTGCTGCTGTCGCAGTTCGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCg < 6:75101/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGTCGCAGTTCGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATcc > 8:148498/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCTGTCGCAGTTCGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATcc > 3:279962/1‑149 (MQ=255) ctgctgTCGCAGTTCGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCGTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGGGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGc < 4:279962/147‑1 (MQ=255) gCAGTTCGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAgg < 2:233256/148‑1 (MQ=255) cGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTgg < 7:148498/148‑1 (MQ=255) gACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGc > 2:265636/1‑149 (MQ=255) aCCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCg > 3:42801/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGgtg < 1:108497/141‑1 (MQ=255) cTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGgtg > 2:108497/1‑141 (MQ=255) gTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGgtg < 4:28685/139‑1 (MQ=255) gTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGgtg > 3:28685/1‑139 (MQ=255) gTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtg > 6:85634/1‑148 (MQ=255) gTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtg < 5:85634/148‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtggt > 8:25043/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtggt < 1:265636/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtg < 6:281746/147‑1 (MQ=255) gccgccgcAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTAGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTg < 1:52379/149‑1 (MQ=255) gcAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGt < 5:308370/149‑1 (MQ=255) ggcggcggcCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGAGGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCAGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtggt > 7:79000/1‑135 (MQ=255) ggcggcggcCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCAGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtggt < 8:79000/135‑1 (MQ=255) ggcggcggcCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCAGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtggt < 6:231951/135‑1 (MQ=255) ggcggcggcCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCAGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCggtggt > 5:231951/1‑135 (MQ=255) cggcggcCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCACGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTggg < 6:71860/138‑1 (MQ=255) cggcggcCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCACGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTggg > 5:71860/1‑138 (MQ=255) gtggtgCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCggg < 6:268706/147‑1 (MQ=255) gtggtgCTTCCGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCggg < 6:273698/147‑1 (MQ=255) ttCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGcc > 6:237528/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGcc > 4:364895/1‑149 (MQ=255) cTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCt > 1:90780/1‑115 (MQ=255) cTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCt < 2:90780/115‑1 (MQ=255) cTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGgctg > 5:142487/1‑148 (MQ=255) cTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGctct < 6:223290/148‑1 (MQ=255) tGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTgg > 3:261679/1‑149 (MQ=255) ttCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTggg < 7:25043/148‑1 (MQ=255) aaCCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCTGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTtggtg < 5:283911/129‑1 (MQ=255) aaCCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTtggtg > 6:283911/1‑129 (MQ=255) cGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTggg < 4:241658/142‑1 (MQ=255) cGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTggg > 3:241658/1‑142 (MQ=255) gCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGc > 3:177480/1‑149 (MQ=255) aCGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCt < 6:142487/149‑1 (MQ=255) gcgcATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCTGGATGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGACCGCCggg > 8:319024/1‑149 (MQ=39) gcATCGGCCTGGCGCTGGGTGGGGTGGCCGACGATCCCCGCGGGGGGATGAGCGTCGGTATCCGCGTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTTGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGTTGGCGGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTgtgg < 4:261679/149‑1 (MQ=255) gcATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTgggg > 5:138481/1‑149 (MQ=255) gcATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTgggg > 7:254727/1‑149 (MQ=255) gcATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTCTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTgggg > 5:317327/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAg < 5:124713/149‑1 (MQ=255) ccGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGgtggtg < 4:42801/149‑1 (MQ=255) cgacgaTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGc < 8:254727/149‑1 (MQ=255) cgacgaTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGc < 6:317327/149‑1 (MQ=255) cgacgaTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGc > 8:210770/1‑149 (MQ=255) cgacgaTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGc > 8:205299/1‑149 (MQ=255) gacgaTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCt > 3:118211/1‑149 (MQ=255) gaTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTc > 3:281964/1‑147 (MQ=255) aTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAg < 7:210770/149‑1 (MQ=255) aTCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAg < 7:205299/149‑1 (MQ=255) tCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAgg > 3:28719/1‑149 (MQ=255) cgATGAGCGGCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAGGCCCTGCCGGTg < 5:237528/149‑1 (MQ=255) gATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAGGCCCTGCCGGTGc < 4:281964/149‑1 (MQ=255) aTGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAGGCCCTGCCGGTGCt > 5:126339/1‑149 (MQ=255) aGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAGGCCCTGCCGGTGCTGa < 4:340393/148‑1 (MQ=255) ggTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAGGCCCTGCCGGTGCTGATCATcgg < 4:177480/149‑1 (MQ=255) | GGCGGCCTGCTGCTGTCGCAGTTCGACCTGTTCGCCGCCGCAACGGCGGCGGCCCTGGTGGTGCTTCTGTCCTTGCTGTTCAACCGCACGCGCATCGGCCTGGCGCTGCGTGCGGTGGCCGACGATCCCCGCGCGGCGATGAGCGTCGGTATCCGCCTGCCGAGGGTGTGGGCGGTGGTCTGGGCGGTGGCCGGGTTTGTCGGGTTGGTGGCCGGGCTGCTCTGGGGCGCACGCCTGGGGGTGCAGTTCTCGCTCTCGCTGGTGGTGCTCAAGGCCCTGCCGGTGCTGATCATCGG > NC_002947/3152239‑3152534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |