Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,158,943 | T→G | 9.5% | L321R (CTC→CGC) | opuA → | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,158,943 | 0 | T | G | 9.5% | 170.9 / 5.4 | 60 | L321R (CTC→CGC) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/23); new base G (2/4); total (33/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGT > NC_002947/3158796‑3159091 | tGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCGAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGcgctc > 8:188983/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTg > 2:317386/1‑149 (MQ=255) cttcGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATGGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGAGCGCTgccggg < 7:67844/148‑3 (MQ=255) ttcGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGccgccg > 7:287481/1‑148 (MQ=255) gacgaGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑Ac < 5:176246/148‑1 (MQ=255) gacgaGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑Ac > 1:67956/1‑148 (MQ=255) gacgaGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑Ac > 6:176246/1‑148 (MQ=255) gaGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAgg > 1:31781/1‑149 (MQ=255) gCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggtt < 3:59652/149‑1 (MQ=255) ccGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGCGCTGCCAGCGCGCTCGACAATCCATTGGAGTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAggtggtgg > 1:34427/1‑147 (MQ=255) ccGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggttg < 1:317386/149‑1 (MQ=255) ccGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggttg > 1:90048/1‑149 (MQ=255) ccGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggttg < 2:31781/149‑1 (MQ=255) atatCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggtt < 3:121101/144‑1 (MQ=255) atatCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggtt > 4:121101/1‑144 (MQ=255) atatCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTc > 7:33744/1‑149 (MQ=255) tctgCCCGAGCATTGCGGCGTCTAGCGACGAGGTGCTCTGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGGGGGGGGCCCGGCAGCGCGCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTGct < 2:34427/144‑1 (MQ=255) tCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCTGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTctgg < 2:67956/149‑1 (MQ=255) cgtcccGAGCATTGCGTCGTGTTCCCACGCGGTGCTCAGCGAGCCTGCTGCGGCCGTGCTGCCTGCGCGTTCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCTGCGCTGGCTGCGGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTctgg < 8:186343/145‑1 (MQ=255) cccGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTctggctgg < 7:26027/149‑1 (MQ=255) ccGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggttg < 3:159623/137‑1 (MQ=255) ccGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGtggttg > 4:159623/1‑137 (MQ=255) cGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGgcg > 2:226833/1‑149 (MQ=255) tGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGctgctg < 2:90048/148‑1 (MQ=255) gCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGcgct > 7:227781/1‑104 (MQ=255) gCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGcgct < 8:227781/104‑1 (MQ=255) tAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTgg > 5:90945/1‑149 (MQ=255) gCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTggc < 6:90945/148‑1 (MQ=255) aGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCAtgc < 8:287481/148‑1 (MQ=255) aGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCAtgcttgct > 4:116258/1‑149 (MQ=255) gCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtggcgcgtggcg > 3:6555/1‑149 (MQ=255) gCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAgg > 7:315105/1‑149 (MQ=255) cTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAggg < 3:116258/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAgggg > 4:131848/1‑147 (MQ=255) ccAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGc > 3:150709/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCg > 5:225378/1‑149 (MQ=255) gATCGACATTCTATTGGATTCGCCAATGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTgg < 4:150709/149‑1 (MQ=255) gATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGTACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTg > 1:292015/1‑149 (MQ=255) tCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCgctg > 6:168671/1‑87 (MQ=255) tCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCgctg < 5:168671/87‑1 (MQ=255) gACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtggcgcgtg < 7:88452/126‑1 (MQ=255) gACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtggcgcgtg > 8:88452/1‑126 (MQ=255) aCAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATc > 7:89999/1‑149 (MQ=255) aCAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTATGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATc > 5:340666/1‑149 (MQ=255) aTCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGc < 8:33744/149‑1 (MQ=255) aTTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCca > 7:206992/1‑147 (MQ=255) aTTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCca > 1:335418/1‑147 (MQ=255) aTTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCAGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGAATGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCca > 1:300007/1‑147 (MQ=255) gATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtggcgcgtgg > 1:134451/1‑115 (MQ=255) gATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtggcgcgtgg < 2:134451/115‑1 (MQ=255) gATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCAc > 1:30892/1‑149 (MQ=255) cGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTgg < 8:315105/148‑1 (MQ=255) gCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTgg > 4:326327/1‑147 (MQ=255) cGTGTTGGGCCCGGCAGCGCGCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGtgctgc < 7:188983/149‑1 (MQ=255) gtTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTgg > 2:27258/1‑149 (MQ=255) ttGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCTGCCGG‑ACGTGGTGGTTGGTTGTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGt < 6:340666/149‑1 (MQ=255) ttGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTgg < 1:226833/148‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGCTGCGCTCGCTGCGGCCGG‑ACGTGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGGGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGt < 2:335418/148‑1 (MQ=255) ggcgtcAGCGAGCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGTTTCTGGCTGGCGGTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGtgct < 4:116731/133‑1 (MQ=255) ggcGGCAGCGAGCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGtgct > 3:116731/3‑138 (MQ=255) gcGGCAGCGAGCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCg > 2:231686/2‑149 (MQ=255) cAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTg < 4:6555/149‑1 (MQ=255) gcgcTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTggg > 1:144821/1‑149 (MQ=255) tcgctGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTtgt > 4:47454/1‑149 (MQ=255) | TGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGG‑ACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGT > NC_002947/3158796‑3159091 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |