Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,219,674 | C→T | 6.5% | D56N (GAC→AAC) | PP_2821 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,219,674 | 0 | C | T | 6.5% | 179.8 / 2.0 | 61 | D56N (GAC→AAC) | PP_2821 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/27); new base T (2/2); total (32/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.65e-01 |
ATCACCGCGGCGTCATCGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCTGTGGCCAGGGTTGCGCCGAACATTGC > NC_002947/3219526‑3219821 | aTCACCGCGGCGTCATCGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTc < 3:246472/149‑1 (MQ=255) aTCACCCCGCCCTCAGCGTCCACGCTCTGCCGCCGAGGCCCCTTGCCCGTGACCCCCACGCCTGACCAGTCCG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTc < 4:281390/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGCTTCATCGGCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCATCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAg < 8:171501/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGCGTCATCGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAg > 3:318341/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCGTCATCGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAgg < 8:153865/149‑1 (MQ=255) gcgTCATCGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTACCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCtt < 4:123885/149‑1 (MQ=255) gTCATCGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGa < 8:203037/149‑1 (MQ=255) cGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTg > 3:313863/1‑149 (MQ=255) gTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTgg > 1:173653/1‑149 (MQ=255) tCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGgt > 5:185831/1‑149 (MQ=255) cACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGgtgt > 2:203966/1‑149 (MQ=255) gCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACGTACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTcc > 1:92318/1‑149 (MQ=255) tctGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTg > 4:203789/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTTGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGa < 5:160377/133‑1 (MQ=255) tGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGa > 6:160377/1‑133 (MQ=255) cAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGcc < 2:92318/147‑1 (MQ=255) gCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAgg < 6:2923/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTg < 4:318341/149‑1 (MQ=255) ccGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATAGTTACTTGGTGGGGTTCAAGACTTTCTGTTCGAGGCCAGTGAGGATGGTGTCCTTGACAAGGAATATTTTGGACAcc > 8:73726/1‑149 (MQ=255) gTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTc > 1:35111/1‑149 (MQ=255) tGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCg > 2:302041/1‑149 (MQ=255) cacCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCt < 6:199998/149‑1 (MQ=255) acCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTg < 8:250258/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTggg > 8:196979/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTgg > 2:113034/1‑148 (MQ=255) ccTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAg > 8:238708/1‑92 (MQ=255) ccTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAg < 7:238708/92‑1 (MQ=255) cAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTgcggc > 8:6917/1‑149 (MQ=255) gTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGgcgc > 1:294970/1‑149 (MQ=255) cG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGgcgcca < 1:203966/148‑3 (MQ=255) catGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGgcgc > 2:123891/3‑149 (MQ=255) gAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCg < 3:275801/148‑1 (MQ=255) aTTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCAt > 7:66907/1‑148 (MQ=255) aTTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCAt > 5:24820/1‑148 (MQ=255) gTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTTGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTgg > 5:58542/1‑115 (MQ=255) gTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTTGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTgg > 5:52750/1‑115 (MQ=255) gTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTTGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTgg < 6:52750/115‑1 (MQ=255) gTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTTGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTgg < 6:58542/115‑1 (MQ=255) gTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCa > 7:72972/1‑149 (MQ=255) gTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCa > 4:239239/1‑149 (MQ=255) ttCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCAc > 1:148886/1‑149 (MQ=255) ttCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCAc > 7:199045/1‑149 (MQ=255) tgttgGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGc < 8:199045/148‑1 (MQ=255) gttgGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGCTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGc < 1:302041/147‑1 (MQ=255) gTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTc > 7:22710/1‑132 (MQ=255) gTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTc < 8:22710/132‑1 (MQ=255) gTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCt < 3:203789/148‑1 (MQ=255) cTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGc < 1:203241/149‑1 (MQ=255) cTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGc < 7:6917/149‑1 (MQ=255) gTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCa < 6:185831/149‑1 (MQ=255) tAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAg > 2:178101/1‑149 (MQ=255) gAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAggg < 8:72972/149‑1 (MQ=255) gAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAgg < 2:173653/148‑1 (MQ=255) ttCCTTGGTGGGGGTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTgctgg < 1:113034/149‑1 (MQ=255) cTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTgctggctg > 8:177580/1‑149 (MQ=255) ggtggGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCtgt < 6:56427/147‑1 (MQ=255) gtggGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCTGTgg < 3:239239/148‑1 (MQ=255) gggTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTc > 6:103374/1‑102 (MQ=255) gggTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTc < 5:103374/102‑1 (MQ=255) gCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCTGTGGCCAg > 8:213951/1‑141 (MQ=255) gCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCTGTGGCCAg < 7:213951/141‑1 (MQ=255) gTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCTGTGGCCAGGGTTGCGCCGAACATTg > 1:79453/1‑149 (MQ=255) tCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCATGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCTGTGGCCAGGGTTGCGCCGAACAtgcg > 7:230703/1‑146 (MQ=255) | ATCACCGCGGCGTCATCGTCCACGCTCTGCAGCGGTTGCCCCTTGCCCGTGAACACCAGGCCTGACCAGTACG‑ACTTGAGCTGGGATTCGTTCTTGTTGGTCAGCGCGCTGTAGAATCGTTCCTTGGTGGGGTTCCAGCCTTTCTGGTCGAGGCCCTTGAGGCTGGTGTCCTTGCCCAGGAATATGTTGGCCACCTCGGCCTGGGACGGTGCGGCGCTGGCGCCGGCATTCATGATCACGGCCACCTCGGCACTGGCCAGGGTGCTGGCTGTGGCCAGGGTTGCGCCGAACATTGC > NC_002947/3219526‑3219821 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |