Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,254,842 | T→A | 13.8% | K299M (AAG→ATG) ‡ | PP_2852 ← | sulfatase domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,254,842 | 0 | T | A | 13.8% | 167.7 / 16.2 | 65 | K299M (AAG→ATG) ‡ | PP_2852 | sulfatase domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/28); new base A (3/6); total (31/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 |
ATCGAAACCGATGTGCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATCAAGTCTTCGT > NC_002947/3254694‑3254986 | aTCGAAACCGATGTGCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCt > 5:358190/1‑149 (MQ=255) gATGTGCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTgg < 1:35295/149‑2 (MQ=255) tgtgCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCg < 6:4967/149‑1 (MQ=255) tgtgCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTggaa < 2:84054/149‑4 (MQ=255) tgCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGtt < 2:300068/149‑1 (MQ=255) tgCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTggaac < 7:166408/148‑5 (MQ=255) tgCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTggaac < 6:295249/148‑5 (MQ=255) gCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGc < 7:209547/148‑1 (MQ=255) gCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGc > 8:209547/1‑148 (MQ=255) gatgCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCt > 7:63829/1‑149 (MQ=255) tgCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTgg < 5:301743/135‑2 (MQ=255) tgCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTgg > 6:301743/1‑134 (MQ=255) gCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGt > 4:291942/1‑149 (MQ=255) cGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTc < 6:358190/149‑1 (MQ=255) cGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTc < 8:280460/149‑1 (MQ=255) cGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTc < 4:241121/149‑1 (MQ=255) cGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTc < 6:195402/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTaa > 5:67140/1‑149 (MQ=255) ttGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTggaa > 2:46268/1‑126 (MQ=255) ttGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCAAGGGCGTggaa < 1:46268/129‑4 (MQ=255) tGGCCAGGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATcg > 4:47581/1‑149 (MQ=255) gCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTTCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATcgcc < 3:164642/149‑1 (MQ=255) ccATGAAGCGCAGGCCTGTGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATcgccg < 4:322711/149‑1 (MQ=255) cATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGc > 1:55308/1‑133 (MQ=255) cATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGc < 2:55308/133‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGcaca < 8:72347/148‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGcaca < 8:63829/148‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGcc < 3:85577/120‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGcc > 4:85577/1‑120 (MQ=255) aGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCg > 8:54724/1‑148 (MQ=255) gTAGTGGGTGGTAAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATgg > 4:109254/1‑149 (MQ=255) tAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAACATCGCATACAGGCCACG‑GATGGt < 7:54724/149‑1 (MQ=255) gggtggTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCtgg > 4:331211/1‑149 (MQ=255) gtggtgAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCtggtg < 3:331211/149‑1 (MQ=255) tggtgAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCtggtgg < 6:67140/149‑1 (MQ=255) tggtgAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCtggtgg < 3:161303/149‑1 (MQ=255) tggtgAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAACTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCtggtgg > 1:371317/1‑149 (MQ=255) aaaCCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGtgtg < 3:47581/149‑1 (MQ=255) aaaCCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATCGTCTGGTGGGtgtg > 4:229648/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGtgtg > 2:85283/1‑147 (MQ=255) ccTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GTTGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACg > 2:216395/1‑149 (MQ=255) gCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAg > 8:142930/1‑148 (MQ=255) gCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGt < 3:229648/149‑1 (MQ=255) gTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCt > 4:32130/1‑149 (MQ=255) tAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTg < 3:109254/149‑1 (MQ=255) aTTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTggg < 7:142930/149‑1 (MQ=255) aTTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTggg < 2:198195/149‑1 (MQ=255) cGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GTTGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCa < 1:216395/149‑1 (MQ=255) aCAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGc > 2:205064/1‑85 (MQ=255) gTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCCCG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTg > 7:257872/1‑149 (MQ=255) gTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACGCGATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCt < 1:38977/120‑1 (MQ=255) gTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCt > 2:38977/1‑119 (MQ=255) gTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTg > 8:81296/1‑149 (MQ=255) gTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGa < 7:81296/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGTAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAg < 3:291942/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAg > 2:140768/1‑149 (MQ=255) cagcagTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGc < 2:285781/148‑1 (MQ=255) cagcagTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGc > 1:285781/1‑148 (MQ=255) cagTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATc > 2:282459/1‑148 (MQ=255) aacggcACGCCCAAGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATc > 2:1017/6‑147 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGc > 7:74128/1‑120 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGc < 8:74128/120‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATCAAGTCtt > 6:329983/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATCAAGTCtt > 2:81611/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATCAAGTCtt > 1:336220/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATCAAGTCTTCGt > 3:328521/1‑149 (MQ=255) | ATCGAAACCGATGTGCGGCATGATGCGGTCCTTGGCCATGAAGCGCAGGCCTGCGCCTTGCAGGTAGTGGGTGGTGAAACCGGCCTGGCGTAATTGTGCCGGCAGACAGGCCTGGTTGCGTTGGTTCTGGGTCAGCAGTTCCACGCCCTTGGGCGTGCCGTTGGCCAGCTTGTCGTAATCGCCGCACAGCATCGCATACAGGCCACG‑GATGGTCTGGTGGGTGTGCAGCACGTAGTCTGGGGTGTTCATGCCGCGCTCGGCCCATTTGCTGAGCTTGGGCATCAAGTCTTCGT > NC_002947/3254694‑3254986 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |