Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,556,415 | C→G | 6.1% | P278A (CCC→GCC) | PP_3140 → | group 2 family glycosyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,556,415 | 0 | C | G | 6.1% | 212.8 / 3.0 | 65 | P278A (CCC→GCC) | PP_3140 | group 2 family glycosyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/30); new base G (2/2); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
GGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCC > NC_002947/3556268‑3556562 | ggCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCAcc > 2:139866/1‑149 (MQ=255) aCCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCgg < 6:374790/149‑1 (MQ=255) ccTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCggg < 4:344444/149‑1 (MQ=255) cattGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACACAAGCGGGc > 8:297879/3‑149 (MQ=255) cTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGc > 4:129478/1‑149 (MQ=255) ggCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATg < 1:335462/141‑1 (MQ=255) ggCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATg > 2:335462/1‑141 (MQ=255) cAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCa < 3:75917/149‑1 (MQ=255) cAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCa < 1:139866/149‑1 (MQ=255) tGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGt > 4:77800/1‑148 (MQ=255) tttCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACg > 2:227419/1‑149 (MQ=255) ccccGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGcc > 7:160524/1‑149 (MQ=255) cGAGGCACTGGTCACT‑‑CCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcg < 3:319714/149‑1 (MQ=255) gCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTggcgg < 8:261056/148‑1 (MQ=255) cACTGCTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGcc < 8:248369/149‑1 (MQ=255) aCTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCt > 7:301084/1‑149 (MQ=255) gTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGAc > 5:203558/1‑149 (MQ=255) aCTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCt > 5:89803/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGAc > 8:282853/1‑149 (MQ=255) cAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACtt > 6:9080/1‑149 (MQ=255) cAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGACAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGAGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGATCCTGGACtt > 2:282214/1‑149 (MQ=255) aGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTg < 7:298906/149‑1 (MQ=255) cccACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCT‑GACTTGCTGGt > 8:245220/1‑149 (MQ=255) ccACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCGATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTgg < 5:332815/148‑1 (MQ=255) aCTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgc < 3:208603/149‑1 (MQ=255) aCTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgc > 1:206256/1‑149 (MQ=255) aGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgccgc < 8:301084/148‑1 (MQ=255) agcagGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTGGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTg > 5:326479/1‑149 (MQ=255) ccTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCgg > 8:231667/1‑70 (MQ=255) ccTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCgg < 7:231667/70‑1 (MQ=255) ccTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGc < 5:9080/149‑1 (MQ=255) cTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGAACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGACATCAACCAGCGTAACGATATCCTGGCGGCCTTGACCCTCGACTAGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTCCt > 8:85408/1‑149 (MQ=255) aaCAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGTTGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCT‑GACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTgg < 7:245220/147‑1 (MQ=255) aaCAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTg < 7:282853/147‑1 (MQ=255) aCAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTa < 3:129478/149‑1 (MQ=255) aCAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTa < 2:206256/149‑1 (MQ=255) ccAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGa < 6:203558/149‑1 (MQ=255) cAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTAc < 6:187526/145‑1 (MQ=255) cAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTAc > 5:187526/1‑145 (MQ=255) cccGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTc > 3:255138/1‑149 (MQ=255) gCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGATCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg < 1:282214/149‑1 (MQ=255) ggAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCtt < 4:255138/148‑1 (MQ=255) aGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTGGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAAc < 6:326479/149‑1 (MQ=255) gCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAAcc < 3:229449/149‑1 (MQ=255) gCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAAcc > 4:203392/1‑149 (MQ=255) aCGGCCATCTGGGCTTCATGCTTGCCCACGCACCCAAGCCGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCAGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTCCCGCCCCTGGCCTTGCTGGTACTGACATTGCTCGGGCTTAACCTg > 6:246461/1‑149 (MQ=255) ggCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGc < 5:67019/118‑1 (MQ=255) ggCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGc > 6:67019/1‑118 (MQ=255) ggCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGt < 7:103529/149‑1 (MQ=255) ggCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGt > 8:103529/1‑149 (MQ=255) cATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTgg > 5:249988/1‑118 (MQ=255) cATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTgg < 6:249988/118‑1 (MQ=255) cTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACctggctgg > 3:346108/1‑149 (MQ=255) ttGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCtt > 5:239934/1‑129 (MQ=255) ttGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCtt < 6:239934/129‑1 (MQ=255) ttGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCtggctggc > 6:373297/1‑149 (MQ=255) ttGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCtggctggc > 8:116934/1‑149 (MQ=255) gATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCtt < 7:136260/117‑1 (MQ=255) gATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCtt > 8:136260/1‑117 (MQ=255) gCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTAcc > 3:113429/1‑149 (MQ=255) ttGCCGACGCAGCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGAc < 5:264003/133‑1 (MQ=255) ttGCCGACGCAGCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGAc > 6:264003/1‑133 (MQ=255) ttGCCGACGCAGCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGACTTGACCCTTGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGAc < 5:264009/133‑1 (MQ=255) ttGCCGACGCAGCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCAAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGAACTTGCTCTGGCTTAAACTGGTGAc > 6:264009/1‑133 (MQ=255) ccGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACctgctg < 7:116934/149‑1 (MQ=255) aCCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGcc > 1:198627/1‑149 (MQ=255) | GGCCTGGACCTTTGCCAGCAGGGCAAACCGCCTGCTTTCTGCCCCGAGGCACTGGTCACTAGCCAGTTCCCACTTAGCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCC > NC_002947/3556268‑3556562 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |