Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,571,677 | C→G | 5.3% | R236G (CGC→GGC) | yneJ → | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,571,677 | 0 | C | G | 5.3% | 246.0 / 3.8 | 75 | R236G (CGC→GGC) | yneJ | LysR family DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/35); new base G (2/2); total (38/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.08e-01 |
CGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCT > NC_002947/3571536‑3571816 | cgcgCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCAt < 1:28307/149‑1 (MQ=255) cgcgCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCAt < 7:334686/149‑1 (MQ=255) ccAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTc < 3:270503/149‑1 (MQ=255) ttCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACaa < 4:371153/147‑1 (MQ=255) ttCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAata > 3:226860/1‑149 (MQ=255) ttCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAat < 4:152353/148‑1 (MQ=255) cATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATg > 3:192090/1‑149 (MQ=255) cATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGTTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTg < 3:299893/149‑1 (MQ=255) tCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCGCGGCAGCAt < 5:282495/126‑1 (MQ=255) tCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCGCGGCAGCAt > 6:282495/1‑126 (MQ=255) aCTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTgcag > 1:109623/1‑148 (MQ=255) ttCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CAc > 1:334643/1‑149 (MQ=255) cGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCg > 2:37955/1‑149 (MQ=255) gAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGt > 2:284838/1‑149 (MQ=255) aaaaCTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCgcagc > 7:96808/1‑116 (MQ=255) aaaaCTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCgcagc < 8:96808/116‑1 (MQ=255) aaaCTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGt > 7:157309/1‑147 (MQ=255) gTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCt > 2:136083/1‑149 (MQ=255) ttCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTg < 4:226860/149‑1 (MQ=255) aCCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCg < 5:175541/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 8:157309/149‑1 (MQ=255) cAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCgga < 2:109623/149‑1 (MQ=255) ggCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCggagg < 2:334643/149‑1 (MQ=255) ggCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCggag > 5:22634/1‑148 (MQ=255) ggCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCggag > 5:116173/1‑148 (MQ=255) ccGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCg > 8:315876/1‑149 (MQ=255) cGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGc > 1:18643/1‑149 (MQ=255) ggCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTa < 1:37955/149‑1 (MQ=255) gCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTAt > 7:145209/1‑149 (MQ=255) aGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTg < 7:257064/149‑1 (MQ=255) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAAcc > 2:106853/1‑149 (MQ=255) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAAcc > 3:361977/1‑149 (MQ=255) aCGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAAcc > 8:199844/1‑149 (MQ=255) gAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctg > 3:344892/1‑149 (MQ=255) aTGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCATGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggct > 7:134699/1‑149 (MQ=255) gAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGt < 4:361977/149‑1 (MQ=255) gAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGt < 7:199844/149‑1 (MQ=255) aGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTa < 1:284838/149‑1 (MQ=255) gTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTAt < 2:18643/149‑1 (MQ=255) tCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATg < 6:22634/149‑1 (MQ=255) gTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggctg < 6:230739/142‑1 (MQ=255) gTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACctggctg > 5:230739/1‑142 (MQ=255) gTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGc > 1:122699/1‑149 (MQ=255) tACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGc > 4:6536/1‑148 (MQ=255) ccACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGcga < 2:122699/148‑1 (MQ=255) cGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAg < 4:344892/149‑1 (MQ=255) ggCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAgg > 6:192569/1‑149 (MQ=255) gCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGt < 6:116173/149‑1 (MQ=255) tGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACg < 1:136083/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACgg > 4:339993/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGt > 5:143171/1‑149 (MQ=255) gCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGtctc > 1:5588/1‑149 (MQ=255) cTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACct > 7:134594/1‑119 (MQ=255) cTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACct < 8:134594/119‑1 (MQ=255) cTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTcgc < 8:145209/149‑1 (MQ=255) tCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTTCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTAACTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGt < 1:260597/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACg < 8:252179/136‑1 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACg > 7:252179/1‑136 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCa > 1:3280/1‑146 (MQ=255) cAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCa < 2:3280/146‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCt > 7:95476/1‑75 (MQ=255) gTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCt < 8:95476/75‑1 (MQ=255) cGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGc < 7:315876/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGt > 5:70354/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTc < 3:6536/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAGTCACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACGTGGCTGGTATGGCGACGAGGTCCGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTc > 1:92272/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGc < 5:105391/142‑1 (MQ=255) cGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGc > 6:105391/1‑142 (MQ=255) gCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGt > 6:79738/1‑148 (MQ=255) gagcATGCTGCGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTc > 5:113451/4‑79 (MQ=38) gagcATGCTGCGCGGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTc < 6:113451/76‑1 (MQ=38) gCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGtt > 7:294235/1‑149 (MQ=255) ccATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTg > 6:338853/1‑149 (MQ=255) cATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGc < 5:79738/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCt < 3:339993/149‑1 (MQ=255) | CGCGCCAACTGTTCATACCGCCATCACTTCGAAAACTGGTTCGTGCAGGACCAGGCGGTACCGGGCAAGATTCACGAAATGGAGTCGTACCACGGCATGTTGGCCTGCGTCAGTGCGGGTGCCGGCCTGGCCATGCTGCCGCGCAGCATGCTCGACAATATGCCCGGGTGCAG‑CACCGTCAGCGCCTGGCCAATGTCGGAGGACTTCCGCTATCTGAAAACCTGGCTGGTATGGCGACGAGGTACGGTCTCGCGCAGTTTGAGCATGTTCGTGAAGTTGCT > NC_002947/3571536‑3571816 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |