| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,704,538 | A→G | 5.8% | G488G (GGT→GGC) | paaZ ← | bifunctional oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,704,538 | 0 | A | G | 5.8% | 203.0 / 2.2 | 69 | G488G (GGT→GGC) | paaZ | bifunctional oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/34); new base G (2/2); total (33/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
AGTAGCGACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTGGCGGCCACGCTG > NC_002947/3704390‑3704685 | aGTAGCGACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCCCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCCCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCACGCCTCCCAGCTCTTca > 3:203683/1‑149 (MQ=255) gTAGCGACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTcac < 2:303846/149‑1 (MQ=255) gTAGCGACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTcac < 2:287399/149‑1 (MQ=255) gCGACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTcaccac < 8:6968/149‑1 (MQ=255) cGACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCaccacc > 4:287883/1‑149 (MQ=255) gACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCAccg > 8:199037/1‑149 (MQ=255) ggAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATTCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCAccgccg < 7:84986/149‑1 (MQ=255) aCGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGgcg < 8:42950/149‑1 (MQ=255) ttCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCGCCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGc > 3:68487/1‑149 (MQ=255) ttCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCGCCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGc > 3:63424/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGcc > 2:328168/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCAc > 5:110796/1‑149 (MQ=255) gATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGGCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTGTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCt < 4:203683/149‑1 (MQ=255) aTCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCtt > 1:171284/1‑149 (MQ=255) aCTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAg < 1:328168/149‑1 (MQ=255) cTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCaccacc > 2:102230/1‑118 (MQ=255) cTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCaccacc < 1:102230/118‑1 (MQ=255) cTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGc < 7:199037/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCt > 1:224132/1‑149 (MQ=255) gccgccgcGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGc < 3:209538/148‑1 (MQ=255) gccgccgcGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCg > 8:124796/1‑149 (MQ=255) cgccgcGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGc < 1:94133/149‑1 (MQ=255) ccgcGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCGCCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAg < 4:63424/149‑1 (MQ=255) ccgcGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCGCCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAg < 4:68487/149‑1 (MQ=255) gcgcACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAgcg < 3:287883/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGc < 8:251817/133‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGc > 7:251817/1‑133 (MQ=255) cTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGt < 2:171284/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGt > 1:266339/1‑148 (MQ=255) tCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTg > 7:325994/1‑149 (MQ=255) tCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTg > 5:111027/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGAc > 6:370062/1‑149 (MQ=255) tGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTTCTTCACGGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGATCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTg < 2:312806/149‑1 (MQ=255) tGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTg < 8:325994/149‑1 (MQ=255) aGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTgg < 6:110796/148‑1 (MQ=255) gCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCt > 1:354356/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCGAGCCTTGTACCGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCt < 3:352332/107‑1 (MQ=255) gCTCGGCGAGCCTTGTACCGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCt > 4:352332/1‑107 (MQ=255) gCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTa > 3:78015/1‑149 (MQ=255) gCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTa < 4:126925/149‑1 (MQ=255) gAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATc > 4:204062/1‑149 (MQ=255) gAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATc < 6:111027/149‑1 (MQ=255) gCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGa < 2:224132/149‑1 (MQ=255) ccTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAg > 3:129752/1‑149 (MQ=255) ttGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCa > 5:35405/1‑149 (MQ=255) gTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAgc < 4:234630/101‑1 (MQ=255) gTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCAc < 7:124796/148‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACcag < 3:70482/148‑1 (MQ=255) tGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACcagca > 8:99236/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACcag > 1:63302/1‑147 (MQ=255) cAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACcagca < 2:266339/147‑1 (MQ=255) aGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCa < 5:370062/149‑1 (MQ=255) aGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCa < 7:99236/149‑1 (MQ=255) gCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCCTCGGGCCACCGTGCTTGCGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGCCGCCTTGGCAGCATGGCTATCGAGAACCAGCACCCGGCCATGCCAGgccg > 1:273182/1‑146 (MQ=255) gCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGgcagca < 3:23158/149‑1 (MQ=255) cTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCTGCCTGGCATGGCCGgctgctg < 6:35405/149‑3 (MQ=255) cTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGgcagca < 8:179124/148‑1 (MQ=255) ttCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGTCGGCCATGCCAGGCagcagc > 3:163491/1‑149 (MQ=255) ccGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCAcc > 7:77465/1‑149 (MQ=255) cgcacgcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCg > 4:263437/1‑149 (MQ=255) cgcacgcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCg < 3:263437/149‑1 (MQ=255) cacgcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCgg > 4:8197/1‑148 (MQ=255) gcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGgc < 3:327778/133‑1 (MQ=255) gcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGgc > 4:327778/1‑133 (MQ=255) gcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCg < 3:68075/144‑1 (MQ=255) gcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCg > 4:68075/1‑144 (MQ=255) gcaGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGa > 4:283790/1‑147 (MQ=255) ggCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGcc < 2:354356/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTg > 6:350060/1‑83 (MQ=255) ccAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTg < 5:350060/83‑1 (MQ=255) cAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTggcgg < 6:224737/149‑1 (MQ=255) aGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATa < 2:73710/138‑1 (MQ=255) aGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATa > 1:73710/1‑138 (MQ=255) aGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTggcggc < 3:308043/149‑1 (MQ=255) ttCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTGGCGGCCACGc > 8:322378/1‑149 (MQ=255) ttCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCGATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTGGCGGCCACGc > 7:198603/1‑149 (MQ=255) caccacCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTGGCGGCCACGCTg > 7:1115/1‑149 (MQ=255) accaccGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTGGCGGCCACGCTg < 4:78015/148‑1 (MQ=255) | AGTAGCGACGGAACGGGTGTACTTCGGTTTCGATCACTTCGCCGCCGCGCACGTACTCGCCGGTGACCGCCGTGAGCATGCTCGGCGAGCCTTGTACTGCAGCGCGCTGCAGGTAGTGCTTCACCGCACGCAGGCCTCCCAGCTCTTCACCACCGCCGGCGCGGCC‑CGGGCCACCGTGCTTGAGCTGCGGCAGCGGCGAGCCGTGACCGGTGGACTCCTTGGCAGCCTGGCTATCGAGCACCAGCAGCCGGCCATGCCAGGCAGCAGCCACCGGGATAGCCTTGGCGGCCACGCTG > NC_002947/3704390‑3704685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |