Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,879,748 | T→C | 6.6% | F528S (TTC→TCC) | mexF → | multidrug RND transporter MexF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,879,748 | 0 | T | C | 6.6% | 174.1 / 2.4 | 61 | F528S (TTC→TCC) | mexF | multidrug RND transporter MexF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/27); new base C (2/2); total (31/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.88e-01 |
ACCGTCATTTCGGCGTTCAACTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCGGTTTCGTGCCGGCCCAG > NC_002947/3879603‑3879893 | aCCGTCATTTCGGCGTTCAACTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGttctt < 1:146165/149‑1 (MQ=255) ccGTCATTTCGGCGTTCAACTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGttcttc < 1:241864/149‑1 (MQ=255) gTTCAACTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGgccagc > 7:312324/1‑148 (MQ=255) aaCTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCgg < 7:218946/138‑1 (MQ=255) aaCTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCgg > 8:218946/1‑138 (MQ=255) aaCTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCcaca < 4:352488/148‑1 (MQ=255) aaCTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCcaca < 2:117073/148‑1 (MQ=255) aCCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGttcttc < 4:342906/123‑1 (MQ=255) aCCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGttcttc > 3:342906/1‑123 (MQ=255) cccTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGt < 2:82461/149‑1 (MQ=255) ccTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTg > 1:82506/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGTTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCggg > 8:274254/1‑149 (MQ=255) gcgGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCg > 5:50512/1‑149 (MQ=255) cgGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCg > 5:323965/1‑148 (MQ=255) tgctCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGc > 8:248037/1‑149 (MQ=255) gctCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCg > 4:290590/1‑149 (MQ=255) ctCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCggg < 2:322728/100‑1 (MQ=255) ctCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCggg > 1:322728/1‑100 (MQ=255) ctCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCgg > 6:20936/1‑149 (MQ=255) gATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGc > 3:104339/1‑149 (MQ=255) tcatcaCGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGccc > 3:296422/1‑149 (MQ=255) aCGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTc > 3:255211/1‑149 (MQ=255) aCGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTc < 4:104339/149‑1 (MQ=255) aCGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTc < 6:354136/149‑1 (MQ=255) aCGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCACGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTc > 1:29028/1‑149 (MQ=255) ccAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTAt > 8:28053/1‑149 (MQ=255) ccAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTAt > 2:201124/1‑149 (MQ=255) aaGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGc > 4:235784/1‑149 (MQ=255) aaGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACACCTACGTCGGTGGCGTTCGCCCGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTAttc > 4:261350/1‑147 (MQ=255) ggACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCg < 7:28053/149‑1 (MQ=255) aCCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGc < 5:20936/149‑1 (MQ=255) tttCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCt < 6:19857/83‑1 (MQ=255) tttCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCt > 5:19857/1‑83 (MQ=255) tgtcGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTTGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCCACCGGTGCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGAt < 3:261350/146‑1 (MQ=255) gcgGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGt < 7:274254/148‑1 (MQ=255) cgGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTc > 1:133428/1‑148 (MQ=255) tCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGacc > 5:180619/1‑149 (MQ=255) cTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGacct < 2:82506/148‑1 (MQ=255) cTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATCCCGGCCTGATGGGTCTGaccta > 6:258183/1‑149 (MQ=255) aGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGc < 6:323965/149‑1 (MQ=255) gctgctGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCt > 5:36427/1‑149 (MQ=255) ctgGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTtctc < 8:312324/149‑1 (MQ=255) ctgGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTtctc < 2:29028/149‑1 (MQ=255) ctgGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTtctc < 6:180619/149‑1 (MQ=255) tgGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCACCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATgg < 6:75772/126‑1 (MQ=255) ggCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGt < 6:36427/148‑1 (MQ=255) ctggctgTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTtctc > 5:54156/1‑141 (MQ=255) ctggctgTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTtctc < 6:54156/141‑1 (MQ=255) ggctgTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTa < 6:331744/103‑1 (MQ=255) ggctgTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTa > 5:331744/1‑103 (MQ=255) ttCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCg < 4:296422/148‑1 (MQ=255) ttCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCg < 1:201124/148‑1 (MQ=255) tcCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTc < 2:38897/90‑1 (MQ=255) tcCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTc > 1:38897/1‑90 (MQ=255) tcCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTc < 2:213874/123‑1 (MQ=255) tcCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTc > 1:213874/1‑123 (MQ=255) cccTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCGGTTTc < 7:248037/148‑1 (MQ=255) cccTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCACTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCGGtt < 6:50512/146‑1 (MQ=255) cccTTTCAACCGGTCCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGAcc > 6:33329/1‑142 (MQ=255) cccTTTCAACCGGTCCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGAcc < 5:27849/142‑1 (MQ=255) cccTTTCAACCGGTCCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGAcc > 6:27849/1‑142 (MQ=255) cccTTTCAACCGGTCCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGAcc < 5:33329/142‑1 (MQ=255) ccTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCGGTTTCGt > 4:241480/1‑149 (MQ=255) ccGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCCAATCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCGGTTTCGTGCCGGcc > 1:111255/1‑149 (MQ=255) ggTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCGGTTTCGTGCCGGCCCAg < 2:133428/149‑1 (MQ=255) | ACCGTCATTTCGGCGTTCAACTCGCTGACCCTGTCGCCAGCCTTGGCCGCGGTGCTGCTCAAGGATCATCACGCACCCAAGGACCGTTTCTCGCGGTTCCTCGACAAGCTGCTGGGCAGCTGGCTGTTCTCCCCTTTCAACCGGTTCTTCGACCGGGCCAGCCACAGCTACGTCGGTGGCGTGCGCCGGGTCATCCGCTCC‑AGCGGCATCGCCCTGTTCGTGTATGCCGGCCTGATGGGTCTGACCTACCTCGGCTTCTCGTCCACGCCGACCGGTTTCGTGCCGGCCCAG > NC_002947/3879603‑3879893 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |