| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,893,484 | G→C | 5.9% | G283A (GGC→GCC) | rarD → | chloramphenicol‑sensitive protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,893,484 | 0 | G | C | 5.9% | 221.6 / 3.7 | 68 | G283A (GGC→GCC) | rarD | chloramphenicol‑sensitive protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/27); new base C (2/2); total (39/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.51e-01 | |||||||||||
TGCCATTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGCAAGCTCATC > NC_002947/3893337‑3893631 | tgcCATTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGc > 7:341652/1‑149 (MQ=255) ccATTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGCTGTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACAATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCt > 1:283398/1‑149 (MQ=255) ccATTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGc < 5:373473/147‑1 (MQ=255) ccATTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGc < 2:34058/147‑1 (MQ=255) aTTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTc < 5:91234/148‑1 (MQ=255) aTTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTc > 6:91234/1‑148 (MQ=255) aGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGc < 7:125867/148‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCAc > 1:9877/1‑149 (MQ=255) gCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAAGCCCTCAAGCAc < 1:371793/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCAcc > 7:193678/1‑149 (MQ=255) ccTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAAGCCCTCAAGCAcc < 4:213530/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCt < 2:283398/149‑1 (MQ=255) tGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTg > 1:236127/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGc > 5:163280/1‑148 (MQ=255) gCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGt > 7:206513/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGt < 7:253307/149‑1 (MQ=255) cTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCa > 2:271638/1‑133 (MQ=255) cTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCa < 1:271638/133‑1 (MQ=255) tGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTTCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACATACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTAAGTccg > 2:260219/1‑147 (MQ=255) cTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCg > 8:28780/1‑149 (MQ=255) tCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑g < 2:9877/149‑1 (MQ=255) tCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑g < 1:348786/149‑1 (MQ=255) ctgGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGCTTACACCGAAcg < 2:236127/149‑2 (MQ=255) tAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCGGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGc < 4:42858/149‑1 (MQ=255) tAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGc < 8:193678/149‑1 (MQ=255) tAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGc < 7:28780/149‑1 (MQ=255) tggcgtTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTAccc > 7:32995/1‑149 (MQ=255) gtTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCAcc < 8:178399/98‑1 (MQ=255) gtTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCAcc > 7:178399/1‑98 (MQ=255) gtTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCg > 4:345507/1‑149 (MQ=255) gtTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCg > 2:336812/1‑149 (MQ=255) tgctgcTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGct > 6:252798/1‑149 (MQ=255) tgGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCaa > 2:329074/1‑149 (MQ=255) ggCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAAc < 8:32995/148‑1 (MQ=255) cGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGc > 1:173480/1‑149 (MQ=255) gAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCAGACCTACCTGCCAAACTGGGCCGCAGTACTGGAGCTGGTGATTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGcc > 8:239591/1‑149 (MQ=255) ccATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCa > 8:288801/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACg > 7:15340/1‑149 (MQ=255) gCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCa < 6:163280/149‑1 (MQ=255) gCCCGGATCAGAGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCa < 8:341652/149‑1 (MQ=255) cccGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCAcc < 6:357688/74‑1 (MQ=255) cccGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCAcc > 5:357688/1‑74 (MQ=255) cccGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTgg > 6:212446/1‑114 (MQ=255) cccGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTgg < 5:212446/114‑1 (MQ=255) cccGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAg > 7:229813/1‑149 (MQ=255) gATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATc < 2:173480/149‑1 (MQ=255) tCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCa < 5:252798/149‑1 (MQ=255) acctacctGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTcc < 8:15340/147‑1 (MQ=255) ctacctGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGc > 7:351579/1‑149 (MQ=255) cctGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCCTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAg > 4:90711/1‑149 (MQ=255) tGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGcc > 4:103469/1‑149 (MQ=255) gCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTACTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTTTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGATATTCAACCGCCTCCACGGTCAGAAACAAGCCATACCAGGCAAGCCg > 7:235557/1‑149 (MQ=255) ccAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCg < 1:336812/148‑1 (MQ=255) cAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGt > 8:319242/1‑149 (MQ=255) tGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCAcc > 6:104756/1‑148 (MQ=255) gggCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGa > 2:122884/1‑149 (MQ=255) cAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCg > 4:138780/1‑149 (MQ=255) ctggtgctggtgCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTGAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTTAGCCGTACCTGGCGTACGCGTCGCTGTTCAACCTCCTCCACGGTGAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAg < 7:239591/148‑1 (MQ=255) tggtgctTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCAACGACCATCGGCAGGCGGTCCa > 7:58326/1‑149 (MQ=255) aggtgctTGAAGCCCTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTc > 7:102770/2‑147 (MQ=255) aggtgctTGAAGCCCTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCACCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTc > 6:51066/2‑147 (MQ=255) gtgctTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGc < 8:206513/149‑1 (MQ=255) tgctTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGCa < 8:229813/149‑1 (MQ=255) gctTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTCGGGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCAACCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGc > 1:258558/1‑148 (MQ=255) gctTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTc > 4:24926/1‑143 (MQ=255) gctTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTc < 3:24926/143‑1 (MQ=255) ctTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGCAAg > 5:370167/1‑149 (MQ=255) ttGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGCAAg > 4:357285/1‑148 (MQ=255) ggCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAg > 4:130896/1‑104 (MQ=255) ggCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAg < 3:130896/104‑1 (MQ=255) ggCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGCAAGCtcatc < 3:103469/149‑1 (MQ=255) | TGCCATTCAGCCTGTTCGGCCTGCTCAGCTACGTCGAACCCGTGCTGCTGGTAGGC‑GTGGCGTTGCTGCTGGGCGAAACCATCGGCCCGGATCAGTGGCTGACCTACCTGCCAATCTGGGCCGCAGTACTGGTGCTGGTGCTTGAGGGCTTCAAGCACCTGCTACGTCAGCGTCGCCGTTC‑GGTGTAAGCCGAACCTGGCGTACCCGTCGCTCTTCAACCGCCTCCACGGTCAGCATCCAGCCATTCCAGGCTAGCCGGTCACCGACCATCGGCAGGCGGTCCAGCAAGCTCATC > NC_002947/3893337‑3893631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |