Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,027,751 | T→A | 8.1% | I227F (ATC→TTC) | PP_3552 ← | two‑component system sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,027,751 | 0 | T | A | 8.1% | 179.4 / 5.6 | 65 | I227F (ATC→TTC) | PP_3552 | two‑component system sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/31); new base A (2/3); total (30/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
CAGGCCCTGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCC > NC_002947/4027608‑4027896 | cAGGCCCTGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATgcgc > 5:364182/1‑148 (MQ=255) aGGCCCTGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCATCGAAGCGCag < 7:350392/149‑2 (MQ=255) ggCCCTGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAg < 6:364182/149‑1 (MQ=255) gCCCTGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAgg < 6:180767/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGa < 5:329684/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGAt > 2:53036/1‑149 (MQ=255) gTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTcg‑‑‑‑c > 2:300753/1‑149 (MQ=255) gTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGACGCGCAAGGTGATGTcg‑‑‑‑c > 2:185181/1‑149 (MQ=255) tAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCATCGAAGCGCa > 2:34162/1‑136 (MQ=255) tAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGAGCGCCAGGCTTTCCTGCGCATCGAAGCGCa < 1:34162/136‑1 (MQ=255) aCGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑Cgg < 6:104485/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCACGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACg > 6:356079/1‑148 (MQ=255) gTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGacca > 6:365070/1‑149 (MQ=255) gCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTc > 1:116503/1‑149 (MQ=255) aTAGTTGAGCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCAGAGGCCAGCTCGCCGAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGGGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACGACCTcca < 4:257935/149‑1 (MQ=255) aTAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTcca > 7:260878/1‑149 (MQ=255) tAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTccac < 5:365070/149‑1 (MQ=255) aGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTccac > 7:35353/1‑148 (MQ=255) caccGCGGCCAGTGGCTGATTGTTCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACcaccgcac > 1:251689/1‑149 (MQ=255) caccGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTc > 6:243221/1‑138 (MQ=255) caccGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTc < 5:243221/138‑1 (MQ=255) ggCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGgtgt < 3:299053/149‑1 (MQ=255) ccAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAg < 2:220734/149‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAgg > 8:59874/1‑149 (MQ=255) tgattgatCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAgg < 1:254904/94‑1 (MQ=255) tgattgatCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAgg > 2:254904/1‑94 (MQ=255) gatCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACAACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCg > 8:100419/1‑149 (MQ=255) tctcGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACAAGCTGACAACCTCCACCACCGCACCGGTCTAGGTATCACGGATCGcc > 5:48632/1‑149 (MQ=255) ggCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTg < 8:35353/148‑1 (MQ=255) gCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGc < 5:356079/149‑1 (MQ=255) gCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGc < 1:76732/149‑1 (MQ=255) gCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCTCCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGAttt > 4:243733/1‑149 (MQ=255) cccGAGGCGAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTc < 4:144012/149‑1 (MQ=255) cccGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTc < 2:116503/149‑1 (MQ=255) ccGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTc > 2:250063/1‑148 (MQ=255) gAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCTCCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGaa < 3:243733/149‑1 (MQ=255) gAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGaa < 1:53036/149‑1 (MQ=255) gCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAAcc > 3:239824/1‑148 (MQ=255) ccAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCGCCTCCTGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGaa < 1:300753/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACg < 2:251689/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACgg < 1:250063/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACgg < 1:136178/149‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACgg > 1:41734/1‑147 (MQ=255) cgcgCAGGGTAGAGAGTCGGGCTCTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCAGCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTa < 6:48632/148‑1 (MQ=255) gCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGACGATTTCGAACCAACGGTa < 5:50784/147‑1 (MQ=255) ggTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGcctcct < 8:260878/148‑1 (MQ=255) gCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGACGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGc < 1:185181/149‑1 (MQ=255) aGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTg < 3:166311/149‑1 (MQ=255) ggCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTgg > 5:330854/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCa < 4:239824/148‑1 (MQ=255) gcCCGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCCCGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGCCCACCTCCACCACCGCACCGGTGTCGATCTCACTGATCGCCCTAAAATAAAAAAAAAAAAAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAgg > 6:143968/1‑148 (MQ=255) gcCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGc < 4:253941/101‑1 (MQ=255) cAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGGAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGGCa > 8:333026/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGAAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCa > 5:270178/1‑149 (MQ=255) ggCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGGCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATc < 8:252553/149‑1 (MQ=255) gCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGc > 2:138555/1‑131 (MQ=255) gCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGc < 1:138555/131‑1 (MQ=255) ccttGCGCATCGAAGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGtgtg > 4:17920/4‑149 (MQ=255) cTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATc < 6:45548/142‑1 (MQ=255) cTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATc > 5:45548/1‑142 (MQ=255) cgcATCGAAGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAg < 3:17920/148‑1 (MQ=255) cTTCGATGCGCAAGGAGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACgg > 5:232904/1‑101 (MQ=255) cTTCGATGCGCAAGGAGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACgg < 6:232904/101‑1 (MQ=255) ttCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGt > 4:84695/1‑149 (MQ=255) cGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTcc > 6:103272/1‑149 (MQ=255) | CAGGCCCTGCAGGTAACGCTGACTGGCGTTGGCATAGTTGACCACCGCGGCCAGTGGCTGATTGATCTCGTGGGCGATGCCCGAGGCCAGCTCGCCCAGGGTAGCGAGGCGGGCACTGTGCGCCAGGCTTTCCTGCGCTTCGATGCGCAAGGTGATGTCG‑‑‑‑CGGGACACGCTGACCACCTCCACCACCGCACCGGTGTAGGTCTCACGGATCGCCCGGCTGGCGATTTCGAACCAACGGTAGCCTCCTGTCGCCTGGCGTACCCGGCAGGTCATCGTGTGGTAGCCGTCC > NC_002947/4027608‑4027896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |