| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,339,609 | T→C | 5.2% | V239A (GTC→GCC) | ribAB‑II → | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,339,609 | 0 | T | C | 5.2% | 230.7 / 2.4 | 77 | V239A (GTC→GCC) | ribAB‑II | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/35); new base C (2/2); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
GCACCATCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGGC > NC_002947/4339462‑4339757 | gCACCATCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGt > 8:3588/1‑148 (MQ=255)gCACCATCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGt < 6:227798/148‑1 (MQ=255)gCACCATCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTCAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTc < 6:247415/149‑1 (MQ=255) cATCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATgg < 3:14827/149‑1 (MQ=255) cATCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATgg < 4:230685/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATggg > 3:115740/1‑149 (MQ=255) aTCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATggg > 4:31718/1‑149 (MQ=255) tCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGc < 7:3588/149‑1 (MQ=255) cGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGGGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACa > 1:97325/1‑149 (MQ=255) cTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTcg > 5:102695/1‑149 (MQ=255) taaTCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCATCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTcgc > 1:120403/3‑149 (MQ=255) aTCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTcgccg > 1:299473/1‑149 (MQ=255) tCCACTACCGCCTGCGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTcgccgc < 3:31718/149‑1 (MQ=255) cACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCcgcg < 3:329426/148‑1 (MQ=255) cGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGcc < 2:121453/149‑1 (MQ=255) gCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGTGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGcc > 6:25292/1‑148 (MQ=255) aGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCt > 6:72676/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGACCATGGCCATGTGcacgc > 6:136118/1‑118 (MQ=255) cGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGACCATGGCCATGTGcacgc < 5:136118/122‑5 (MQ=255) cGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCAtg > 5:99044/1‑149 (MQ=255) cATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGc < 4:192388/131‑1 (MQ=255) cATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGc > 3:192388/1‑131 (MQ=255) ggCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCt < 2:97325/149‑1 (MQ=255) gcgagcgcgagcTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGAcc < 2:100355/144‑1 (MQ=255) gcgagcgcgagcTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGAcc > 1:100355/1‑144 (MQ=255) gcTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGTGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCtgg > 8:307094/1‑149 (MQ=255) ccGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTggg < 6:99044/149‑1 (MQ=255) gACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGa < 3:112978/122‑1 (MQ=255) gACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGa > 4:112978/1‑122 (MQ=255) aCGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGgcgc > 4:199491/1‑149 (MQ=255) gTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGTGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGa < 5:25292/149‑1 (MQ=255) gCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAg > 2:86582/1‑148 (MQ=255) aTGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCTCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTAc > 8:89231/1‑149 (MQ=255) gCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGc < 4:115740/148‑1 (MQ=255) cTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGcc > 7:5018/1‑149 (MQ=255) gTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACt < 8:5018/148‑1 (MQ=255) gTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACt < 5:72676/148‑1 (MQ=255) tCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTg > 2:341985/1‑148 (MQ=255) aCCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGTGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGAc > 2:312206/1‑149 (MQ=255) aCCTATGAAGACCACATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGAc > 6:184132/1‑149 (MQ=255) cTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCTCCGCGAACAGACGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑TCGACCTGGTGGGCTCCGAGTACGACGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGc > 1:324712/1‑149 (MQ=255) cTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGc > 8:282679/1‑149 (MQ=255) cTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGc > 1:319334/1‑149 (MQ=255) cTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGc > 1:324415/1‑149 (MQ=255) cTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGc > 5:341742/1‑149 (MQ=255) tGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCtgg < 1:158730/110‑1 (MQ=255) tGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCtgg > 2:158730/1‑110 (MQ=255) tGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtgt > 8:296643/1‑149 (MQ=255) tGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtg < 2:299473/148‑1 (MQ=255) aaGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCTGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtgt < 1:86582/148‑1 (MQ=255) aaGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtgtg < 6:341742/148‑1 (MQ=255) aaGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtgtg < 6:102695/148‑1 (MQ=255) aaGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtgtg < 2:120403/148‑1 (MQ=255) gACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGggc < 7:282679/149‑1 (MQ=255) cATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGgcgc < 3:199491/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCgg > 1:121624/1‑69 (MQ=255) aTCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCgg < 2:121624/69‑1 (MQ=255) gAAGGTGGTGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGTCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGc < 7:307094/148‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtgtg < 2:150876/136‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCtgtg > 1:150876/1‑136 (MQ=255) aaGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTg > 8:319938/1‑146 (MQ=255) tGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAgg < 2:324415/149‑1 (MQ=255) ggCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGa > 6:31050/1‑86 (MQ=255) ggCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGa < 5:31050/86‑1 (MQ=255) ggCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCaa > 4:199038/1‑119 (MQ=255) ggCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCaa < 3:199038/119‑1 (MQ=255) acaTGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACg < 3:26281/119‑1 (MQ=255) acaTGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACg > 4:26281/1‑119 (MQ=255) acaTGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAgg > 7:44178/1‑141 (MQ=255) acaTGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAgg < 8:44178/141‑1 (MQ=255) tcgcccATGACCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTggg > 5:336646/5‑124 (MQ=255) tcgcccATGACCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTggg < 6:336646/120‑1 (MQ=255) aTGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAgg > 7:126985/1‑148 (MQ=255) ggCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCgg < 4:38456/99‑1 (MQ=255) ggCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCgg > 3:38456/1‑99 (MQ=255) gCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGt > 7:318807/1‑137 (MQ=255) gCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGt < 8:318807/137‑1 (MQ=255) gTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTg < 7:89231/148‑1 (MQ=255) gTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAAGACGCCGGCGCTGACGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGATGGTGGCTGAGGAAGGTAc > 1:304846/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGGc < 7:296643/149‑1 (MQ=255) | GCACCATCGCCGACCTGATCCACTACCGCCTGAGCACCGAGCAGACCGTCAAGCGCATCGGCGAGCGCGAGCTGCCGACGGTGCATGGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGC‑GCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCC‑‑‑CGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGGC > NC_002947/4339462‑4339757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |