| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,437,241 | T→C | 5.5% | V134A (GTG→GCG) | PP_3932 → | diguanylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,437,241 | 0 | T | C | 5.5% | 215.4 / 2.5 | 74 | V134A (GTG→GCG) | PP_3932 | diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/33); new base C (2/2); total (39/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.53e-01 | |||||||||||
TACCGGCTCTGTGGTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTCGGTGCGGGCCTTG > NC_002947/4437094‑4437386 | tACCGGCTCTGTGGTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCAtggtg < 6:36955/149‑1 (MQ=255)tACCGGCTCTGTGGTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCAtggtg > 5:245000/1‑149 (MQ=255) ccGGCTCTGTGGTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCAtggtgg < 7:48231/148‑1 (MQ=255) gCTCTGTGGTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTggcggc > 7:178828/1‑149 (MQ=255) gTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATgg < 8:321222/149‑1 (MQ=255) gTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATgg > 3:16955/1‑149 (MQ=255) ttAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATgg > 3:191048/1‑148 (MQ=255) cTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGt < 8:178828/149‑1 (MQ=255) tgtgCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGt > 7:43311/1‑148 (MQ=255) gCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATg > 2:366228/1‑149 (MQ=255) cAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATgg < 4:351407/149‑1 (MQ=255) cAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATgg > 2:233215/1‑149 (MQ=255) cAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATgg > 7:180712/1‑149 (MQ=255) aaTCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCAAGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGc > 2:365452/1‑149 (MQ=255) ttGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCa > 8:161241/1‑149 (MQ=255) tggtCCCCCGCTGGCAGCGGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGGTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTc < 8:155357/149‑1 (MQ=255) tggtCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTc < 1:366228/149‑1 (MQ=255) tggtCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTc < 3:57534/149‑1 (MQ=255) gtCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGa < 6:55718/149‑1 (MQ=255) tCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGaa > 7:261541/1‑149 (MQ=255) aCCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACa < 1:233215/149‑1 (MQ=255) cccTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAg > 5:20890/1‑149 (MQ=255) gCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGt < 3:311239/146‑1 (MQ=255) gCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTg < 4:275247/148‑1 (MQ=255) aGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGGGTACTCAGCGTGTTCGGCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTgcgc < 6:245000/149‑1 (MQ=255) aGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGAAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGAGGTAATGCCCGCACCCTGGATTGAACAGTCGTTgcgc > 2:27898/1‑149 (MQ=255) ctgTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCAc > 7:138765/1‑149 (MQ=255) tCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTg > 2:174805/1‑149 (MQ=255) gcTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTa < 1:174805/149‑1 (MQ=255) ttGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAAt > 2:338278/1‑104 (MQ=255) ttGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAAt < 1:338278/104‑1 (MQ=255) ccACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTg > 5:21805/1‑149 (MQ=255) cACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTgg > 7:219536/1‑149 (MQ=255) cGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCAGGCTAGCCAGGtg < 4:191048/149‑2 (MQ=255) attcACCGTCGCATTCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCg < 8:213083/109‑1 (MQ=255) aTGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCAAGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTAGATGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAg > 3:116674/1‑149 (MQ=255) aTGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAACGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTgcgcgc > 7:329715/1‑128 (MQ=255) aTGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAACGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTgcgcgc < 8:329715/128‑1 (MQ=255) aTGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCAAGGAGTACTCAGCGTGATCCCCGCCTGAGACGCCCCTGCCATGCAGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACACTGGTTCg > 7:213083/1‑112 (MQ=255) tGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGc < 8:138765/149‑1 (MQ=255) tGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGc < 6:20890/149‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCAt < 7:338501/79‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCAt < 5:131954/79‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCAt > 8:338501/1‑79 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCAt > 6:131954/1‑79 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAAt < 4:312961/91‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAAt > 3:312961/1‑91 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGc > 1:360451/1‑146 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGc < 2:360451/146‑1 (MQ=255) aCCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGaa < 8:43311/149‑1 (MQ=255) cGGTGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGaa > 3:282222/1‑147 (MQ=255) cGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGaa > 4:88717/1‑147 (MQ=255) gcATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑tc < 3:88717/149‑1 (MQ=255) gcAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGAcc > 8:351164/1‑149 (MQ=255) gCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGc < 6:66890/149‑1 (MQ=255) gCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCgtgc > 3:182028/1‑149 (MQ=255) aCTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGtgctgc > 1:228313/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGc > 7:58187/1‑106 (MQ=255) tCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGc < 8:58187/106‑1 (MQ=255) gCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGtg > 8:101355/1‑149 (MQ=255) cGTGTTGGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGGGGTAATGGCCGCACCCTTGTTTGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACATTATCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGtg < 1:27898/149‑1 (MQ=255) gtgtTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGtgct > 2:259473/1‑149 (MQ=255) gagccgccTTCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTgctgct < 4:16955/146‑1 (MQ=255) gccgccTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGc > 8:260402/1‑95 (MQ=255) gccgccTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGc < 7:260402/95‑1 (MQ=255) gccgccTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTa > 8:272667/1‑148 (MQ=255) gccgccTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTa < 6:21805/148‑1 (MQ=255) ccgccTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTa > 8:23370/1‑147 (MQ=255) tcgccgcCACCATGGCAGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGtgc < 4:358624/131‑1 (MQ=255) tcgccgcCACCATGGCAGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGtgc > 3:358624/2‑132 (MQ=255) tcgccgcCACCATGGCAGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTc > 5:65396/2‑148 (MQ=255) gccgccACCATGGCAGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTc < 6:65396/146‑1 (MQ=255) cgcTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTCGGTGc < 7:101355/149‑1 (MQ=255) cTGCCATGGTGTCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACGCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGTACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACATCGCCGTCTGTGCgg < 4:116674/149‑1 (MQ=255) cTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTCGGTGCgg < 8:261541/149‑1 (MQ=255) tGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTCGGTGCggg > 3:114616/1‑149 (MQ=255) aTGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTCGGTGCGGGCCtt > 2:149962/1‑149 (MQ=255) tggtggCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTCGGTGCGGGCCTTg < 7:23370/149‑1 (MQ=255) | TACCGGCTCTGTGGTTAAACCTGTGCAATCTTGGCGTGGTGGTCACCCTCTGGCAGCTGCTGTCGCGCTTGCCACGCATGCACCGGCGCATGCGCAGCCCGCACGGCGTACTCAGCGTGTTCGCCGCCTGCGCCGCCGCTGCCATGGTGGCGGCGAGCATGGCAGCGGTAATGGCCGCACCCTGGTTCGAACAGTCGTTGCGCGCCACCTGGCTAGCCTGGTTCAGCGAACAGT‑TCTCGACCGGCGTGCTGGTGCTGCCGGTGCTGCTTACAGCGCCCTCGGTGCGGGCCTTG > NC_002947/4437094‑4437386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |