Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,446,494 | G→C | 9.0% | L357L (CTC→CTG) | nicC ← | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,446,494 | 0 | G | C | 9.0% | 201.5 / 7.3 | 66 | L357L (CTC→CTG) | nicC | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/29); new base C (2/4); total (33/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCT > NC_002947/4446350‑4446630 | cgccATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGc > 4:93531/1‑148 (MQ=255) ccATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGACGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAg > 8:113885/1‑149 (MQ=255) aTAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTAACCACAAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGAACATAGAGGTAGTAGCCGTAAACCCAGCCTGGATCTTACTGGCTGTAGAGCCAGgt > 5:171511/1‑149 (MQ=255) tAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTCTACAGCCAggaa < 8:59559/149‑3 (MQ=255) tAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTCCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTCTACAGCCAggaa < 1:328871/149‑3 (MQ=255) gcgcAGGTAATGCTGGCGGATGCCTTTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGGTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑tt > 4:40335/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTAATGCTGGCGGAAGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑tt < 3:5827/149‑1 (MQ=255) cAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGc < 5:327009/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGAGGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGa > 1:10057/1‑149 (MQ=255) gCGGATGCCATTGGCCCTGACGTAACCACCACCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCATCCTGGCAGTAGACCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGa < 3:40335/149‑1 (MQ=255) ggATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGAtt < 3:93531/149‑1 (MQ=255) cATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCt > 1:323538/1‑149 (MQ=255) cATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCt < 4:254703/149‑1 (MQ=255) cATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCt > 1:321464/1‑149 (MQ=255) cATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCt > 7:40649/1‑149 (MQ=255) cgcTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGAt < 3:241220/148‑1 (MQ=255) ccaccaGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTTGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTg < 2:10057/149‑1 (MQ=255) caccaGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGc > 8:24145/1‑149 (MQ=255) gCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGccc > 6:103238/1‑135 (MQ=255) gCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGccc < 5:103238/135‑1 (MQ=255) gCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTg > 3:57805/1‑149 (MQ=255) gaAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCTGCTCTTTGCGGTTGGCTTc > 7:312763/1‑149 (MQ=255) gaAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTc < 2:321464/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATa < 4:182882/149‑1 (MQ=255) gTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATa > 4:119165/1‑148 (MQ=255) gCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACaa > 2:166316/1‑149 (MQ=255) cTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTTGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAAc < 2:323538/149‑1 (MQ=255) cTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAAc < 3:119165/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTTCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAAcgcg < 6:171511/149‑1 (MQ=255) tGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGa < 1:319313/149‑1 (MQ=255) gccTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGc > 2:348190/1‑149 (MQ=255) gccTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGc > 6:257002/1‑149 (MQ=255) cccGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGctct > 7:240498/1‑115 (MQ=255) cccGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGctct < 8:240498/115‑1 (MQ=255) cccGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGt < 5:257002/147‑1 (MQ=255) cGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCgg < 3:43058/149‑1 (MQ=255) cAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTc < 8:40649/148‑1 (MQ=255) ctgctgCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACa < 1:166316/149‑1 (MQ=255) cccATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGc < 1:227800/91‑1 (MQ=255) cccATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATAACGATTGCACCTGCGATGc > 2:227800/1‑90 (MQ=255) cATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGtc > 6:5291/1‑149 (MQ=255) gTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgca < 7:24145/149‑1 (MQ=255) cGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCCTACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgcagg < 4:80074/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCt > 4:64566/1‑143 (MQ=255) gTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCt < 3:64566/143‑1 (MQ=255) gTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTgcagg < 7:113885/148‑1 (MQ=255) gTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCggg > 7:116378/1‑149 (MQ=255) aCCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAg > 1:256494/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAAcgcg > 7:286887/1‑97 (MQ=255) ccAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAAcgcg < 8:286887/97‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCa > 7:304429/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTCGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCCTTGGATACCGATTCCACCTGCGATCCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGtcatca > 8:213684/1‑149 (MQ=255) aGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATg > 2:81129/1‑149 (MQ=255) tGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCcg > 5:221009/1‑149 (MQ=255) ggATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCcgc > 8:77525/1‑149 (MQ=255) ccaacaccTGGCTCTACAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCcgcg > 6:285037/7‑149 (MQ=255) aTCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCggtg < 5:352164/102‑1 (MQ=255) aTCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCggtg > 6:352164/1‑102 (MQ=255) tCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTc > 2:177490/1‑149 (MQ=255) caccTGGCTCTACAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCt < 5:285037/147‑1 (MQ=255) ccTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCt < 8:304429/147‑1 (MQ=255) cTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGc < 2:329232/133‑1 (MQ=255) cTGGCTCTACAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCggg < 2:284132/128‑1 (MQ=255) cTGGCTCTACAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCggg > 1:284132/1‑128 (MQ=255) ggCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTg < 3:241435/65‑1 (MQ=255) ggCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTg > 4:241435/1‑65 (MQ=255) | CGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCTGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTG‑TTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCT > NC_002947/4446350‑4446630 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |