Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,657,108 | T→A | 5.7% | P167P (CCT→CCA) | nuoB → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,657,108 | 0 | T | A | 5.7% | 218.1 / 2.1 | 70 | P167P (CCT→CCA) | nuoB | NADH‑quinone oxidoreductase subunit B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/35); new base A (2/2); total (33/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 |
TACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGCGTCGTGAGCAGCGCATTGCA > NC_002947/4656962‑4657252 | ctcGAGCATCTGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCt > 4:205862/3‑147 (MQ=255) cGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGa < 2:267663/147‑1 (MQ=255) gAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGc > 6:105243/1‑149 (MQ=255) gAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGc > 2:298857/1‑149 (MQ=255) aGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTc < 5:105243/149‑1 (MQ=255) aGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTc < 6:128372/149‑1 (MQ=255) gATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGGATGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCAGAGGCTTTc > 1:277716/1‑149 (MQ=255) ccGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGTCGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCtt < 1:91868/149‑1 (MQ=255) ccGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCtt < 3:96397/149‑1 (MQ=255) cGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCtt > 8:164213/1‑148 (MQ=255) cGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTg < 7:231346/149‑1 (MQ=255) aaaTGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGAt > 5:100781/1‑149 (MQ=255) tGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGAtgct > 3:194358/1‑149 (MQ=255) ggTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCAGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGAtgctg < 2:277716/148‑1 (MQ=255) ggTCAGTTCCATGGGTTCGTTCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGGCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGAtgctg < 4:247133/148‑1 (MQ=255) gTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCt < 8:245050/120‑1 (MQ=255) gTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCt > 7:245050/1‑120 (MQ=255) aTTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGCGGCTTTCCTGCAAGGCTTGAtgctgctg > 6:378254/1‑147 (MQ=255) cATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGt < 6:100781/149‑1 (MQ=255) ttCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCg < 1:298857/149‑1 (MQ=255) ccAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGaa > 1:169589/1‑149 (MQ=255) ccAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCACGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAAGAGTCGATCGGCCAAGaa > 6:348522/1‑149 (MQ=255) cAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAac > 2:245266/1‑149 (MQ=255) aaCTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAacg > 8:108839/1‑149 (MQ=255) ccGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTGCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGACAAGAACGAGGc > 7:189190/1‑149 (MQ=255) cATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCttt < 3:205862/149‑1 (MQ=255) aTGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTc < 2:90174/149‑1 (MQ=255) aTGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTc < 3:287566/149‑1 (MQ=255) aCATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgtt < 2:315639/149‑1 (MQ=255) aCATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgtt < 7:164213/149‑1 (MQ=255) aCATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgtt > 5:118852/1‑149 (MQ=255) aTCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgttgt > 1:224072/1‑149 (MQ=255) aTCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgttgt > 4:197368/1‑149 (MQ=255) aTCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGACCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgttgt > 3:318375/1‑149 (MQ=255) aCTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGa < 4:228871/73‑1 (MQ=255) aCTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGa > 3:228871/1‑73 (MQ=255) cTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCt < 6:363147/89‑1 (MQ=255) cTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTg < 1:245266/149‑1 (MQ=255) tCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGt > 5:205259/1‑106 (MQ=255) tCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGt < 6:205259/106‑1 (MQ=255) tCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCgg > 2:83460/1‑113 (MQ=255) tCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCgg < 1:83460/113‑1 (MQ=255) ggTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAgg < 2:112141/71‑1 (MQ=255) ggTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAgg > 1:112141/1‑71 (MQ=255) ggTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGAt > 8:299853/1‑148 (MQ=255) tCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATc > 8:301870/1‑147 (MQ=255) gTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAgg < 7:301870/149‑1 (MQ=255) gTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAg < 2:224072/148‑1 (MQ=255) ttCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAgg > 2:212635/1‑148 (MQ=255) aCAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGcc < 6:118852/149‑1 (MQ=255) gTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgt < 3:235310/117‑1 (MQ=255) gTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGgt > 4:235310/1‑117 (MQ=255) gTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGcc > 5:251593/1‑145 (MQ=255) ttCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGAt < 4:194358/149‑1 (MQ=255) tccCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGc > 4:320145/1‑147 (MQ=255) cccGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGGCCGCCACGCCCTGTGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTTCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGc < 5:348522/149‑1 (MQ=255) cccGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGc > 4:87106/1‑149 (MQ=255) cGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCTAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGccc < 7:299853/149‑1 (MQ=255) cGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGAt < 5:94229/141‑1 (MQ=255) cGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGAt > 6:94229/1‑141 (MQ=255) aCGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGaaa < 2:169589/149‑1 (MQ=255) tATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTgg > 2:146076/1‑104 (MQ=255) tATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTgg < 1:146076/104‑1 (MQ=255) tATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGaaa < 6:193508/144‑1 (MQ=255) tATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGaaa > 5:193508/1‑144 (MQ=255) tgtgCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCt < 6:251593/147‑1 (MQ=255) tgtgCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGc < 3:197368/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCCGCCACGCCCAGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGcgtcgt > 6:147471/1‑147 (MQ=255) tGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGCGTCGTGag > 2:156001/1‑147 (MQ=255) cccGCCACGCGGTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCATGAGTCGAGCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGCGTCGTGagcag < 5:378254/148‑1 (MQ=255) cACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGCGTCGTGAGCAGCGCAtt > 5:86327/1‑149 (MQ=255) aCGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGCGTCGTGAGCAGCGCATTg < 3:320145/149‑1 (MQ=255) gCCCAGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGCGTCGTGAGCAGCGCATTGCa < 5:147471/149‑1 (MQ=255) | TACGAGCAGATGCTCGAGCCGAAATGGGTCATTTCCATGGGTTCGTGCGCCAACTCCGG‑TGGCATGTACGACATCTACTCGGTCGTTCAGGGGGTCGACAAGTTCCTCCCCGTGGACGTCTATGTGCCTGGCTGCCCGCCACGCCCTGAGGCTTTCCTGCAAGGCTTGATGCTGCTGCAGGAGTCGATCGGCCAAGAACGACGCCCGCTTTCCTGGGTTGTTGGTGATCAAGGTATTTACCGTGCCGAGATGCCAGCCCAGAAAGACCTGCGTCGTGAGCAGCGCATTGCA > NC_002947/4656962‑4657252 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |