| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,669,734 | G→C | 5.6% | V22V (GTG→GTC) ‡ | nuoN → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,669,734 | 0 | G | C | 5.6% | 233.2 / 4.1 | 72 | V22V (GTG→GTC) ‡ | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/32); new base C (2/2); total (38/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.90e-01 | |||||||||||
CACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACAA > NC_002947/4669586‑4669880 | cacCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACggtg < 5:55789/149‑1 (MQ=255) ctctGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACggtggtg < 6:307597/149‑1 (MQ=255) ctctGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACggtggtg > 3:58281/1‑149 (MQ=255) ctctGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACggtggtg > 8:24790/1‑149 (MQ=255) ccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACggtggtggt < 4:240484/146‑1 (MQ=255) ccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGa < 3:50115/148‑1 (MQ=255) ccgccACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGa < 1:25216/148‑1 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGgtggtggtg < 4:58500/143‑1 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGgtggtggtg > 3:58500/1‑143 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTg < 5:335932/149‑1 (MQ=255) caccaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACCACCGTGGTGATGGTg < 2:295683/149‑1 (MQ=255) accaTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTgg < 4:58281/149‑1 (MQ=255) caTGATTGGTGTTGAGCAGTGTCTCGGATCCTCTTTCACTAAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGATCGCTATTGTATTCACCACTCAACACTTCATCGAATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACggtg < 4:249673/134‑1 (MQ=255) caTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGc > 3:186678/1‑148 (MQ=255) caTGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCACGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACggtg > 3:249673/1‑134 (MQ=255) tGAGTGGAGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTgg > 2:2264/1‑145 (MQ=255) tGAGTGGAGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTgg < 1:2264/145‑1 (MQ=255) gtgtGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCt < 4:307041/148‑1 (MQ=255) gtgtGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTg < 4:186678/149‑1 (MQ=255) tgtgCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTgg < 1:109419/149‑1 (MQ=255) cagcagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAgc < 5:67856/149‑1 (MQ=255) cagcagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAgc < 6:144553/149‑1 (MQ=255) cagcagTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAgc < 6:284830/149‑1 (MQ=255) gTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAAc < 3:321363/149‑1 (MQ=255) aTCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAg < 2:264597/149‑1 (MQ=255) gCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCg < 5:146475/142‑1 (MQ=255) gCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCg > 6:146475/1‑142 (MQ=255) gCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCt < 7:24790/149‑1 (MQ=255) cACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctg > 8:301074/1‑149 (MQ=255) cACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctg > 2:105825/1‑149 (MQ=255) aCTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctgc > 7:313357/1‑149 (MQ=255) tCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCctgctg > 8:177120/1‑149 (MQ=255) aaCTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTc > 3:320581/1‑149 (MQ=255) aCTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGTTCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCa > 5:321278/1‑133 (MQ=255) aCTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCa < 6:321278/133‑1 (MQ=255) cTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCa < 5:266683/149‑1 (MQ=255) tCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCAc > 5:80923/1‑149 (MQ=255) tCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCAc > 2:360577/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCAc < 4:326029/147‑1 (MQ=255) cGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTgg < 7:177120/148‑1 (MQ=255) gCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGcc > 4:255473/1‑149 (MQ=255) gCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGcc > 2:106489/1‑149 (MQ=255) ccGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGATGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCt > 7:106092/1‑148 (MQ=255) 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(MQ=255) tCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCAGTCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCt > 1:86689/1‑149 (MQ=255) ccacTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCACGCACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCACTCCt > 1:273514/1‑149 (MQ=255) aaCACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgcg > 8:188958/1‑149 (MQ=255) aaCACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgcg > 3:31383/1‑149 (MQ=255) acacTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGgcgc < 3:255473/149‑1 (MQ=255) cacTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCgggg > 1:132244/1‑145 (MQ=255) acTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTgg > 8:344560/1‑123 (MQ=255) acTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTgg < 7:344560/123‑1 (MQ=255) cTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGa < 4:320581/149‑1 (MQ=255) ttCATCGCATTGGCGCAGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATAGCCTGGAATCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTg > 4:156330/1‑147 (MQ=255) aTCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGt > 5:219888/1‑149 (MQ=255) aTCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGATGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGt < 8:106092/149‑1 (MQ=255) tCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTc > 1:189177/1‑149 (MQ=255) ttGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGcgcc > 2:14372/1‑149 (MQ=255) cGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCg < 2:132244/149‑1 (MQ=255) gATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCgg > 6:223279/1‑149 (MQ=255) tGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTc < 7:301074/149‑1 (MQ=255) tGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTgg < 3:165686/141‑1 (MQ=255) tGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTgg > 4:165686/1‑141 (MQ=255) gATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACAt > 5:51662/1‑149 (MQ=255) tCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAAc < 4:157637/92‑1 (MQ=255) tCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAAc > 3:157637/1‑92 (MQ=255) 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4:167207/1‑149 (MQ=255) a‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCAc < 6:80923/149‑1 (MQ=255) ac‑cacGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCAt < 5:299105/149‑1 (MQ=255) c‑cacGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc > 2:95051/1‑149 (MQ=255) c‑cacGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATc < 8:313357/149‑1 (MQ=255) gtggtggtgATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACaa < 7:124902/149‑1 (MQ=255) gtggtggtgATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACaa < 8:158363/149‑1 (MQ=255) | CACCTCTGCCGCCACCATGAGTGGTGTGCAGCAGTGGCTCGGATCCGCTTTCACTCAACTCGCTTCGGCCCGGTAAGAGCGCTATGGAATTCACCACTCAACACTTCATCGCATTGGCGCCGATGCTGATCACCACCA‑TCAC‑CACGGTGGTGGTGATGCTGGCGATCGCCTGGAAGCGCAACCACTCGCAGACCTTCCTGCTGTCCACCGTGGGCCTGAACCTGGCCCTGCTGTCGCTCCTGCCGGCGCTGAAGGTCGCGCCGCTGGCGGTCACATCGCTGATCACCATCGACAA > NC_002947/4669586‑4669880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |