| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,676,470 | A→C | 6.4% | F702V (TTC→GTC) | ldcC ← | lysine decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,676,470 | 0 | A | C | 6.4% | 236.9 / 4.8 | 75 | F702V (TTC→GTC) | ldcC | lysine decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/36); new base C (3/2); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATCACGCGCATTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGCCTGGGCCGGGCTGACGGC > NC_002947/4676323‑4676614 | aTCACGCGCATTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAAc < 7:277764/149‑1 (MQ=255) tCACGCGCATTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAAc < 2:169262/148‑1 (MQ=255) gcgcATTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCt > 5:373837/1‑148 (MQ=255) gcgcATTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCt > 2:290175/1‑148 (MQ=255) aTTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGTTCACCGAGGCGACCCGCTcgatc < 3:258578/149‑5 (MQ=255) aTTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATAGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCAccc < 1:31917/149‑1 (MQ=255) gTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCTAGCGGGTCGACTCGGTGAACCGATCACCCGGCAt > 8:305334/1‑149 (MQ=255) tGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATg < 3:207968/149‑1 (MQ=255) atctcAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGa < 1:343336/145‑1 (MQ=255) tGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGAt > 3:322391/1‑148 (MQ=255) gCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATc > 6:61311/1‑148 (MQ=255) aaTCCACCGTGTAGTGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGTTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAAc > 8:152119/1‑149 (MQ=255) aaTCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGACCCGCTCAGCCGGCATGa > 2:343336/1‑144 (MQ=255) aTCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACg < 6:262972/149‑1 (MQ=255) tCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACgg < 1:261984/149‑1 (MQ=255) aCCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGAt < 7:18054/149‑1 (MQ=255) tgtAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCa < 1:290175/149‑1 (MQ=255) cGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCgg < 5:185280/149‑1 (MQ=255) gCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGTGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCggg > 5:179222/1‑148 (MQ=255) ccccTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCaa < 2:154795/130‑1 (MQ=255) ccccTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCaa > 1:154795/1‑130 (MQ=255) gTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCAcc < 4:322391/148‑1 (MQ=255) cGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGc < 6:230148/120‑1 (MQ=255) cGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGc < 6:229587/120‑1 (MQ=255) cGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGc > 5:230148/1‑120 (MQ=255) cGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGc > 5:229587/1‑120 (MQ=255) tGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGc < 1:171855/123‑1 (MQ=255) tGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGc > 2:171855/1‑123 (MQ=255) cacaTCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGTGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCca < 6:179222/149‑1 (MQ=255) tCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCACCGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACg > 7:314814/1‑149 (MQ=255) gCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGAt < 6:148596/98‑1 (MQ=255) gCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGAt > 5:148596/1‑98 (MQ=255) gCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGccc > 7:225581/1‑149 (MQ=255) aCCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCAccg < 1:215674/129‑1 (MQ=255) aCCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCAccg > 2:215674/1‑129 (MQ=255) ggAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTa < 1:327811/107‑1 (MQ=255) ggAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTa > 2:327811/1‑107 (MQ=255) aaaGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCAcc < 3:230177/121‑1 (MQ=255) aaaGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCAcc > 4:230177/1‑121 (MQ=255) gCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCg < 8:165633/149‑1 (MQ=255) cccTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCgg < 2:37148/149‑1 (MQ=255) cccTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGAAGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCgg > 2:338727/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCgg < 3:199848/148‑1 (MQ=255) ccTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCgg > 5:191917/1‑148 (MQ=255) ccTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCgg > 4:199848/1‑148 (MQ=255) tGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACgg > 3:294959/1‑101 (MQ=255) tGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACgg < 4:294959/101‑1 (MQ=255) gTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCg > 5:207524/1‑149 (MQ=255) tGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCa < 5:75639/108‑1 (MQ=255) tGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCa > 6:75639/1‑108 (MQ=255) aaTGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTc < 7:270240/149‑1 (MQ=255) aaTGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTc < 6:373837/149‑1 (MQ=255) tGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCa < 5:335328/149‑1 (MQ=255) gCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCAc > 1:214583/1‑149 (MQ=255) tCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACtt > 6:53323/1‑149 (MQ=255) gggCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCg > 2:99748/1‑149 (MQ=255) cGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCa < 5:53323/149‑1 (MQ=255) ggTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATc < 7:152119/149‑1 (MQ=255) gTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCt > 8:80996/1‑149 (MQ=255) gTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCt > 3:106965/1‑149 (MQ=255) tCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAAc > 6:21260/1‑51 (MQ=255) tCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAAc < 5:21260/51‑1 (MQ=255) aaGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCa > 4:127768/1‑148 (MQ=255) aaGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCa > 4:119623/1‑148 (MQ=255) ccgggtgAGCGGTTCACCGAGGCGACCCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTc < 6:359646/116‑1 (MQ=38) ccgggtgAGCGGTTCACCGAGGCGACCCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTc > 5:359646/7‑122 (MQ=38) aGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATa < 1:338727/149‑1 (MQ=255) ggtgAGCGGTTCACCGAGGCGACCCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGc > 5:337968/4‑149 (MQ=255) aTCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGc > 4:127370/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGCCt < 3:127370/148‑1 (MQ=255) gggTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGCCTGGGcc > 6:8631/1‑149 (MQ=255) tCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGCCTGGGCCggg < 6:191917/149‑1 (MQ=255) gTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCAc > 6:148766/1‑95 (MQ=255) gTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCAc < 5:148766/95‑1 (MQ=255) gTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGCCTGGGCCGGGCTGACGGc < 5:8631/149‑1 (MQ=255) | ATCACGCGCATTCCGTGATGCAATCCACCGTGTAGCGGCCCCCTTCGTGCTGCAGGCCGTGCACATCGGCGACAAACCCGGGAAAGCCCTGGTTGAATGCTCGGGCGAATGCCAGGTAATCAAGGATCGAGCGGGTCGCCTCGGTGAACCGCTCACCCGGCATGATCAACGGGATGCCAGGCGGGTACGGCACCAGCATCACCGCCGCCACACGCCCCAGCAATGCCTCGATCGGCACCGCCTCCACTTCGCCACGCACCATCTTGTCATAGGCCTGGGCCGGGCTGACGGC > NC_002947/4676323‑4676614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |