Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,726,619 | T→C | 7.9% | I255V (ATC→GTC) | brnQ ← | branched‑chain amino acid transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,726,619 | 0 | T | C | 7.9% | 178.0 / 4.3 | 63 | I255V (ATC→GTC) | brnQ | branched‑chain amino acid transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/29); new base C (3/2); total (32/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGCGCAGGCACAGGTCAGGCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCGCGAGCGAATGGCATTG > NC_002947/4726476‑4726755 | ggCGCAGGCACAGGTCAGGCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGt < 5:86953/149‑1 (MQ=255) aGGCACAGGTCAGGCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCtg > 7:157595/1‑149 (MQ=255) gTCAGGCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGCCACCAGCCACGACATCGCGGCtgacgccac > 3:7489/1‑141 (MQ=38) aGGCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAg < 1:241382/149‑1 (MQ=255) aGGCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAg > 4:174255/1‑149 (MQ=255) gCCAACCGCGGTCACCAGGCAGTCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGc > 2:288512/1‑149 (MQ=255) gCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGc > 3:267712/1‑149 (MQ=255) cAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAATGTGAATGATGTACGTAGGCATGCAGCACCCCCGAACCGTTGTTGCCTTCAGCCCCAATTACGTGGATGTTGGCACCCAGGc > 1:300992/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAgg < 1:331525/145‑1 (MQ=255) aaCCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAgg > 2:331525/1‑145 (MQ=255) cgcgGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCAcc < 4:84899/138‑1 (MQ=255) cgcgGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACa < 5:228198/149‑1 (MQ=255) gcgGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAg > 7:167031/1‑149 (MQ=255) gcgGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAg > 7:130086/1‑149 (MQ=255) ggTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGc < 8:157595/149‑1 (MQ=255) ggTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGc < 8:126224/149‑1 (MQ=255) gTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCt < 6:7587/149‑1 (MQ=255) gTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCt > 8:305224/1‑149 (MQ=255) cACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGa > 6:231120/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAAc < 6:66464/141‑1 (MQ=255) aCCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAAc > 5:66464/1‑141 (MQ=255) ccAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATg < 1:288512/149‑1 (MQ=255) gcaggcCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGACGTCGTgg < 3:353375/115‑1 (MQ=255) gcaggcCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGACGTCGTgg > 4:353375/1‑115 (MQ=255) aTCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGccc < 8:167031/149‑1 (MQ=255) aGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGa > 7:339009/1‑148 (MQ=255) gCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCACGACATCGCGGCtga < 6:227167/102‑2 (MQ=255) gCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCACGACATCGCGGCtga > 5:227167/1‑101 (MQ=255) ccAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGaa < 1:134794/112‑1 (MQ=255) ccAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGaa > 2:134794/1‑112 (MQ=255) aGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGAt < 3:325141/149‑1 (MQ=255) aGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGAt < 3:174255/149‑1 (MQ=255) ggAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATc < 8:289666/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAgg < 8:237986/127‑1 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGAt > 5:148773/1‑147 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGAt > 7:229583/1‑147 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGAt > 7:106221/1‑147 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCCCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAgg > 7:237986/1‑127 (MQ=255) aGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAgg > 2:167305/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCg > 3:238396/1‑149 (MQ=255) cccAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCgat > 5:271585/1‑149 (MQ=255) ccAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCgat > 1:367171/1‑148 (MQ=255) ccAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCgat > 5:116766/1‑148 (MQ=255) cAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCgatga > 6:41346/1‑149 (MQ=255) cAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCgatga > 5:206056/1‑149 (MQ=255) gggAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGatgatg < 6:148773/149‑1 (MQ=255) ggAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATgg < 4:267712/149‑1 (MQ=255) aaGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCg > 2:93198/1‑149 (MQ=255) aGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCgg < 7:305224/149‑1 (MQ=255) tGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTaa < 2:300992/148‑1 (MQ=255) tAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAg > 7:44049/1‑143 (MQ=255) tAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAg < 8:44049/143‑1 (MQ=255) tGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGAGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTc < 4:331279/149‑1 (MQ=255) agcaCCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGa > 2:8606/1‑148 (MQ=255) ccgcACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTc > 6:268955/1‑139 (MQ=255) ccgcACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTc < 5:268955/139‑1 (MQ=255) cgcACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACcgcgcg < 8:339009/149‑1 (MQ=255) gcACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCgcga < 2:367171/149‑1 (MQ=255) ttGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCGCGAGCGAAt < 6:116766/149‑1 (MQ=255) gtggCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCGCGAGCGAATGGc < 1:167305/149‑1 (MQ=255) cGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCGCGAGCGAATGGCATTg < 1:93198/149‑1 (MQ=255) cgcgATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCgcgag < 4:236093/130‑1 (MQ=255) cgcgATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCgcgag > 3:236093/1‑130 (MQ=255) | GGCGCAGGCACAGGTCAGGCCAACCGCGGTCACCAGGCAGGCCAGCGCGATCAGCACGGCCAGGAAGCCGCTGCCCAGGGAGCCGAAGGT‑‑ATGCTGTACGTAGGCATGCAGCACCGCCGCACCGTTGGTGGCGTCAGCCGCGATGTCGTGGCTGGTGGCACCCAGGCGGAACAGGCTGATGTAGACCAGGGCCAGCCCGACACCGGCGATCAGGCCGGCGATGATGGCGTAGCGGGTAATCAGCCTCGGCGACTCGACACCGCGCGAGCGAATGGCATTG > NC_002947/4726476‑4726755 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |