Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,586,057 | +C | intergenic (+140/+75) | PP_4061 → / ← PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,586,056 | 1 | . | C | 100.0% | 95.5 / NA | 29 | intergenic (+139/+76) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (14/15); total (14/15) |
CTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑CGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTG > NC_002947/4585913‑4586198 | cTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑ccgt > 2:117322/1‑146 (MQ=39) aGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCg < 3:329877/149‑1 (MQ=39) aCCACGGCACCGGCGTGAACGGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTg > 3:297874/1‑148 (MQ=38) cACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAAt < 3:267345/149‑1 (MQ=39) gCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGc < 1:117322/149‑1 (MQ=39) gCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGGGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGc < 8:64901/149‑1 (MQ=38) gTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGccc < 4:124133/149‑1 (MQ=39) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTg < 2:112474/149‑1 (MQ=39) gATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGAG‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGa < 4:105436/125‑1 (MQ=38) gATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGAAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGAG‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGa > 3:105436/1‑125 (MQ=38) ctCCATTGATAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAg < 2:229073/135‑1 (MQ=38) ctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAg > 1:229073/1‑136 (MQ=38) cATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg < 4:297874/149‑1 (MQ=38) aacggTTGCGCATCACC‑GGGGTCTTGGCACGGGTAATATTTTGCATTGATGGGGCCGGCCTCTTCGGG‑GGTAACCCCGCTCCTCCCTGGCACCGTGCCGG‑CCTTTAATGCGGCGCTGCCCCTGGTTGTAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 4:332242/145‑1 (MQ=255) aaaGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 6:206151/148‑1 (MQ=38) ggtgagCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggc < 6:183771/130‑1 (MQ=37) gCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGa < 1:18278/104‑1 (MQ=25) gCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGa > 2:18278/1‑103 (MQ=25) ttGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCt > 7:137434/1‑82 (MQ=21) ttGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCt < 8:137434/82‑1 (MQ=21) gcgggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCa > 1:220536/4‑149 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATg > 8:337372/2‑149 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCAGCGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTCCCCCTGGAAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAAc > 6:211864/1‑149 (MQ=39) cccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggccggc > 5:388572/1‑81 (MQ=255) cccGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggccggc < 6:388572/81‑1 (MQ=255) cTACCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAc > 3:283665/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCt > 1:182270/1‑149 (MQ=255) ccAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCtt > 3:281044/1‑149 (MQ=255) ccAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCtt > 3:153610/1‑149 (MQ=255) cAGGGACCGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTg > 3:390544/1‑149 (MQ=255) | CTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACC‑GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTC‑TCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGA‑CGTGCCGG‑CCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTG > NC_002947/4585913‑4586198 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |