New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 63729 | 53 (1.030) | 5 (0.100) | 5/244 | NT | 9.1% | coding (748/858 nt) | PP_0054 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 63769 | 50 (1.030) | coding (788/858 nt) | PP_0054 | membrane protein |
CAACCTGCGCATGGCCAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGT > NC_002947/63581‑63877 | cAACCTGCGCATGGCCAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGC > 6:75433‑M1/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCATGGCCAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTctgctgctg < 5:75433/149‑1 (MQ=255) cgcATGGCCAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGgcg < 6:179388/147‑1 (MQ=255) gCCAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCttt < 2:150141/149‑1 (MQ=255) gCCAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCtt < 1:52778/148‑1 (MQ=255) ccAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTg > 1:197722/1‑149 (MQ=255) cAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTgg > 1:164005/1‑149 (MQ=255) aGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCagacgcggcccggcc > 8:21373‑M1/1‑133 (MQ=255) aGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTgg > 2:223102/1‑148 (MQ=255) gCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCa < 5:44108/149‑1 (MQ=255) aTCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGc < 6:145083/149‑1 (MQ=255) tCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCa > 1:250764/1‑146 (MQ=255) tCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCa < 2:250764/146‑1 (MQ=255) gTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACGGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCa < 7:11859/148‑1 (MQ=255) gTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGGCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCa < 7:16742/148‑1 (MQ=255) tcCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGAtt > 7:117315/1‑149 (MQ=255) ccACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCa > 2:157905/1‑144 (MQ=255) ccACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCa < 1:157905/144‑1 (MQ=255) aCCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTggc > 5:131349/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCagacgcggcccggccaatctggctgccaaag > 6:28506‑M1/1‑118 (MQ=255) gCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTggccgggc > 1:159759/1‑149 (MQ=255) tGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccag < 5:28506‑M1/149‑42 (MQ=255) aTTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTgc > 8:117315‑M2/1‑146 (MQ=255) tGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTgcag < 4:52847‑M2/148‑5 (MQ=255) cccTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTgcagca > 5:38740‑M2/1‑142 (MQ=255) ccTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcaga < 7:21373‑M1/149‑49 (MQ=255) ccTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTggccgg > 7:308675/1‑132 (MQ=255) ccTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTggccgg < 8:308675/132‑1 (MQ=255) ccTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTgcag < 3:37048‑M2/145‑5 (MQ=255) gTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGtt < 1:223102/149‑1 (MQ=255) tACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGCTGTTTGCCg > 7:163267/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGTGGGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCGCGGTCTGCTGCagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaccgagcactg < 5:18788‑M1/148‑59 (MQ=255) ccGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGt < 2:197722/148‑1 (MQ=255) cGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTgg < 2:164005/149‑1 (MQ=255) aGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAgg < 4:37048/149‑1 (MQ=255) aGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAgg > 6:144864/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGcc > 2:238282/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCt < 2:159759/149‑1 (MQ=255) aGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCt > 2:196046/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCtgt < 5:144864/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCtgt > 5:64789/1‑149 (MQ=255) ttGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCtgttg > 6:298026/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTgttgtt < 2:259957/148‑1 (MQ=255) gTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCgg > 8:13466/1‑149 (MQ=255) tCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCgg > 3:129302/1‑148 (MQ=255) aTGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCaa < 8:154848/149‑1 (MQ=255) cACTGGGAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGGAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCGTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGGAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCGTGTTGTTGGCCGGCAAgg < 2:97673/148‑1 (MQ=255) ttGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGc < 3:52847/149‑1 (MQ=255) cgcCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAg > 4:209527/1‑148 (MQ=255) ccGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCttt < 6:64789/148‑1 (MQ=255) gTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGtt > 2:152644/1‑149 (MQ=255) ctggCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTc < 8:162866/147‑1 (MQ=255) ggCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTc < 3:250839/126‑1 (MQ=255) ggCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTc > 4:250839/1‑126 (MQ=255) ggCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCgg < 7:13466/149‑1 (MQ=255) cAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTgcagcagaccgcgcactgcgccgacggcaaacggggcgccaacctgccagtgcatgacgcccgcaaggctggcgctgaccccacagccgg < 5:18788‑M2/148‑91 (MQ=255) cAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCcgc < 5:298026/149‑1 (MQ=255) aGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCcgcg < 3:209527/149‑1 (MQ=255) cTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCGGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGcac > 8:199706/1‑148 (MQ=255) tCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAgg > 3:128043/1‑108 (MQ=255) tCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAgg < 4:128043/108‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGGTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCgcgc < 7:69456/143‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCgcgc > 8:69456/1‑143 (MQ=255) tCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTgcagcagaccgagcactgcgccgacggcaaacggggcgccaacctgccagtgcatgacgcccgcaaggctggcgctgaccacactgccggtagagaccagg < 7:21373‑M2/149‑102 (MQ=255) tCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGcc > 2:323163/1‑149 (MQ=255) tCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGc > 1:155188/1‑148 (MQ=255) tgctgctgGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCcag > 1:98177/1‑149 (MQ=255) tgctgcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaccgagcactgcgccgacggcaaacggggcgccaacctgccagtgcatgacgcccgcaaggctggcgctgaccacactgccggtagagaccaggg > 5:38740‑M1/1‑6 (MQ=255) ctgctgGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTCGTTCGGCCGCGCACAACGCcag > 6:28542/1‑147 (MQ=255) ctgcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaccgagcactgcgccgacggcaaacggggcgccaacctgccagtgcatgacgcccgcaaggctggcgctgaccacactgccggtagagaccagggca < 4:52847‑M1/148‑145 (MQ=255) ctgcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaccgagcactgcgccgacggcaaacggggcgccaacctgccagtgcatgacgcccgcaaggctggcgctgaccacactgccggtagagaccagg < 3:37048‑M1/145‑142 (MQ=255) gcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaccgagcactgcgccgacggcaaacggggcgccaacctgccagtgcatgacgcccgcaaggctggcgctgaccacactgccggtagagaccagggcaat > 8:117315‑M1/1‑2 (MQ=255) ctgGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTgcagcagaccgagcactgcgccgacggcaaacggggcgccaacctgccagtgcatgacgcccgcaaggctggcgctgaccacactgccggtagagaccagggcaatca < 5:28506‑M2/149‑109 (MQ=255) ctgGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAgg < 1:152644/148‑1 (MQ=255) | CAACCTGCGCATGGCCAGCATCGTCTCCACCTCGCTGGCGGTGATTGCCCTGGTCTCTACCGGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGT > NC_002947/63581‑63877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |