| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1033743 = | 45 (0.870) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.2% | coding (363/582 nt) | PP_0891 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1033828 = | 48 (0.980) | coding (448/582 nt) | PP_0891 | hypothetical protein | |||||
GGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGC > NC_002947/1033597‑1033890 | ggaataccGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGt < 8:271716/143‑1 (MQ=255)ggTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGt < 5:269841/149‑1 (MQ=255)cggccccgccatgtcagcgcgcagtgaagatcagcaccgcgctaaccggtaccgacgggttgatggacttcaacctggcgaacttgcgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagg > 3:233067‑M1/149‑149 (MQ=255) gTATTCCGCTGCGTGACGAGCACATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACg > 7:48813/1‑146 (MQ=255) gTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACg < 8:48813/146‑1 (MQ=255) gccccgccatgtcagcgcgcagtgaagatcagcaccgcgctaaccggtaccgacgggttgatggacttcaacctggcgaacttgcgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGt > 1:161108‑M1/147‑149 (MQ=255) cccgccatgtcagcgcgcagtgaagatcagcaccgcgctaaccggtaccgacgggttgatggacttcaacctggcgaacttgcgcaggctttccagccccggcagcaagccgaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTCa > 8:198215‑M1/145‑149 (MQ=255) cccgccatgtcagcgcgcagtgaagatcagcaccgcgctaaccggtaccgacgggttgatggacttcaacctggcgaacttgcgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTCa < 6:223723‑M1/5‑1 (MQ=255) ccgccatgtcagcgcgcagtgaagatcagcaccgcgctaaccggtaccgacgggttgatggacttcaacctggcgaacttgcgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTCAc < 5:223428‑M1/6‑1 (MQ=255) ccGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCt > 8:15356/1‑149 (MQ=255) cGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTg > 4:60737/1‑149 (MQ=255) gTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCTGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGc < 8:303317/149‑1 (MQ=255) gTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGc < 5:135361/149‑1 (MQ=255) tGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGcc < 7:15356/149‑1 (MQ=255) gcagtgaagatcagcaccgcgctaaccggtaccgacgggttgatggacttcaacctggcgaacttgcgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTc > 8:133595‑M1/129‑132 (MQ=255) gcagtgaagatcagcaccgcgctaaccggtaccgacgggttgatggacttcaacctggcgaacttgcgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTc < 7:133595‑M1/4‑1 (MQ=255) gCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCg > 5:161995/1‑148 (MQ=255) cAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCCCCCTGCATGGCCAGTCGca > 7:255425/1‑149 (MQ=255) cgACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTAc > 2:321161/1‑148 (MQ=255) cgACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTAc > 5:170140/1‑148 (MQ=255) ttCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGtt < 1:321161/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGcc > 1:22809/1‑121 (MQ=255) gAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGcc < 2:22809/121‑1 (MQ=255) ttCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCt > 8:295724/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAGCATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCAc < 1:25392/95‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCAc > 2:25392/1‑94 (MQ=255) cacaGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCgcggc > 8:13604/1‑149 (MQ=255) aaGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTcc < 3:60737/148‑1 (MQ=255) acaGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCTCGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggtg > 1:210751/1‑149 (MQ=255) aCCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCtt < 2:9373/149‑1 (MQ=255) cgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGAccc > 5:193693‑M1/63‑148 (MQ=255) cgcaggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCt > 8:271852‑M1/63‑149 (MQ=255) cTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGa < 6:161995/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggtg < 4:56041/137‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggtg > 3:56041/1‑137 (MQ=255) aggctttccagccccggcagcaagccaaaatcttcggcgcgcagcaccagaggctcaagGGTCACCCTGCATGGCCAGGCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGa > 5:331443‑M1/60‑149 (MQ=255) gATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTgg > 6:49495/1‑149 (MQ=255) aaTGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGAAGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGtgct > 1:238454/1‑149 (MQ=255) aTGACCTGGC‑CGACGGTACACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGAGGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGtgctg > 1:232091/1‑149 (MQ=255) aCCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCt < 6:211620/130‑1 (MQ=255) aCCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCt > 5:211620/1‑130 (MQ=255) ccTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTAGCACAGCAAAAAt > 8:47486/1‑76 (MQ=255) cTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTgcgcgc > 6:112912/1‑149 (MQ=255) cGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCctc < 4:292152/131‑1 (MQ=255) cGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCctc > 3:292152/1‑131 (MQ=255) tGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCAGAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTg < 5:284384/149‑1 (MQ=255) tGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTg > 7:171818/1‑149 (MQ=255) tGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTg < 5:49495/149‑1 (MQ=255) acaG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGAtttt > 7:253040/1‑145 (MQ=255) acaG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGAtttt < 8:253040/145‑1 (MQ=255) acaG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCt > 5:223723/1‑149 (MQ=255) caG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCtt > 4:14614/1‑149 (MQ=255) aG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTtg > 8:211841/1‑149 (MQ=255) tCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGAATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTCTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTACCAGGAGGTGCCGCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGATtgctg > 6:300589/1‑149 (MQ=255) aaTTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCg > 1:37163/1‑149 (MQ=255) aTTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCgg < 3:255493/149‑1 (MQ=255) tGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTCGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGa > 3:50817/1‑148 (MQ=255) ccGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGa > 6:251517/1‑98 (MQ=255) ccGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGa < 5:251517/98‑1 (MQ=255) cTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCt < 7:13604/149‑1 (MQ=255) aCGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTgc < 2:232091/148‑1 (MQ=255) aCGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTgc < 8:255425/148‑1 (MQ=255) GGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTgcgc < 8:233698‑M1/148‑1 (MQ=255) | GGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGC‑CGACGGTGCACAG‑ATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGC > NC_002947/1033597‑1033890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |