New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4281263 = | 49 (0.950) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 7.6% | coding (161/1197 nt) | PP_3751 | cyanate transporter |
? | NC_002947 | 4281337 = | 51 (1.040) | coding (87/1197 nt) | PP_3751 | cyanate transporter |
ACCAGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGT > NC_002947/4281119‑4281407 | ccaggccagccgagccgggataatggccagttcctgttacaagagaaccgactcacaatgagcgctgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCAt < 2:268756‑M1/5‑1 (MQ=255) ccaggccagcccagccgggataaaggccaggtcctgttacaagagaacccactcacaatgagcgctgtactgaagctggtgctggtgatcctgctggcgctgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCAt > 8:249295‑M1/145‑149 (MQ=255) accaGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCAt < 6:58394/149‑1 (MQ=255) caGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATg > 2:172878/1‑148 (MQ=255) aGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGca > 6:259302/1‑149 (MQ=255) aCTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCa < 2:162068/149‑1 (MQ=255) gCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCg < 5:259302/148‑1 (MQ=255) gCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGAGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCgg > 6:117203/1‑149 (MQ=255) cgataatgcccagttcctgttacaagagaaccgactcacaatgagcgctgtactgaacctgttgctgctgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCAt > 6:61899‑M1/128‑132 (MQ=255) ccAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCa < 1:172878/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGgccgc > 8:108805/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTgg > 4:145974/1‑148 (MQ=255) cAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTgg > 4:100788/1‑148 (MQ=255) gcaggcCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCgg > 3:70153/1‑149 (MQ=255) caggcCCGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGATCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGACCATGCAC‑‑‑AGCAAAGGAAGCGCCGTCACCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGt > 1:266370/1‑149 (MQ=255) ggCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGgcgc > 8:262855/1‑149 (MQ=255) ggCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGgcgc > 8:51035/1‑149 (MQ=255) gctgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCGCGCCAGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGgc > 8:57952‑M1/82‑149 (MQ=255) tgtactgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCa < 7:289245‑M1/70‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATggg > 8:96791/1‑149 (MQ=255) gcgGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATgg < 7:108805/148‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATgg < 3:100788/148‑1 (MQ=255) ctgaacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATggg > 1:88344‑M1/76‑149 (MQ=255) ggCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGtt < 4:70153/149‑1 (MQ=255) aacctgttgctggtgatcctgctggcgttgaacctgcggccgatcctgaccagtatcggcccgttactcgaaCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTc > 8:289245‑M1/73‑149 (MQ=255) cAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 2:95816/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGAGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 5:117203/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCGCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 4:275333/149‑1 (MQ=255) ccAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACggg < 7:248066/149‑1 (MQ=255) cAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGc < 7:96791/149‑1 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACTCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTg < 3:287453/149‑1 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCTCGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTg < 8:81659/149‑1 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTCCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTg < 8:123279/149‑1 (MQ=255) cgccATGCTCGCTGACCCAGCGGCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTg < 5:33561/149‑1 (MQ=255) tCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGAt > 1:169094/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCg > 2:94190/1‑147 (MQ=255) aGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa < 5:104404/114‑1 (MQ=255) aGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGa > 6:104404/1‑114 (MQ=255) ccACGGTTGCAACAGGGACACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCgg > 1:21196/1‑132 (MQ=255) ccACGGTTGCAACAGGGACACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCgg < 2:21196/132‑1 (MQ=255) ggTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCcagcag > 4:180313/1‑149 (MQ=255) ttGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGa > 7:18025/1‑149 (MQ=255) gCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCTATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGAt < 7:262855/148‑1 (MQ=255) gCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGt > 2:49424/1‑115 (MQ=255) gCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGt < 1:49424/115‑1 (MQ=255) gCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGAt < 7:51035/148‑1 (MQ=255) aaCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGGATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCATCAGGATCAc > 4:10538/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCAc > 6:210197/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCAc > 7:300630/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCAc > 3:82202/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCAc > 1:154768/1‑149 (MQ=255) aaCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCACGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGAt > 7:118730/1‑146 (MQ=255) aaCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCACGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGAt < 8:118730/146‑1 (MQ=255) aCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCTTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGTTCAGGATCGTCCGCTGGGTCAACGCCAGCAGGATCAcc < 2:266370/149‑1 (MQ=255) aCAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCAcc < 2:169094/149‑1 (MQ=255) ggCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCaa > 6:304997/1‑149 (MQ=255) gCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAAc < 4:82202/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGt > 4:139487/1‑149 (MQ=255) | ACCAGCGCACTGGCGATCAGCGCCCAGGCACTGTCCAGCTGCAGGCGCCACAGGCAGGCCAGGGCAATCGCGGCCAGGCCCCCCAGCATGCCGCCATGCTCGCTGACCCAGCGTCGCAGCCACGGTTGCAACAGGGGCACCAGGCCCATGCAC‑‑‑AGCACCGGTAGCGCCGTCAGCAAGGCCGCCTGCTGGTAACCCAGGCCGGTGCTGGCGCGCATGGGTTCGAGTAACGGGCCGATACTGGTCAGGATCGGCCGCAGGTTCAACGCCAGCAGGATCACCAGCAACAGGT > NC_002947/4281119‑4281407 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |