New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4912499 = | 55 (1.060) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 6.3% | coding (215/537 nt) | ccmG | holocytochrome c synthetase subunit |
? | NC_002947 | 4912570 = | 65 (1.300) | coding (144/537 nt) | ccmG | holocytochrome c synthetase subunit |
GAATATCCAGCTGATAGGGGTTGTGGAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGCTTGAGGAAAAGCC > NC_002947/4912353‑4912646 | gcatgaagcgttggatcatggtagtgccccttgcagtgttcctgctggtggcggtgttcctctacaaggggcttttcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccggcgttttccctggcgtcgacaCAg < 7:203246‑M1/3‑1 (MQ=255) gcatgaagcgttggatcatggtagtgccccttgcagtgttcctgctggtggcggtgttcctctacaaggggcttttcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccggcgttttccctggcgtcgacaCAg < 4:193014‑M1/3‑1 (MQ=255) gAATATCCAGCTGATAGGGGTTGTGGAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAg > 5:330310/1‑149 (MQ=255) cTGATAGGGGTTGTGGAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCcaca < 3:237184/149‑1 (MQ=255) tAGGGGTTGTGGAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGtt < 2:1316/149‑1 (MQ=255) tAGGGGTTGTGGAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGt < 3:44636/148‑1 (MQ=255) tcatggtagtgccccttgcagtgttcctgctggtggcggtgttcctctacaaggggcttttcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccgccgttttccctggcgtcgacaCAGGTGGCCCACACGtt < 1:326722‑M1/17‑1 (MQ=255) tgGAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGc > 1:218538/1‑149 (MQ=255) gAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCGGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGcc < 4:316733/148‑1 (MQ=255) tCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACg > 5:333546/1‑149 (MQ=255) cttgcagtgttcctgctggtggcggtgttcctctacaaggggcttttcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccggcgttttccctggcgtcgacaCAg < 6:581‑M1/3‑1 (MQ=255) cttgcagtgttcctgctggtggcggtgttcctctacaaggggcttttcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccggcgttttccctggcgtcgacaCAg > 5:581‑M1/118‑120 (MQ=255) gCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGccc > 1:124351/1‑149 (MQ=255) cAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCt > 3:312019/1‑149 (MQ=255) aCCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTg > 2:64777/1‑148 (MQ=255) cccTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCaa < 5:286610/147‑1 (MQ=255) ttCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTc > 5:1995/1‑149 (MQ=255) cTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTc < 4:159690/147‑1 (MQ=255) cggcggTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACACTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGa < 7:111320/149‑1 (MQ=255) cggcggTGTCGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGa < 3:300188/149‑1 (MQ=255) tgttgtCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAgg < 6:330310/149‑1 (MQ=255) gttcctctacaaggggcttttcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccggcgttttccctggcgtcgacaCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAggg < 3:102157‑M1/58‑1 (MQ=255) gtCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTg < 8:176274/148‑1 (MQ=255) tCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACATTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGcc > 2:136893/1‑148 (MQ=255) aTCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCt > 3:155736/1‑134 (MQ=255) aTCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCt < 4:155736/134‑1 (MQ=255) aTCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCgg < 6:1995/148‑1 (MQ=255) cTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTCCACGAAGGGCACCAGGTGGCCCACACGTAGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTccc < 6:263266/149‑1 (MQ=255) ggggcttttcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccggcgttttccctggcgtcgacaCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCt > 2:326722‑M1/80‑149 (MQ=255) tAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCtg > 3:283625/1‑149 (MQ=255) tAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCtg > 3:84863/1‑149 (MQ=255) ttGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTgtgt < 2:124351/149‑1 (MQ=255) tcctcaagcccgacgagctgccttcggcaatgatcggcaaaccgttcccggcgttttccctggcgtcgacaCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGa > 4:102157‑M1/72‑148 (MQ=255) ccATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGc < 3:74261/149‑1 (MQ=255) ccATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGc > 6:260424/1‑149 (MQ=255) cATGGATAACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCAGAAAGACGGCCAGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGAAGc > 2:232102/1‑148 (MQ=255) aTGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGc > 1:274122/1‑147 (MQ=255) ccacACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAAc > 4:294156/1‑149 (MQ=255) ccacACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAAc > 1:23552/1‑149 (MQ=255) ccacACCCTGCTGTGCAAGCTGGTTCAGGTACGTGTGCTCGACCTTGCTCGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGAGCATTGCCGGACGCCACTGCAAGTCCGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAAc < 1:232102/149‑1 (MQ=255) cacaCCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACg > 8:186222/1‑149 (MQ=255) acCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCg < 3:294156/149‑1 (MQ=255) cccTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCgg < 2:274122/149‑1 (MQ=255) tgtgctgTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGGGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGGGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGaaaa < 4:232929/140‑1 (MQ=255) ccTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAAcagattc > 3:232929/1‑143 (MQ=255) ccTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCgg > 7:289547/1‑148 (MQ=255) tgctgTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGaa > 5:16028/1‑149 (MQ=255) ctgTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAAc < 4:312019/148‑1 (MQ=255) gtgCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCg < 2:102210/141‑1 (MQ=255) gtgCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCg > 1:102210/1‑141 (MQ=255) cAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGc > 7:130344/1‑149 (MQ=255) cAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCAtt < 3:244732/148‑1 (MQ=255) aGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCa < 2:222582/88‑1 (MQ=255) aGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCa > 1:222582/1‑88 (MQ=255) aGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGc < 5:260424/149‑1 (MQ=255) ggTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTGGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGcc < 5:208181/149‑1 (MQ=255) gTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGcc > 3:169054/1‑148 (MQ=255) cGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAg > 5:223019/1‑149 (MQ=255) cTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGc < 8:130344/148‑1 (MQ=255) tCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCtc > 1:277725/1‑149 (MQ=255) cTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCgg < 8:289547/149‑1 (MQ=255) ttGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTAGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTAGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGAACATTGCCGAAGGCAGCTCGTCggg > 4:43162/1‑149 (MQ=255) gCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGc < 6:333546/148‑1 (MQ=255) cACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGCCCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGGCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGCtt < 7:255319/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGCTTGAGGaaaa < 2:23552/149‑1 (MQ=255) gCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGCTTGAGGaa > 8:203246/1‑147 (MQ=255) cACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCtcgtcg > 7:228870/1‑135 (MQ=255) cACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCtcgtcg < 8:228870/135‑1 (MQ=255) aCCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGCTTGAGGAAAAGc > 5:124559/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGGCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGTAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGCTTGAGGAAAAGcc < 1:136893/149‑1 (MQ=255) | GAATATCCAGCTGATAGGGGTTGTGGAACTCGGCCAACCACTTCTGCGCGGCGGTGTTGTCATCCTTGTAGTTGACCCCATGGATCACCACACCCTGCTGTGCCAGCTGGTTCAGGTACGGGTGCTCGACCTTGCACGACGGGCACCAGGTGGCCCACACGTTGACCAGTGCCGGACGCCCCTGCAAGTCGGCCTGAGTCAGGGTGCGGTCCCCCTGTGTCGACGCCAGGGAAAACGCCGGGAACGGTTTGCCGATCATTGCCGAAGGCAGCTCGTCGGGCTTGAGGAAAAGCC > NC_002947/4912353‑4912646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |