New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1167195 | 43 (0.830) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 8.3% | coding (139/729 nt) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
? | NC_002947 | = 1167220 | 48 (0.980) | coding (164/729 nt) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
GGATATCTGAATTGAAACTGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCCTGCTGGCCCGTCACC > NC_002947/1167076‑1167363 | ggATATCTGAATTGAAACTGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtggc > 7:1937‑M2/1‑145 (MQ=255) tatCTGAATTGAAACTGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtggc > 4:276773‑M2/1‑142 (MQ=255) tatCTGAATTGAAACTGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtggc < 3:276773‑M2/146‑5 (MQ=255) cTGAATTGAAACTGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCg > 6:155068/1‑148 (MQ=255) aaaCTGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGt > 1:61315/1‑149 (MQ=255) tGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtg > 4:103551‑M2/1‑127 (MQ=255) tGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtg < 3:103551‑M2/129‑3 (MQ=255) gCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCt < 1:11208/149‑1 (MQ=255) cGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTg > 5:8355/1‑149 (MQ=255) cGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTg < 5:271465/149‑1 (MQ=255) aaGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAAc < 6:8355/148‑1 (MQ=255) aGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTg < 5:155068/149‑1 (MQ=255) gCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGc > 5:172965/1‑149 (MQ=255) tCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCa > 6:48705/1‑149 (MQ=255) tCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGCGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGc > 7:110619/1‑147 (MQ=255) tGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGATCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTACTGGAGAAACTGGCCAGCGCGCaa > 8:77307/1‑148 (MQ=255) aTGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGAc > 2:186856/1‑149 (MQ=255) gCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGa > 1:180221/1‑137 (MQ=255) gCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGa < 2:180221/137‑1 (MQ=255) cAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGATCGCCTGCGAGCCGCGATTGCAGCCAAGGGGCAGGTCTGTTTGGTGTTGTCTGTCGGCAGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGAACCTGGACTgg < 4:259220/148‑1 (MQ=255) cAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTggg > 3:308902/1‑149 (MQ=255) cAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTggg > 4:96293/1‑149 (MQ=255) cAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGAGAGCACCTGGACTggg > 1:223355/1‑149 (MQ=255) aCTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAgg > 7:83904/1‑149 (MQ=255) gtgtCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGt < 1:8185/143‑1 (MQ=255) gtgtCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGt > 2:8185/1‑143 (MQ=255) gtCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCa < 8:110619/149‑1 (MQ=255) tCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCTATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCa < 7:77307/148‑1 (MQ=255) ttGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCt > 6:150381/1‑149 (MQ=255) ggCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTgg > 4:153455/1‑149 (MQ=255) atgatgTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCtgat < 4:8125/149‑1 (MQ=255) atgTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCtgatga < 5:48705/148‑1 (MQ=255) gCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTg > 4:88391/1‑149 (MQ=255) cgcgcCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTgg < 6:172965/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAg < 3:88391/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGAGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCAAAGGTCACTGTCAGACTGGCTCATGAGCGCTGGGTGCCGGTg > 4:294900/1‑146 (MQ=255) ccgcGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGa < 8:151721/145‑1 (MQ=255) ccgcGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAgag > 7:151721/1‑146 (MQ=255) gcgATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACg > 7:156171/1‑148 (MQ=255) gcgATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACg < 8:156171/148‑1 (MQ=255) aTTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtggcggcaatcgcggcgcgcaggcgctcagccacatcatgagccaaggacacggacagtggcttggcatccgccagttcatgagccttcacggccgctggcagtttcaatt < 1:268948‑M2/146‑112 (MQ=255) ccgccAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtggcggcaatcgcggcgcgcaggcgctcagccacatcatgagccaaggacacggacagtgccttggcatccgccagttcatgagccttcacggccgctggcagtttcaa < 4:61597‑M2/140‑110 (MQ=255) ccgccAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCtggcggcaatcgcggcgcgcaggcgctcagccacatcatgagccaaggacacggacagtgccttggcatccgccagttcatgagccttcacggccgctggcagtttcaa > 3:61597‑M2/1‑31 (MQ=255) cgccAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGc > 6:188972/1‑148 (MQ=255) gccAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCaa > 5:216916/1‑149 (MQ=255) cAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAg > 2:250699/1‑91 (MQ=255) ggCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGc < 5:188972/149‑1 (MQ=255) ggCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGc < 4:308902/149‑1 (MQ=255) ggCAGGCCTGTGGGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGc < 8:73272/149‑1 (MQ=255) ggCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCTAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCctgc > 7:108932/1‑149 (MQ=255) gCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCctgct > 2:80866/1‑149 (MQ=255) gCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCctgct < 8:83904/149‑1 (MQ=255) cTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTgg < 6:47494/95‑1 (MQ=255) cTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTgg > 5:47494/1‑95 (MQ=255) tgtgGTGTTGTCtggcggcaatcgcggcgcgcaggcgctcagccacatcatgagccaaggacacggacagtgccttggcatccgccagttcatgagccttcacggccgctggcagtttcaattcagatatccccataccacgccctc > 2:268948‑M2/1‑12 (MQ=255) tgtgGTGTTGTCTGGCGGCCGCTGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCCTGCTGGc < 3:294900/147‑1 (MQ=255) gtgtTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCCTGCTGGCCCGTCa > 8:43417/1‑149 (MQ=255) gttgtCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCCTGCTGGCCCGTCAcc > 3:70471/1‑149 (MQ=255) | GGATATCTGAATTGAAACTGCCAGCGGCCGTGAAGGCTCATGAACTGGCGGATGCCAAGGCACTGTCCGTGTCCTTGGCTCATGATGTGGCTGAGCGCCTGCGCGCCGCGATTGCCGCCAAGGGGCAGGCCTGTGTGGTGTTGTCTGGCGGCCGCAGCCCGGTGCCGTTCCTGGAGAAACTGGCCAGCGAGCACCTGGACTGGGCCAAGGTCACTGTCAGCCTGGCTGATGAGCGCTGGGTGCCGGTGGAGCACGCCGACAGCAATGCCGGCCTGCTGGCCCGTCACC > NC_002947/1167076‑1167363 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |