New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1375310 | 51 (0.990) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 6.3% | coding (930/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
? | NC_002947 | = 1375342 | 40 (0.800) | coding (962/1911 nt) | kup | potassium transport system protein Kup |
AATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCG > NC_002947/1375194‑1375488 | aaTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGGAATCCGTTGTATCTGCTGGAGCCGGGCTGGGCGCTTCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCAGGGCCACGGTTATCGCCACGCAGGCGGTGATGACCgg > 7:148542/1‑149 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCgg > 7:20978/1‑149 (MQ=255) aaTTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCgg < 6:96053/149‑1 (MQ=255) tttAGTTCGGCCAGGGTGGATTGCTGCTGCAAATCCCGGAGGCCGCGCTCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGATGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCgg < 4:40065/147‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCtt > 4:176089/1‑149 (MQ=255) gggTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGa < 8:234740/149‑1 (MQ=255) cATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGc < 6:250348/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGc > 2:157114/1‑148 (MQ=255) ttGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGc > 4:142247/1‑147 (MQ=255) gctgcAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCa > 7:126840/1‑149 (MQ=255) cAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCACAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATcc < 5:331549/148‑1 (MQ=255) aaCCCTGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCAGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCt < 8:278895/149‑1 (MQ=255) ccGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTggg > 8:99345/1‑149 (MQ=255) cgcgctCACTCCGTTCTATCTGCTCGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCCTGGCCTCGGTTCTCGCCGCGCTGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTc < 8:148542/149‑1 (MQ=255) gcgcgcAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTcc > 6:337121/1‑149 (MQ=255) gcgcAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCcgc < 7:52726/149‑1 (MQ=255) tCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGc < 1:157114/149‑1 (MQ=255) gTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATg > 7:197149/1‑145 (MQ=255) tCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAg < 7:99345/148‑1 (MQ=255) tCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCGGCGGCCGTTGGTCGGTCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTc < 8:269857/146‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCcgc > 5:231754/1‑133 (MQ=255) ctgctgGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCcgc < 6:231754/133‑1 (MQ=255) ctgGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGc < 3:176089/145‑1 (MQ=255) tgGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACAcc > 2:56670/1‑149 (MQ=255) gcCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGCCCCGCCAGGCCCTCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTc > 3:12222/1‑147 (MQ=255) gcCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGCCCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGGAGATTCAGCACACCTCag > 6:253909/1‑148 (MQ=255) gcCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCaa < 8:20978/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCacac > 6:39200/1‑143 (MQ=255) ccGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCacac < 5:39200/143‑1 (MQ=255) tGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGcgac > 6:270236/1‑147 (MQ=255) gctgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCacac < 7:91800/129‑1 (MQ=255) gctgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCacac > 8:91800/1‑129 (MQ=255) ctgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAgggg < 8:197149/147‑1 (MQ=255) ctgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAgggg > 7:187796/1‑147 (MQ=255) ctgcCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGc < 8:126840/148‑1 (MQ=255) gTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGc < 8:293136/110‑1 (MQ=255) tGGACACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATAATCCGCGCATGCAGATTCAGCACACATCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGTTGCg > 4:182464/1‑149 (MQ=255) ccaTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAAc < 7:116091/149‑1 (MQ=255) aTGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccg < 3:228595‑M2/147‑110 (MQ=255) tGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccgaag < 1:312100‑M2/149‑113 (MQ=255) gCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccgaagt < 2:12157‑M2/148‑114 (MQ=255) gCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGAc > 5:89347/1‑149 (MQ=255) cACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGc < 6:89347/149‑1 (MQ=255) ggTTTTCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCAACCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGGGAACTGGAAGCTGa > 2:291369/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGcgac < 3:228672/94‑1 (MQ=255) gCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGcgac > 4:228672/1‑94 (MQ=255) aGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCTAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACTTTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCgtggtg < 5:337121/149‑1 (MQ=255) gCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGtt > 1:266414/1‑149 (MQ=255) tCCGGggccatggtggccagcccgaccaacggcagcagcgcccagcccggcgccagcagatagaacggattgcgcgcggcctccgggttttgcagcagcaatgcaccctggccgaagtaattgagcaccagcgccgggagcaccagga > 1:12157‑M2/1‑5 (MQ=255) ccGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCAt < 5:27648/148‑1 (MQ=255) cGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTAGATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCg < 5:270236/149‑1 (MQ=255) | AATTACTTCGGCCAGGGTGCATTGCTGCTGCAAAACCCGGAGGCCGCGCGCAATCCGTTCTATCTGCTGGCGCCGGGCTGGGCGCTGCTGCCGTTGGTCGGGCTGGCCACCATGGCCACGGTTATCGCCTCGCAGGCGGTGATTTCCGGGGCCTTCTCCCTGACCCGCCAGGCCATCCAGCTGGGCTATATTCCGCGCATGCAGATTCAGCACACCTCAAGCGACGAGCAGGGGCAGATCTACATTGGTGCGGTGAACTGGACGCTGATGGTGGGCGTGGTGTTGCTGGTCATCG > NC_002947/1375194‑1375488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |