| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2306873 = | 95 (1.840) | 5 (0.100) | 5/250 | NT | 5.6% | coding (757/1077 nt) | PP_2029 | von Willebrand factor type A domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | 2306910 = | 77 (1.550) | coding (720/1077 nt) | PP_2029 | von Willebrand factor type A domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTGGCTCCAGCTGGTCGAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCTTTGTGCCG > NC_002947/2306762‑2307058 | gccaacaacggcgggcagattcacccgctgacagccgcccgcctggcggcccaggaaggcgtgcgcatctacaccctcgatatcggcgccaaccccgaagccagtggcaccCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTggg > 7:90501‑M1/112‑149 (MQ=255) ccaacaacggcgggcagattcacccgctgacagccgcccgcctggcggcccaggaaggcgtgcgcatctacaccatcggtatcggcgccaaccccgaagccagtggcaccCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTgggg > 3:239383‑M1/111‑149 (MQ=255) gCTCCAGCTGGTCGAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGt < 4:95214/148‑1 (MQ=255) tCCAGCTGGTCGAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGc > 8:27015/1‑148 (MQ=255) gCTGGTCGAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTg < 2:229428/149‑1 (MQ=255) tCGAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTc > 3:135172/1‑149 (MQ=255) cGAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGATTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCg > 5:131736/1‑149 (MQ=255) gAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCg < 7:58501/148‑1 (MQ=255) aGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCggg < 7:27015/149‑1 (MQ=255) aGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCggg < 4:191941/149‑1 (MQ=255) aGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCggg < 3:41775/149‑1 (MQ=255) tctCGGCGATAGCGTCCCGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGGGCTGGCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTGGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTg < 5:99815/147‑1 (MQ=255) tCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACt < 6:101776/134‑1 (MQ=255) tCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACt > 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CCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGgcg < 1:165686‑M1/149‑1 (MQ=255) GTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGt < 7:27363‑M1/149‑1 (MQ=255) caggCGCGGGGTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGccgtccg < 8:249900/149‑1 (MQ=255) ctgctcggcctcaacccgagcaggcctggGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGccgtccgt > 2:25974‑M2/30‑149 (MQ=255) gCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGa > 5:232617/1‑149 (MQ=255) 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3:65817/1‑133 (MQ=255) gCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATcagcaccagca > 1:202629/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCAccc > 4:149517/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGc > 7:27366/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCtt < 2:240691/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCttt > 5:313573/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCttt > 2:271187/1‑149 (MQ=255) ctggGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCTTtgt < 4:273345‑M2/145‑1 (MQ=255) ctggGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCTTtgt < 3:149517‑M2/145‑1 (MQ=255) gGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCTTTGTGcc > 4:105788‑M2/2‑149 (MQ=255) ggTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCTTTGTGCCg < 7:274988/149‑1 (MQ=255) | CTGGCTCCAGCTGGTCGAGGGTATCGCCGATAGCGTCCAGTTCGGCGCCGTCATGGGCACGGAAGTAGGCGCCGTGGGTGATGTCGGCAATTTCCTTGAGCGCGGCTTCGTCCAGGTCCAGGCTCGGGTTGAGGCCGAGCAGGCCTGGGGTGCCACTGGCTTCGGGGTTGGCGCCGATACCGATGGTGTAGATGCGCACGCCTTCCTGGGCCGCCAGGCGGGCGGCTGTCAGCGGGTGAATCTGCCCGCCGTTGTTGGCGCCGTCCGTGATCAGCACCAGCACCCGGCTTTGTGCCG > NC_002947/2306762‑2307058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |