New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4731657 | 51 (0.990) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.0% | coding (1104/1224 nt) | sucB | 2‑oxoglutarate dehydrogenase dihydrolipoyltranssuccinylase subunit |
? | NC_002947 | = 4731698 | 47 (0.970) | coding (1063/1224 nt) | sucB | 2‑oxoglutarate dehydrogenase dihydrolipoyltranssuccinylase subunit |
AGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGATGGACAGTTTGCCGTCACGGGC > NC_002947/4731553‑4731839 | aGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGgat > 7:234869‑M2/1‑146 (MQ=255) gCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGgatga > 3:181998‑M2/1‑144 (MQ=255) gggACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGgatgatg > 6:249607‑M2/1‑142 (MQ=255) gggACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGgatgatg > 1:97060‑M2/1‑142 (MQ=255) gACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATAACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGAtgtt < 5:218891/149‑1 (MQ=255) aCGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGAtgttg > 8:121480/1‑149 (MQ=255) aTCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCa > 2:111146/1‑149 (MQ=255) cagcagGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGTCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGcc > 3:232879/1‑147 (MQ=255) tGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGcc > 2:155155/1‑149 (MQ=255) tGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTgcggc > 7:272323/1‑149 (MQ=255) aCCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGcggcgg < 4:199734/149‑1 (MQ=255) ccAGGATGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGGGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCggg < 7:185908/149‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGTCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCggg < 4:232879/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGt > 7:208423/1‑149 (MQ=255) aaGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGAc < 1:23879/149‑1 (MQ=255) ggTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATAATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGa > 2:273025/1‑149 (MQ=255) ccGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCgg < 7:121480/148‑1 (MQ=255) cGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAAGTTCATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCgggg < 1:111146/149‑1 (MQ=255) gCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGt < 5:69789/149‑1 (MQ=255) gCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGt > 2:305608/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGAc < 8:272323/148‑1 (MQ=255) gCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCgag > 2:286414/1‑108 (MQ=255) gCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCgag < 1:286414/108‑1 (MQ=255) cGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACatcatc < 1:305608/149‑1 (MQ=255) cGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGt < 2:6098/149‑1 (MQ=255) cGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGt < 6:249390/149‑1 (MQ=255) gTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGt < 6:313454/149‑1 (MQ=255) tACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACAACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGtt > 6:306172/1‑149 (MQ=255) gACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtggt > 2:289917/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtggt > 5:149028/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtggtga < 5:196817/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtggtgatg < 8:208423/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtggtgatg < 6:149028/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTCATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCAGAGCATGGCGGCCTGCGGCTGGTTGACGATCGGGTTCGACATCATCGAACCGCAGGTGCCACCGTaggagatg > 7:288082/1‑149 (MQ=255) cgcCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtggtgatgg > 2:32585/1‑149 (MQ=255) gcCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtggtgatggt > 8:73426/1‑149 (MQ=255) gTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGgatgatgtacctggcgctgtcgtacgatcaccgcctgatcgacggcaaggaagcggtaaccttcctggtcactatcaagaacctgctggaa > 5:17025‑M2/1‑51 (MQ=255) gTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGgatgatgtacctggcgctgtcgtacgatcaccgcctgatcgacggcaaggaagcggtaaccttcctggtcactatcaagaacctgctggaa < 6:17025‑M2/142‑92 (MQ=255) catcatCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTg < 1:155155/148‑1 (MQ=255) atcatcGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGc > 1:12332/1‑148 (MQ=255) tcatcGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCa > 2:281017/1‑149 (MQ=255) tcGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGgatgatgtacctggcgctgtcgtacgatcaccgcctgatcgacggcaaggaagcggtaaccttcctggtcactatcaagaacctgctggaagatccgtcccgcctg < 3:37510‑M2/149‑107 (MQ=255) cGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCg < 1:281017/148‑1 (MQ=255) ggCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGGGATGGTGAAGGTGCCACCGGt > 5:22174/1‑148 (MQ=255) cGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCAt < 7:73426/149‑1 (MQ=255) aaTCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCAGGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCAtct < 8:233976/149‑1 (MQ=255) cGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTc > 4:216873/1‑148 (MQ=255) gACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGa > 1:113438/1‑149 (MQ=255) aCCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGAt < 1:32585/149‑1 (MQ=255) cATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtg < 7:85910/107‑1 (MQ=255) cATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTtg > 8:85910/1‑107 (MQ=255) aTTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGATGGACAGtt < 1:273025/149‑1 (MQ=255) gATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGATGGACAGTTTGc > 4:116378/1‑149 (MQ=255) tGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGATGGACAGTTTGcc < 1:289917/148‑1 (MQ=255) cATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGATGGACAGTTTGCCGTCAc < 5:306172/149‑1 (MQ=255) gggCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGATGGACAGTTTGCCGTCACGGGc < 2:12332/149‑1 (MQ=255) | AGGCGGGACGGATCTTCCAGCAGGTTCTTGATAGTGACCAGGAAGGTTACCGCTTCCTTGCCGTCGATCAGGCGGTGATCGTACGACAGCGCCAGGTACATCATCGGGCGAATCACGACCTGGCCATTGATGGCCATCGGGCGCTGGATGATGTTGTGCATGCCGAGAATGGCGGCCTGCGGCGGGTTGACGATCGGGGTCGACATCATCGAACCGAAGGTGCCACCGTTGGTGATGGTGAAGGTGCCACCGGTCATCTCTTCGATGGACAGTTTGCCGTCACGGGC > NC_002947/4731553‑4731839 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |