New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6015200 | 44 (0.850) | 5 (0.100) | 5/244 | NT | 11.9% | coding (565/1860 nt) | PP_5266 | acetyl‑CoA hydrolase family protein |
? | NC_002947 | = 6015290 | 33 (0.680) | coding (475/1860 nt) | PP_5266 | acetyl‑CoA hydrolase family protein |
ATCGATGGGCAGCTCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCGCTGTGCAGCAGGCTGCCGGGCT > NC_002947/6015147‑6015436 | aTCGATGGGCAGCTCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggt < 5:158701‑M2/149‑6 (MQ=255) aTCGATGGGCAGCTCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggt > 1:52309‑M2/1‑144 (MQ=255) aTCGATGGGCAGCGCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggt > 4:7326‑M2/1‑144 (MQ=255) gATGGGCAGCTCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggtgca < 5:133805‑M2/149‑9 (MQ=255) ggCAGCTCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACggg < 5:152724/149‑1 (MQ=255) gCAGCTCGGCATCGCCTGGCATGCAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGc < 7:169113/149‑1 (MQ=255) aGCTCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCCATCATCGGCAGCAGGACGAGGGTGATGACTGGGTTGCAGCCCAGGCTCAGGTCCACGGCCtt > 7:133866/1‑149 (MQ=255) ggCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGTCGCTTGGCTATCATCGGCAGCAGGTCGAGGTTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCgg < 6:241269/149‑1 (MQ=255) cATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCgggg < 2:172398/149‑1 (MQ=255) aTCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCggggg > 1:226525/1‑149 (MQ=255) cATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGcca < 3:298445/149‑1 (MQ=255) gCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTgg < 6:158701/149‑1 (MQ=255) ttCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTa > 3:240759/1‑149 (MQ=255) tCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTAt > 8:42460/1‑149 (MQ=255) gCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggtgcatgccgaactgccctacatgccaggcgatgccgagctgcc < 3:18036‑M2/148‑48 (MQ=255) gCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAg < 6:110966/149‑1 (MQ=255) gaCCTGGGCCAGCTTGAGGATGGTTTCGGCTGCAGCGCTGGGCTTGGCGATGATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGGTGAGGTTCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGttt < 8:133866/146‑1 (MQ=255) ccTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAgg > 4:314479/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggtgcatgccgaactgccctacatgccaggcgatgccgagctg < 2:127972‑M2/136‑46 (MQ=255) ggCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggtgcatgccgaactgccctacatgccaggcgatgccgagctg > 1:127972‑M2/1‑91 (MQ=255) cccAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggtgcatgccgaactgccctacatgccaggcgatgccgagctgcccatcgatgccttc < 1:213572‑M2/149‑61 (MQ=255) aTGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGtt < 4:169640/149‑1 (MQ=255) aGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGa > 1:129328/1‑148 (MQ=255) gCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTgcgg > 4:113425/1‑149 (MQ=255) gCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTgcgg > 4:262118/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTgcggc < 4:240759/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTgcggcg > 5:249059/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTgg < 2:226525/149‑1 (MQ=255) cggcgCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTcaggtgcatgccgaactgccctacatgccaggcgatgccgagctgcccatcgatgccttcgacctgctgctcgatgaagtcgagcaacgt > 2:213572‑M2/1‑59 (MQ=255) gcTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTg > 1:117809/1‑116 (MQ=255) gcTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTg < 2:117809/116‑1 (MQ=255) tGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTgg > 2:248570/1‑137 (MQ=255) tGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTgg < 1:248570/137‑1 (MQ=255) tGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTtgctg > 8:278919/1‑149 (MQ=255) agcagGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCctg < 3:314479/149‑1 (MQ=255) gTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCt < 7:92841/92‑1 (MQ=255) gTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCt > 8:92841/1‑92 (MQ=255) gTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTggg > 4:318230/1‑149 (MQ=255) aTGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCGCt < 7:278919/149‑1 (MQ=255) tGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCGCtg < 6:133805/149‑1 (MQ=255) tGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCGCtgtg > 2:69247/1‑147 (MQ=255) aggccaggcTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCATCTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCGCTGTGCAGCAGGCTg > 1:232153/1‑149 (MQ=255) caggcTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCg > 5:297174/1‑130 (MQ=255) caggcTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCg < 6:297174/130‑1 (MQ=255) gcTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCGCTGTGCAGCAGGCTGCCGGGCt > 3:51545/1‑149 (MQ=255) | ATCGATGGGCAGCTCGGCATCGCCTGGCATGTAGGGCAGTTCGGCATGCACCTGGCCCAGCATGAGGATGGTTTCGCCTGCAGCGCGGCGCTTGGCGATCATCGGCAGCAGGTCGAGGGTGATGTCTGGGTTGCAGGCCAGGCTCAGGTGCACGGGCTTTTCGGGGGTGGCGGCCACCAACTGGGCTATCAGGTTCAGGCCCTTGGCGTTGATATCACGTGCGGCGTGGCTGTAGTTGCTGCTGACGTAGTCCTGCTGGGCCGATTCGCTGTGCAGCAGGCTGCCGGGCT > NC_002947/6015147‑6015436 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |