Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,137,331 | T→G | 7.2% | K91Q (AAG→CAG) | PP_4522 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,137,331 | 0 | T | G | 7.2% | 213.8 / 7.6 | 69 | K91Q (AAG→CAG) | PP_4522 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/30); new base G (2/3); total (36/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.80e-01 |
GGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGG > NC_002947/5137192‑5137476 | gggCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTGAAGggcgaa < 7:27586/149‑3 (MQ=255) ggCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAgg > 4:223875/1‑143 (MQ=255) ggCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAgg < 3:223875/143‑1 (MQ=255) ggCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTGAAGggcgaac < 4:295240/149‑4 (MQ=255) gCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTGGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTGAAGggcgaact < 5:266261/149‑5 (MQ=255) gCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGggcggcgg < 8:306355/149‑1 (MQ=255) gACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGCCGGCGGCATa > 2:203786/1‑149 (MQ=255) gACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGGTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATa > 3:48713/1‑149 (MQ=255) acacCGATAGATGCAGGAGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATAc > 3:184686/1‑149 (MQ=255) aTAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGggcggcg > 1:166007/1‑137 (MQ=255) aTAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGggcggcg < 2:166007/137‑1 (MQ=255) gATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGaaa < 3:202209/149‑1 (MQ=255) ggTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTc > 3:260901/1‑148 (MQ=255) gTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTc > 7:48319/1‑147 (MQ=255) tGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAg > 4:269760/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGGGTGATCCTGGCTGTAGGCACCGATGGATTCTGCCAACGGCAAGGCGCGTTCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCATGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTc < 2:193926/149‑1 (MQ=255) gccgGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGc < 4:260901/149‑1 (MQ=255) gTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCg < 2:168886/142‑1 (MQ=255) gTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCg > 1:168886/1‑142 (MQ=255) gTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCcagca < 4:111074/149‑1 (MQ=255) tGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCcagcag > 6:243227/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGACAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCCTACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGgcg > 3:50690/1‑149 (MQ=255) tAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTc > 8:184740/1‑149 (MQ=255) gCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCt > 2:14137/1‑148 (MQ=255) gCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCt > 3:300998/1‑148 (MQ=255) gCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTg < 1:221376/149‑1 (MQ=255) aCCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGAt < 2:63853/149‑1 (MQ=255) aCCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGAt < 4:184686/149‑1 (MQ=255) ccGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATg < 5:243227/149‑1 (MQ=255) ggCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGc < 1:203786/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTg < 4:300998/149‑1 (MQ=255) aaGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTACCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGt < 1:187722/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTc < 1:14137/149‑1 (MQ=255) ggCGCTATCACCGACGGTGGAGGCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCa < 7:269617/149‑1 (MQ=255) ggCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGt > 7:36701/1‑147 (MQ=255) gcgcGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAg > 1:293024/1‑149 (MQ=255) gcgATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGc < 3:269760/149‑1 (MQ=255) cgATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCt > 8:18286/1‑149 (MQ=255) tCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑aa < 8:2159/122‑1 (MQ=255) tCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑aa > 7:2159/1‑122 (MQ=255) tCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGaa < 3:216368/149‑1 (MQ=255) ccGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑cc > 2:90993/1‑149 (MQ=255) cGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑ccc > 3:19796/1‑149 (MQ=255) ggTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑ccccccc < 2:293024/149‑1 (MQ=255) aGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑GACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑ccccccccgacc > 1:92684/1‑144 (MQ=255) gATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGAt < 4:266935/101‑1 (MQ=255) gATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGAt > 3:266935/1‑101 (MQ=255) tCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTg < 7:184740/149‑1 (MQ=255) aCCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCCCGACCCCGGTgg < 4:48713/149‑1 (MQ=255) cccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGca > 6:120323/1‑148 (MQ=255) cccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑CCCCCCCGACCCCGGTGGcac > 3:54258/1‑148 (MQ=255) cAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCacaa > 8:72149/1‑149 (MQ=255) aGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCacaaca < 7:72149/149‑1 (MQ=255) ggTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAacac > 3:188281/1‑149 (MQ=255) gTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGCAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAacac < 1:90993/149‑1 (MQ=255) gTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGCCCCCGGTGGCACACCACg > 4:306428/1‑149 (MQ=255) ttGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGa > 4:235325/1‑149 (MQ=255) gggTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATAcc > 8:301885/1‑149 (MQ=255) gggTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATAcc < 8:48319/149‑1 (MQ=255) ccACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGCCCCCGGTGGCACAACCCGATACCCAAgg > 5:12747/1‑149 (MQ=255) cACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGgc < 3:235325/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGgcg > 5:157995/1‑149 (MQ=255) gCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGcc > 8:173657/1‑149 (MQ=255) ccgccGCCCTGAAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCt > 5:129635/5‑149 (MQ=255) cgccGCCCTGAAGGGCGGCGGCAAACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGCCCCCGGTGGCACAACCCGAAACCCAAGGCGCCCTc > 8:186093/4‑149 (MQ=255) cGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAg > 5:219112/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGc < 7:301885/149‑1 (MQ=255) cccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTg > 6:156706/1‑149 (MQ=255) cTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑GACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGC‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 2:92684/149‑1 (MQ=255) | GGGCTGGACACCGATAGATGCAGGTGCACCGCCGGGTGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGG‑AACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑‑CCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGG > NC_002947/5137192‑5137476 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |