Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,140,917 | G→A | 5.7% | I215I (ATC→ATT) | PP_4525 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,140,917 | 0 | G | A | 5.7% | 213.7 / 2.4 | 73 | I215I (ATC→ATT) | PP_4525 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/31); new base A (2/2); total (38/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
GCCAGGTGACCGCCTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGG > NC_002947/5140772‑5141062 | gCCAGGTGACCGCCTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGAtc > 4:84803/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTGACCGCCTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGAtc < 5:65501/149‑1 (MQ=255) ggTGACCGCCTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCa > 8:149636/1‑149 (MQ=255) tGACCGCCTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATc < 5:199467/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGc > 8:206201/1‑149 (MQ=255) cTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAAGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCCTCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACCGGCCCGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGcc > 1:243888/1‑149 (MQ=255) tGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGccc > 5:113563/1‑149 (MQ=255) cGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTcc > 1:43550/1‑134 (MQ=255) cGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTcc < 2:43550/134‑1 (MQ=255) gAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTg > 2:163477/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCAt > 4:50318/1‑146 (MQ=255) aaaGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCAt < 3:50318/146‑1 (MQ=255) aaGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGc < 7:206201/149‑1 (MQ=255) tGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCAGCGACTGGGCCATCATCG‑CACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTatg < 6:232714/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTatgg < 4:230525/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACCCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTatgg < 8:153133/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTatggg > 3:224890/1‑149 (MQ=255) gCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCCCACCCGCGATCACACAGGCAAGCATGCTCTGGTACGACTCGATGGCCATCCCCCGCCCCATGGGCGTatgggcaggg > 8:204954/1‑149 (MQ=255) cACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTatgggcat < 7:165577/140‑1 (MQ=255) cACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTatgggcat > 8:165577/1‑140 (MQ=255) ccTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCTATCTCCATCACCCGCCCCATTGCCGTATGGGCATGGGCATACCAgg < 7:204954/149‑1 (MQ=255) ccTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAgg > 5:24392/1‑149 (MQ=255) cTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGc > 5:213003/1‑149 (MQ=255) cccGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTc > 7:157842/1‑148 (MQ=255) ccGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCa > 3:260864/1‑149 (MQ=255) ccGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCa < 7:149636/149‑1 (MQ=255) cGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCCGCATGCTCTGGTACGCGTCGAGCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGcagc > 4:127262/1‑143 (MQ=255) gATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCAATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGa > 3:183008/1‑149 (MQ=255) gATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCAATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGa > 3:178751/1‑149 (MQ=255) ctCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGAc < 8:138540/148‑1 (MQ=255) tCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACg > 1:124623/1‑149 (MQ=255) aCGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCa > 3:126053/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATg > 3:143531/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATg > 5:273377/1‑149 (MQ=255) gcaggcTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTAc < 3:127262/149‑1 (MQ=255) aggcTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGa < 3:84803/149‑1 (MQ=255) tCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGagcagc < 6:24392/148‑1 (MQ=255) gAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGagca < 1:161485/144‑1 (MQ=255) gAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGagca > 2:161485/1‑144 (MQ=255) gAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCACACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCt > 4:117318/1‑149 (MQ=255) gCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTgg > 6:126348/1‑149 (MQ=255) cATGGAGTGGGCCATCATCGAGACACCCGCACCCGGGTTCAGACAGGCCAGGATGGTCTGGTAGGACTGTATATCCATCTCCCGCGCCTTTGGCGTATGGGCATGGGCATAGCTGGCCTCCAGACGCATGGGGTACTAGCAGCCCttt < 4:260864/148‑3 (MQ=255) cATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGc < 7:51488/149‑1 (MQ=255) gACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGa < 1:163477/148‑1 (MQ=255) ccATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAac < 6:273377/149‑1 (MQ=255) catcatCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAaca > 3:30797/1‑149 (MQ=255) ccACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTat > 7:218515/1‑78 (MQ=255) ccACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTg > 6:136848/1‑149 (MQ=255) acacaCCCTCACCCGAGATCACACAGGCAATCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCACCATTGGCGTat < 8:218515/77‑1 (MQ=255) acccgcacccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCg > 3:139684/1‑149 (MQ=255) cccgcacccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGc < 5:126348/149‑1 (MQ=255) cccgcacccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGc > 1:252762/1‑149 (MQ=255) ccgcacccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGcc < 2:124623/149‑1 (MQ=255) cgcacccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCa < 4:143531/149‑1 (MQ=255) ccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGc > 2:51942/1‑138 (MQ=255) ccgcGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGc < 1:51942/138‑1 (MQ=255) tCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCg < 3:117318/149‑1 (MQ=255) acacaGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGt < 4:139684/149‑1 (MQ=255) cacaGGCCACCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTg < 2:243888/149‑1 (MQ=255) acaGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCAGGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGa < 8:7010/149‑1 (MQ=255) caGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAg > 3:45060/1‑149 (MQ=255) aGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTAccgc > 8:255559/1‑149 (MQ=255) aTGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCgg > 5:49371/1‑149 (MQ=255) aTGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCgg < 4:126053/149‑1 (MQ=255) ggTACGACTCCATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGCCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATCCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTCACCACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGTCGGTGACTACCGCCGGGTGCTCg > 8:14024/1‑149 (MQ=255) gTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTc < 6:213003/147‑1 (MQ=255) gTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACAACGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCgg > 8:179877/1‑149 (MQ=255) gACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCt > 4:314078/1‑118 (MQ=255) gACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCt < 3:314078/118‑1 (MQ=255) aCTCAATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTg < 4:183008/149‑1 (MQ=255) aCTCAATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTg < 4:178751/149‑1 (MQ=255) cTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTgg > 7:101600/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTgg < 4:45060/149‑1 (MQ=255) | GCCAGGTGACCGCCTGATCGAAAGGTGCCTGCAGCGAGTGCACCCTCACCCGATCACGCCCAGGCAGGCTGTCGAGCATCGACTGGGCCATCATCGCCACACCCGCACCCGCGATCACACAGGCCAGCATGCTCTGGTACGACTCGATCTCCATCACCCGCCCCATTGGCGTATGGGCATGGGCATACCAGGCCTCCAGACGCATGCGGTACGAGCAGCCCTGGCGGAAGGTGAACACCGCCTTGCCCGCCACGTCCTTGGCGGTGAGTACCGCCGGGTGCTCGGGGCTGG > NC_002947/5140772‑5141062 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |