Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,272,965 | C→G | 6.2% | L38V (CTA→GTA) | rlmG → | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,272,965 | 0 | C | G | 6.2% | 203.2 / 4.0 | 65 | L38V (CTA→GTA) | rlmG | ribosomal RNA large subunit methyltransferase G |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/33); new base G (2/2); total (29/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.12e-01 |
GCAACGGGCAGTTTCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGG > NC_002947/5272821‑5273112 | gCAACGGGCAGTTTCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTa‑‑‑ca < 3:228647/149‑1 (MQ=255) gCAACGGGCAGTTTCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTa‑‑‑ca < 7:226583/149‑1 (MQ=255) acggCAGTTTCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGAt < 4:275428/147‑1 (MQ=255) ggCAGTTTCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCa < 7:256919/149‑1 (MQ=255) gCAGTTTCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCTACGACCCGTTGGAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGTGTACCTGCTTGCTCAGCTA‑‑‑GAGGATCAg < 8:42104/149‑1 (MQ=255) tttCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGACGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCAc > 3:117239/1‑149 (MQ=255) cccGAGCCAGTCGCCATGCCACTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCAATCCGTAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CAGACGAGTACCTGCTTGCGCAGATA‑‑‑CACGAGCATTCACCCGACGc < 6:26824/149‑1 (MQ=255) cccGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCTAAGTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGc < 8:169241/149‑1 (MQ=255) cccGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGc < 3:192837/149‑1 (MQ=255) ccGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCGTCCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGc < 1:238723/149‑1 (MQ=255) aGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAAt < 8:31606/149‑1 (MQ=255) gCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAAtt < 6:120731/149‑1 (MQ=255) cGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCggg < 6:218595/149‑1 (MQ=255) ccATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGcc > 1:321056/1‑144 (MQ=255) ccATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGcc < 2:321056/144‑1 (MQ=255) cATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTAc > 2:17786/1‑149 (MQ=255) tGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTg < 5:21684/149‑1 (MQ=255) ccccTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGt > 7:225972/1‑149 (MQ=255) gTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTTCTGGTGCTc > 7:67578/1‑148 (MQ=255) ttGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCaa < 3:152647/149‑1 (MQ=255) ccccTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCt > 8:98247/1‑149 (MQ=255) ccccTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCt > 4:230306/1‑149 (MQ=255) cccTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTCCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCat > 6:280319/1‑104 (MQ=255) cTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCg > 5:257429/1‑149 (MQ=255) cGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTTCTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGt < 8:67578/148‑1 (MQ=255) agAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCAAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCATGCACCCGACGCCAATTGACGGCTACTGGTGCTCAATGACAGCTAAGGTGacc > 6:9467/2‑149 (MQ=255) tCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGcc > 3:265225/1‑149 (MQ=255) gACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑g > 3:159549/1‑148 (MQ=255) aCCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑Gc > 2:192177/1‑148 (MQ=255) ccTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCaa < 3:232216/149‑1 (MQ=255) gATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTAGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGcc > 1:135409/1‑149 (MQ=255) aTCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGATTACCTGCTTGCGCAGCTACACCACAATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCaa < 1:267330/148‑1 (MQ=255) cGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTg < 3:230306/148‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa < 2:80122/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAgg > 1:184385/1‑149 (MQ=255) aGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGcc < 8:15131/134‑1 (MQ=255) aGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGcc > 7:15131/1‑134 (MQ=255) gAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCCTGCAAGGCTTGC‑GGCCAggg < 4:117239/149‑3 (MQ=255) ccAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTAGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtg < 2:135409/149‑1 (MQ=255) cAACGACCCGTTGTAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAggtgg < 2:141604/149‑1 (MQ=255) cGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGCTTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCGCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTca < 5:9467/149‑1 (MQ=255) cGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTca < 7:98247/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTcagcag > 8:71265/1‑149 (MQ=255) ccGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGAACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGCCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGCTGCTcagcag > 3:118833/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAg > 6:12638/1‑125 (MQ=255) gTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAg < 5:12638/125‑1 (MQ=255) gCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCTGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGt < 6:257429/148‑1 (MQ=255) gCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGt < 6:150674/148‑1 (MQ=255) aGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGAc < 8:225972/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTCGATGACG‑ACGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑AAAGATCAGGCAACCGACTCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCAGTGAc < 4:265225/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTc > 8:163401/1‑149 (MQ=255) cTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGc < 3:273658/149‑1 (MQ=255) ttCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGGTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCa > 3:224961/1‑125 (MQ=255) ttCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGGTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCa < 4:224961/125‑1 (MQ=255) ccg‑ccgACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa < 7:168556/107‑1 (MQ=255) ccg‑ccgACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCa > 8:168556/1‑107 (MQ=255) ccgACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCAc < 7:163401/149‑1 (MQ=255) gaGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGc > 2:12949/1‑149 (MQ=255) ccTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGCCAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGGAGGTGGTTAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTg > 4:176417/1‑148 (MQ=255) cTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTgg > 2:57559/1‑148 (MQ=255) tGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGa > 2:28117/1‑148 (MQ=255) gcgcaagcAGGTA‑‑‑CTCGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTgggg > 6:160834/7‑133 (MQ=255) gcgcaagcAGGTA‑‑‑CTCGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTgggg < 5:160834/127‑1 (MQ=255) ttGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGaa > 6:153114/1‑146 (MQ=255) gCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTgg > 6:145200/1‑149 (MQ=255) | GCAACGGGCAGTTTCGTACCCGAGCCAGACGCCATGCCCCTGTTGACCACCCCCTACGCCGAACTCGACCTGATCCGCCAGCCGGAGCAGGCCAACGACCCGTTGCAGGCCTTCGATGCCG‑CCGACGAGTACCTGCTTGCGCAGCTA‑‑‑CACGATCAGGCACCCGACGCCAATTGCCGGGTACTGGTGCTCAATGACAGCTTCGGTGCCCTGGCC‑GCAAGCCTTGCAGGCCAGCTGCAGGTGGTCAGCAGCGGTGACTCGCACCTGGGGCACCTGGCCCTGGAAAAGAACCTGG > NC_002947/5272821‑5273112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |