| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,791,129 | T→C | 5.9% | I197V (ATC→GTC) ‡ | hemE ← | uroporphyrinogen decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,791,129 | 0 | T | C | 5.9% | 198.2 / 2.3 | 68 | I197V (ATC→GTC) ‡ | hemE | uroporphyrinogen decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/34); new base C (2/2); total (32/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.89e-01 | |||||||||||
ACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTCCACG > NC_002947/5790984‑5791275 | aCCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCt < 2:117353/148‑1 (MQ=255)aCCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCt < 4:158252/148‑1 (MQ=255)aCCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTg > 6:311236/1‑149 (MQ=255) ccGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGTTCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGCACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTgg < 8:134646/149‑1 (MQ=255) cGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGc > 6:233726/1‑149 (MQ=255) cGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGc > 4:58667/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGATCCTGGCCggcg < 4:35799/149‑4 (MQ=255) catGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTaa < 8:290624/147‑1 (MQ=255) cTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGTGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGtt > 4:11595/1‑147 (MQ=255) cTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGtt > 3:215744/1‑147 (MQ=255) cccTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCt < 5:326884/149‑1 (MQ=255) ccTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑g < 2:81870/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGAcc < 5:311236/148‑1 (MQ=255) ggATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTgg < 6:279652/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGc < 1:19102/149‑1 (MQ=255) cGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCGAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTg < 7:211644/149‑1 (MQ=255) gCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGt > 7:48063/1‑149 (MQ=255) cTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGTCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTc > 3:72645/1‑149 (MQ=255) cTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTc < 3:11595/149‑1 (MQ=255) aCGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGTCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGa < 6:192308/131‑1 (MQ=255) aCGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGTCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGa > 5:192308/1‑131 (MQ=255) gATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcag > 7:221481/1‑147 (MQ=255) tCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcagcag > 8:14858/1‑148 (MQ=255) cgcATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTg > 5:8709/1‑149 (MQ=255) gcATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGc < 8:150851/149‑1 (MQ=255) cATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCa < 2:310094/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCa > 4:203952/1‑121 (MQ=255) gCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCa < 3:203952/121‑1 (MQ=255) ggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGt > 4:107211/1‑149 (MQ=255) ggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGt > 2:285575/1‑149 (MQ=255) cTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCg > 1:19780/1‑148 (MQ=255) tCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCg > 2:314126/1‑147 (MQ=255) tCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCg > 8:259577/1‑147 (MQ=255) gATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGc > 3:111342/1‑148 (MQ=255) gccgccgccGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGc > 4:283864/1‑149 (MQ=255) gccgccgccGACAGGTTGCCGCCCAAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCA‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTGCAGCAGCAGGTGGCGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGc > 7:49490/1‑149 (MQ=255) ccgccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACTGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCAGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTAGTAGGCCATGGcc > 2:313313/1‑149 (MQ=255) ccgccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATg > 8:236862/1‑146 (MQ=255) ccgccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATg < 7:236862/146‑1 (MQ=255) ccgccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGcc > 6:170543/1‑149 (MQ=255) ccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTc < 4:215744/149‑1 (MQ=255) aCAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGTCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTg < 4:72645/149‑1 (MQ=255) ccgccCCAGTGGGCGAAGTTCTGTTCGGCCTGGGCGGCGGCCAGGTTCTGGCCGTTATGGTTTCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGGTGCATGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCTTAGGTTATGGCCTTTGTCTTGCGGATGTc < 8:49490/149‑1 (MQ=255) ccccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCTTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCtt > 8:194875/1‑149 (MQ=255) cccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTc < 1:314126/149‑1 (MQ=255) cccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTc < 7:259577/149‑1 (MQ=255) cccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTc < 7:14858/149‑1 (MQ=255) gtgtCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTcgac > 7:97465/1‑147 (MQ=255) gAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAgccgc < 1:193847/149‑1 (MQ=255) aTCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTc > 6:280751/1‑149 (MQ=255) tACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGAcc < 1:285575/148‑1 (MQ=255) tACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCa > 8:23182/1‑149 (MQ=255) tACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCAGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCg < 4:145140/145‑1 (MQ=255) aCGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTc > 1:229742/1‑144 (MQ=255) aCGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTc < 2:229742/143‑1 (MQ=255) cGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCCACCATg > 4:322496/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgta < 5:280751/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtag < 2:19780/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtagg < 5:233726/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtagg < 3:283864/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCATAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtagg < 8:48063/149‑1 (MQ=255) cttaacGGCCAGATCCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGTAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtaggtag > 6:75895/6‑149 (MQ=255) ttaacGGCCAGATCCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgta < 7:260524/139‑1 (MQ=255) ttaacGGCCAGATCCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgta > 8:260524/5‑143 (MQ=255) gcgcCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGc < 6:8709/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAgg < 7:194875/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAggg < 1:313313/149‑1 (MQ=255) gATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTCCACg > 5:164738/1‑149 (MQ=255) | ACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCT‑GGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTCCACG > NC_002947/5790984‑5791275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |