Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,896,312 | A→G | 5.8% | intergenic (‑137/+48) | cysU ← / ← sbp‑II | sulfate ABC transporter permease CysT/sulfate ABC transporter substrate‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,896,312 | 0 | A | G | 5.8% | 249.4 / 3.1 | 85 | intergenic (‑137/+48) | cysU/sbp‑II | sulfate ABC transporter permease CysT/sulfate ABC transporter substrate‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/43); new base G (2/3); total (39/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.80e-01 |
CGCGACATAAATATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGT > NC_002947/5896168‑5896460 | cgcgACATAAATATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGTCGCTTCCACAAGGAACCATGATCTCCTGTGGGAGCGGCCtt < 7:164869/149‑1 (MQ=21) cgcgACATAAATATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCtt < 3:302772/149‑1 (MQ=255) gcgACATAAATATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTtg > 1:196349/1‑149 (MQ=255) aCATAAATATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGc < 5:334683/149‑1 (MQ=255) aTAAATATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCcg > 5:138748/1‑149 (MQ=255) aaTATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCcgcg > 1:139473/1‑148 (MQ=255) tCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATgg < 8:232723/149‑1 (MQ=255) ccTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTGTGGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGCCCCCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATggg > 1:259434/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGc > 8:100124/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGcc > 2:195424/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGAACATGGTTCCTTGTGGAAGCGAc > 5:279120/1‑130 (MQ=255) cTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGAACATGGTTCCTTGTGGAAGCGAc < 6:279120/130‑1 (MQ=255) gTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑c < 1:250412/148‑1 (MQ=255) gAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATggg < 6:266860/141‑1 (MQ=255) gAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATggg > 5:266860/1‑141 (MQ=255) aaCGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CAcgc < 1:195424/148‑1 (MQ=255) aCGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCgg < 6:138748/149‑1 (MQ=255) gCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGcc > 4:131305/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCt > 6:81615/1‑149 (MQ=255) cccGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTc > 1:294843/1‑149 (MQ=255) cccGGAAACAATCCCCGGCCGGTGAAAGCTTTTGAATCCTG‑TAGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAAGCCCCACCCACATGACAACATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCCGCCCCGCATTc > 2:121246/1‑149 (MQ=255) ggAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCtt < 7:55487/149‑1 (MQ=255) gAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCttt > 4:171746/1‑149 (MQ=255) acacTCCCGGGCCGGGGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGgc < 7:229077/149‑1 (MQ=255) aaTCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATAATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGgcgc > 2:316024/1‑149 (MQ=255) aTCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCt < 7:174459/149‑1 (MQ=255) ccGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGgcgc > 3:78662/1‑145 (MQ=255) ccGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGgcgc < 4:78662/145‑1 (MQ=255) cGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTC‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGAGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCATTCCTTTGGCGCTTACt > 5:145460/1‑149 (MQ=255) gggCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACtg > 2:101349/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACtgt < 1:308399/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACtgt < 3:168122/149‑1 (MQ=255) gTGCAAGCTTTTGAAACCTG‑GGGCTGCTTGCCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCCTGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTg < 6:104202/149‑1 (MQ=255) cAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGGTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTTGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGAt < 1:121246/148‑1 (MQ=255) cAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGAt < 2:139473/148‑1 (MQ=255) cTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATc < 7:100124/149‑1 (MQ=255) ttttGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCt > 4:250329/1‑149 (MQ=255) ttttGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCt > 1:101851/1‑149 (MQ=255) ttGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTg < 3:149020/148‑1 (MQ=255) aaTCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTc > 1:236148/1‑148 (MQ=255) tCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGaa < 2:236148/149‑1 (MQ=255) ggCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACAcc < 2:294843/149‑1 (MQ=255) gCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCAtt > 5:326109/1‑149 (MQ=255) cAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGGCCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTAATGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCAtt > 1:120316/1‑148 (MQ=255) cAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTgg < 5:272847/128‑1 (MQ=255) aGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCAtt < 8:53442/147‑1 (MQ=255) aGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCAtt > 7:53442/1‑147 (MQ=255) aGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTga < 3:297548/149‑1 (MQ=255) gCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTgaa < 3:171746/149‑1 (MQ=255) gCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTgaa < 3:108373/149‑1 (MQ=255) cATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTc > 5:247808/1‑125 (MQ=255) cATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTc < 6:247808/125‑1 (MQ=255) ttCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAAtt > 2:324062/1‑149 (MQ=255) gcgACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTc < 1:101349/148‑1 (MQ=255) gcgACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTc < 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cGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTTCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCt > 1:92635/1‑149 (MQ=255) cTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTc > 1:59158/1‑149 (MQ=255) ccACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTccac > 4:191090/1‑149 (MQ=255) cacaGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACATTGTGCCGCGAATGGGCAG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTccacc > 1:145022/1‑149 (MQ=255) acaGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTccaccc < 8:286664/149‑1 (MQ=255) aGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTccacccac > 4:242577/1‑149 (MQ=255) aTGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTcc < 3:250329/149‑1 (MQ=255) tGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTccaccca < 6:61655/139‑1 (MQ=255) tGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTccaccca > 5:61655/1‑139 (MQ=255) ttCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGt < 2:101851/149‑1 (MQ=255) 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gtgGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTTCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATg < 2:92635/148‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAATGGGCTGCCAAGCAGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATg < 6:257411/148‑1 (MQ=38) gAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCa > 7:308176/1‑149 (MQ=255) aaGCGAGCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGATTTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCAc < 6:326109/149‑1 (MQ=255) aaGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCAc < 3:191090/149‑1 (MQ=255) aaGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCAc > 7:32788/1‑149 (MQ=255) aGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTcc < 1:298331/134‑1 (MQ=255) aGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTcc > 2:298331/1‑134 (MQ=255) cGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAg < 8:111862/149‑1 (MQ=255) gACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAgg > 3:218423/1‑149 (MQ=255) aCCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGt > 6:288008/1‑149 (MQ=255) | CGCGACATAAATATCCCTGGTTGAACGCACTAAGCCCGGAAACAATCCCGGGCCGGTGCAAGCTTTTGAATCCTG‑GGGCTGCTTGGCAGCCCATTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGATCATGGTTCCTTGTGGAAGCGACCTTGTGCCGCGAATGGGCCG‑CACGCGGCCCCGCTTTCCTTTGGCGCTTACTGTGCCTGATAGATCTGGTCGAACACACCGCCATCATTGAAGAATTTCGGTTGTGCAGTCTTCCACCCACCAAAGTCCTTGTCGATGGTCACCAGGT > NC_002947/5896168‑5896460 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |